150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0815 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0815  TRAG family protein  100 
 
 		 648 aa  1329    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.805111  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0365  TRAG protein  44.25 
 
 		 661 aa  439  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00756366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0821  TRAG family protein  46.63 
 
 		 673 aa  394  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.153462  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2519  TRAG family protein  40 
 
 		 625 aa  367  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166499  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1805  TRAG family protein  32.14 
 
 		 598 aa  212  2e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18910  type IV secretory pathway, VirD4 component  29.2 
 
 		 627 aa  196  8.000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.755696  normal  0.106526 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0788  TRAG family protein  30.87 
 
 		 590 aa  186  8e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1362  TRAG family protein  29.25 
 
 		 663 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.824009  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1502  TRAG family protein  30.6 
 
 		 610 aa  178  3e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.343787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2467  TRAG family protein  28.51 
 
 		 511 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.606871  hitchhiker  0.00000000721319 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1405  TRAG family protein  27.33 
 
 		 827 aa  156  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0976  TRAG family protein  25.19 
 
 		 912 aa  143  8e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0843  TRAG family protein  27.94 
 
 		 682 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0918  TRAG family protein  30.51 
 
 		 677 aa  139  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3153  TRAG family protein  28.37 
 
 		 762 aa  128  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28380  type IV secretory pathway, VirD4 component  28.29 
 
 		 445 aa  115  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.125371 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0739  type IV secretion system component VirD4  26.11 
 
 		 641 aa  102  2e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6215  TRAG family protein  25.23 
 
 		 902 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.371474 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0018  type IV secretion system component VirD4  26.79 
 
 		 723 aa  101  3e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.512537  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1514  TRAG family protein  25.69 
 
 		 606 aa  101  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2618  conjugal transfer coupling protein TraG  26.75 
 
 		 687 aa  100  8e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2025  conjugal transfer coupling protein TraG  26.74 
 
 		 678 aa  100  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2738  TRAG family protein  26.28 
 
 		 606 aa  100  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0040  type IV secretion system component VirD4  26.56 
 
 		 714 aa  100  1e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4368  TRAG family protein  25.63 
 
 		 713 aa  99.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.538935 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0142  conjugal transfer coupling protein TraG  25.6 
 
 		 674 aa  98.2  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0247  putative type IV secretory pathway protein VirD4  25.06 
 
 		 648 aa  96.3  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.865084 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7438  conjugal transfer coupling protein TraG  24.55 
 
 		 660 aa  96.7  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291662  normal  0.932105 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3157  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  26.44 
 
 		 332 aa  96.7  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.104836  normal  0.929615 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0172  TRAG family protein  24.1 
 
 		 594 aa  96.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.218422 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0458  putative type IV secretory pathway protein VirD4  25 
 
 		 593 aa  95.1  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5823  TRAG family protein  25.49 
 
 		 651 aa  94.7  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2530  TRAG family protein  24.89 
 
 		 661 aa  94.4  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.684984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0320  conjugal transfer coupling protein TraG  26.51 
 
 		 661 aa  92.8  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0236522  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2348  conjugal transfer coupling protein TraG  24.64 
 
 		 669 aa  92.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.801098 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2793  TRAG protein  25.66 
 
 		 661 aa  92  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0977234  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5000  TRAG family protein  24.65 
 
 		 670 aa  91.7  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3084  conjugal transfer coupling protein TraG  24.4 
 
 		 661 aa  91.7  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.847978  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0162  hypothetical protein  25.85 
 
 		 633 aa  91.3  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0008  type IV secretion system component VirD4  25.45 
 
 		 648 aa  90.9  6e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.325178  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2647  putative Type IV secretory pathway protein VirD4  24.63 
 
 		 576 aa  90.9  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3849  conjugal transfer coupling protein TraG  24.35 
 
 		 664 aa  91.3  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00986433  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1493  conjugal transfer coupling protein TraG  24.63 
 
 		 700 aa  90.9  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00200644  normal  0.246461 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0593  TRAG protein  21.73 
 
 		 575 aa  90.5  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9810  conjugative coupling protein  23.08 
 
 		 699 aa  90.1  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2451  TRAG family protein  24.66 
 
 		 559 aa  89.7  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.885622  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0180  hypothetical protein  26.04 
 
 		 633 aa  89.4  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3903  conjugal transfer coupling protein TraG  25.74 
 
 		 665 aa  89.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3689  conjugal transfer coupling protein TraG  25.05 
 
 		 676 aa  89.4  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2002  conjugal transfer coupling protein TraG  24.14 
 
 		 665 aa  89  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0417239  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3825  conjugal transfer coupling protein TraG  25.93 
 
 		 666 aa  88.6  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1970  TRAG family protein  22.41 
 
 		 580 aa  88.2  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0701  conjugal transfer coupling protein TraG  25.38 
 
 		 661 aa  87.8  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0262  TRAG family protein  25.12 
 
 		 809 aa  87.8  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.963876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3193  conjugal transfer coupling protein TraG  24.62 
 
 		 661 aa  87.4  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0684551  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1699  TraG/TraD family protein  25.4 
 
 		 834 aa  87.4  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2344  conjugal transfer coupling protein TraG  25.78 
 
 		 723 aa  87.4  8e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.743545  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0751  conjugal transfer coupling protein TraG  25.43 
 
 		 661 aa  87  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1398  TRAG family protein  25.4 
 
 		 828 aa  87  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.277319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1764  putative type IV secretory pathway protein VirD4  24.26 
 
 		 575 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347607  normal  0.197247 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0589  conjugal transfer coupling protein TraG  25 
 
 		 659 aa  86.7  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6396  TRAG family protein  22.32 
 
 		 699 aa  86.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.969912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1196  conjugal transfer coupling protein TraG  23.83 
 
 		 663 aa  86.3  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0400673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3539  conjugal transfer coupling protein TraG  23.83 
 
 		 663 aa  86.3  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4007  conjugal transfer coupling protein TraG  23.17 
 
 		 659 aa  86.3  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4169  TRAG protein  23.97 
 
 		 678 aa  83.2  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3356  conjugal transfer coupling protein TraG  24.79 
 
 		 666 aa  83.2  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.456046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2327  conjugal transfer coupling protein TraG  24.43 
 
 		 662 aa  82.8  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.58309  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0686  conjugal transfer coupling protein TraG  23.92 
 
 		 756 aa  82.8  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0515  conjugal transfer coupling protein TraG  25.22 
 
 		 662 aa  82  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.246818  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5019  TRAG family protein  19.92 
 
 		 758 aa  82.4  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7739  conjugal transfer coupling protein TraG  24.78 
 
 		 661 aa  82.4  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.477093 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4554  TRAG family protein  23.42 
 
 		 695 aa  82.4  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2876  conjugal transfer coupling protein TraG  25.22 
 
 		 662 aa  82  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6525  conjugal transfer coupling protein TraG  26.88 
 
 		 637 aa  81.6  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.646585  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3006  conjugal transfer coupling protein TraG  24.68 
 
 		 663 aa  81.6  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6612  conjugal transfer coupling protein TraG  26.88 
 
 		 637 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1733  conjugal transfer coupling protein TraG  23.06 
 
 		 660 aa  81.3  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0968  conjugal transfer coupling protein TraG  24.03 
 
 		 666 aa  80.9  0.00000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4317  conjugal transfer coupling protein TraG  27.14 
 
 		 634 aa  80.9  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.184857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6838  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  25.41 
 
 		 633 aa  79.7  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00343153  normal  0.0724614 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0680  agrobacteirum virulence protein VirD4  25.43 
 
 		 554 aa  80.1  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1185  TRAG family protein  23.54 
 
 		 630 aa  80.1  0.0000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6495  TRAG family protein  23.74 
 
 		 583 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1023  conjugal transfer coupling protein TraG  23.97 
 
 		 660 aa  79.3  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4715  conjugal transfer coupling protein TraG  25.11 
 
 		 626 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1649  TRAG family protein  23.48 
 
 		 823 aa  77.8  0.0000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0025  conjugal transfer coupling protein TraG  23.39 
 
 		 645 aa  77  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000549825  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0894  TRAG family protein  22.98 
 
 		 627 aa  76.3  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2256  conjugal transfer coupling protein TraG  23.26 
 
 		 573 aa  75.9  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4192  TRAG family protein  23.97 
 
 		 570 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3323  TRAG family protein  23.97 
 
 		 570 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2818  conjugal transfer coupling protein TraG  23.19 
 
 		 660 aa  74.3  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.443273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3794  TRAG protein  23.53 
 
 		 668 aa  73.2  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2248  conjugal transfer coupling protein TraG  24.21 
 
 		 644 aa  73.2  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4843  TRAG protein  23.91 
 
 		 557 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3988  TRAG family protein  23.14 
 
 		 670 aa  71.2  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.420427  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3655  TRAG family protein  23.14 
 
 		 667 aa  70.1  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.291322  decreased coverage  0.00000244512 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a021  conjugal transfer protein TraG/VirD4  23.51 
 
 		 598 aa  69.3  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4975  TRAG family protein  23.53 
 
 		 560 aa  68.2  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24546  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>