120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6838 on replicon NC_013732
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013732  Slin_6838  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  100 
 
 		 633 aa  1318    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00343153  normal  0.0724614 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4381  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  33.18 
 
 		 662 aa  256  1.0000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0399338  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3564  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  32.13 
 
 		 662 aa  248  2e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6700  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  31.42 
 
 		 685 aa  244  3e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.170783 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3760  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  31.01 
 
 		 658 aa  234  4.0000000000000004e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.195316  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1490  TraG family protein  33.07 
 
 		 669 aa  233  9e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.179815 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3019  hypothetical protein  35.69 
 
 		 694 aa  232  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0886  hypothetical protein  29.48 
 
 		 597 aa  210  6e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.309534 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5456  transfer complex protein TrsK-like protein  24.53 
 
 		 638 aa  90.1  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5695  transfer complex protein TrsK-like protein  24.53 
 
 		 638 aa  90.1  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.604846 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0023  transfer complex protein TrsK-like  22.64 
 
 		 588 aa  80.1  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0815  TRAG family protein  25.41 
 
 		 648 aa  79.7  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.805111  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0044  hypothetical protein  22.4 
 
 		 608 aa  75.5  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.612223  normal  0.249044 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3886  transfer complex protein TrsK-like protein  21.67 
 
 		 569 aa  73.9  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2469  transfer complex protein TrsK-like protein  21.67 
 
 		 569 aa  73.9  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0805174 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2519  TRAG family protein  23.29 
 
 		 625 aa  70.9  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166499  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1687  putative type IV secretory pathway VirD4 components  24.09 
 
 		 784 aa  63.9  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00283538  normal  0.176159 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0365  TRAG protein  23.47 
 
 		 661 aa  62.4  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00756366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2490  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  22.36 
 
 		 629 aa  57.4  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1185  TRAG family protein  22.6 
 
 		 630 aa  57.4  0.0000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0788  TRAG family protein  23.95 
 
 		 590 aa  57.4  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1026  hypothetical protein  28.24 
 
 		 657 aa  56.6  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.272564 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1362  TRAG family protein  23.3 
 
 		 663 aa  56.6  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.824009  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0008  type IV secretion system component VirD4  21.67 
 
 		 648 aa  55.8  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.325178  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3006  conjugal transfer coupling protein TraG  22.84 
 
 		 663 aa  56.6  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0739  type IV secretion system component VirD4  20.61 
 
 		 641 aa  55.1  0.000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4169  TRAG protein  23.84 
 
 		 678 aa  55.1  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1649  TRAG family protein  22.81 
 
 		 823 aa  54.7  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0262  TRAG family protein  26.52 
 
 		 809 aa  54.3  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.963876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1398  TRAG family protein  26.02 
 
 		 828 aa  54.3  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.277319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2467  TRAG family protein  25.41 
 
 		 511 aa  54.3  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.606871  hitchhiker  0.00000000721319 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1699  TraG/TraD family protein  26.02 
 
 		 834 aa  54.3  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3905  hypothetical protein  24.94 
 
 		 760 aa  53.9  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1514  TRAG family protein  26.62 
 
 		 606 aa  53.9  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0652  putative type IV secretory pathway VirD4 components  31.73 
 
 		 602 aa  53.5  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1548  conjugal transfer coupling protein TraG  22.65 
 
 		 664 aa  53.5  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.11101  normal  0.84656 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2002  conjugal transfer coupling protein TraG  23.62 
 
 		 665 aa  53.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0417239  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3193  conjugal transfer coupling protein TraG  24.9 
 
 		 661 aa  53.5  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0684551  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1339  conjugal transfer coupling protein TraG  22.77 
 
 		 664 aa  52.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.953058  normal  0.786812 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0894  TRAG family protein  23.13 
 
 		 627 aa  52.8  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0821  TRAG family protein  25.14 
 
 		 673 aa  53.1  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.153462  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0018  type IV secretion system component VirD4  22.81 
 
 		 723 aa  52.4  0.00003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.512537  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1821  putative type IV secretory pathway VirD4 component  23.87 
 
 		 565 aa  52  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.49149 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0040  type IV secretion system component VirD4  22.8 
 
 		 714 aa  52.4  0.00003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0440  conjugal transfer coupling protein TraG  23.89 
 
 		 673 aa  52  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35740  conjugal transfer coupling protein TraG  22.65 
 
 		 666 aa  52  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3548  conjugal transfer coupling protein TraG  23.59 
 
 		 664 aa  52  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30960  conjugal transfer coupling protein TraG  22.65 
 
 		 666 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501937  unclonable  1.70004e-21 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1280  conjugal transfer coupling protein TraG  22.33 
 
 		 665 aa  51.6  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0724  conjugal transfer coupling protein TraG  22.65 
 
 		 668 aa  51.6  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3689  conjugal transfer coupling protein TraG  25.51 
 
 		 676 aa  51.6  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4592  type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  22.6 
 
 		 708 aa  51.6  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3708  conjugal transfer coupling protein TraG  22.65 
 
 		 669 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2348  conjugal transfer coupling protein TraG  22.65 
 
 		 669 aa  51.2  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.801098 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3903  conjugal transfer coupling protein TraG  23.92 
 
 		 665 aa  50.8  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1502  TRAG family protein  22.82 
 
 		 610 aa  50.8  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.343787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2913  conjugal transfer coupling protein TraG  22.65 
 
 		 665 aa  50.8  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2618  conjugal transfer coupling protein TraG  23.61 
 
 		 687 aa  50.4  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4515  type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  24.32 
 
 		 708 aa  50.4  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1893  conjugal transfer coupling protein TraG  23.57 
 
 		 670 aa  50.4  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2122  TraG family protein  22.43 
 
 		 464 aa  50.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2586  conjugal transfer coupling protein TraG  22.98 
 
 		 675 aa  49.7  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4193  conjugal transfer coupling protein TraG  22.33 
 
 		 663 aa  50.4  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4317  conjugal transfer coupling protein TraG  21.59 
 
 		 634 aa  50.1  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.184857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2352  Sigma 54 interacting domain protein  22.53 
 
 		 672 aa  50.4  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4430  Type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  24.32 
 
 		 708 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3620  TRAG family protein  27.22 
 
 		 896 aa  49.7  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0601306  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4007  conjugal transfer coupling protein TraG  21.81 
 
 		 659 aa  50.4  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4615  type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  24.32 
 
 		 708 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2701  conjugal transfer coupling protein TraG  22.65 
 
 		 669 aa  49.7  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.143285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2256  conjugal transfer coupling protein TraG  22.76 
 
 		 573 aa  50.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2643  conjugal transfer coupling protein TraG  23.15 
 
 		 672 aa  49.7  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_20  conjugative transfer protein TraD  23.7 
 
 		 692 aa  50.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4390  type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  24.32 
 
 		 708 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.734886 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4425  type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  24.32 
 
 		 707 aa  50.4  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.664949 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6525  conjugal transfer coupling protein TraG  21.02 
 
 		 637 aa  49.3  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.646585  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6612  conjugal transfer coupling protein TraG  21.02 
 
 		 637 aa  49.3  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0589  conjugal transfer coupling protein TraG  21.49 
 
 		 659 aa  49.3  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7061  conjugal transfer coupling protein TraG  25.74 
 
 		 655 aa  49.7  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.920891  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0221  TraG/TraD family conjugal transfer protein  27.81 
 
 		 1025 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3356  conjugal transfer coupling protein TraG  23.92 
 
 		 666 aa  48.9  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.456046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1978  hypothetical protein  31.54 
 
 		 504 aa  48.5  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000931909  normal  0.0202481 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6396  TRAG family protein  22.4 
 
 		 699 aa  48.5  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.969912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3508  conjugal transfer coupling protein TraG  22.65 
 
 		 667 aa  48.5  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3084  conjugal transfer coupling protein TraG  24.08 
 
 		 661 aa  48.1  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.847978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0686  conjugal transfer coupling protein TraG  23.2 
 
 		 756 aa  47.8  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2818  conjugal transfer coupling protein TraG  22.07 
 
 		 660 aa  47.8  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.443273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2025  conjugal transfer coupling protein TraG  20.4 
 
 		 678 aa  47.4  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2327  conjugal transfer coupling protein TraG  21.67 
 
 		 662 aa  46.6  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.58309  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1196  conjugal transfer coupling protein TraG  23.89 
 
 		 663 aa  47  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0400673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3539  conjugal transfer coupling protein TraG  23.89 
 
 		 663 aa  47  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0701  conjugal transfer coupling protein TraG  23.89 
 
 		 661 aa  47  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3825  conjugal transfer coupling protein TraG  22.48 
 
 		 666 aa  47  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2344  conjugal transfer coupling protein TraG  25.56 
 
 		 723 aa  47  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.743545  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1023  conjugal transfer coupling protein TraG  23.03 
 
 		 660 aa  47  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9186  conjugal transfer coupling protein TraG  25 
 
 		 656 aa  47  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.995414  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0918  TRAG family protein  22.66 
 
 		 677 aa  46.6  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1316  TRAG family protein  24.1 
 
 		 670 aa  47.4  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0320  conjugal transfer coupling protein TraG  22.86 
 
 		 661 aa  46.2  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0236522  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1833  conjugal transfer coupling protein TraG  22.48 
 
 		 687 aa  46.2  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>