76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_B0023 on replicon NC_007410
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007410  Ava_B0023  transfer complex protein TrsK-like  100 
 
 		 588 aa  1213    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0044  hypothetical protein  72.9 
 
 		 608 aa  803    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.612223  normal  0.249044 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2469  transfer complex protein TrsK-like protein  45.4 
 
 		 569 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0805174 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3886  transfer complex protein TrsK-like protein  45.4 
 
 		 569 aa  507  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5456  transfer complex protein TrsK-like protein  42.81 
 
 		 638 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5695  transfer complex protein TrsK-like protein  42.81 
 
 		 638 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.604846 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5397  hypothetical protein  32.74 
 
 		 562 aa  248  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3019  hypothetical protein  26.18 
 
 		 694 aa  97.1  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3564  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  25.69 
 
 		 662 aa  96.7  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1490  TraG family protein  25.13 
 
 		 669 aa  95.1  3e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.179815 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3760  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  26.81 
 
 		 658 aa  90.1  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.195316  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0886  hypothetical protein  24.44 
 
 		 597 aa  86.3  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.309534 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4381  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  25.07 
 
 		 662 aa  85.5  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0399338  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6700  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  23.85 
 
 		 685 aa  84.7  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.170783 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6838  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  22.64 
 
 		 633 aa  80.5  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00343153  normal  0.0724614 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2467  TRAG family protein  26.42 
 
 		 511 aa  77  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.606871  hitchhiker  0.00000000721319 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0365  TRAG protein  24.02 
 
 		 661 aa  71.2  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00756366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4194  hypothetical protein  25.33 
 
 		 665 aa  70.5  0.00000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0224168 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2352  Sigma 54 interacting domain protein  23.16 
 
 		 672 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2519  TRAG family protein  23.74 
 
 		 625 aa  67.8  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166499  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1405  TRAG family protein  27.12 
 
 		 827 aa  66.2  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3905  hypothetical protein  27.11 
 
 		 760 aa  64.3  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4425  type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  28.67 
 
 		 707 aa  63.5  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.664949 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1026  hypothetical protein  27.1 
 
 		 657 aa  63.5  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.272564 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4615  type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  28.67 
 
 		 708 aa  63.5  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_20  conjugative transfer protein TraD  31.45 
 
 		 692 aa  63.2  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4390  type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  28.67 
 
 		 708 aa  63.5  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.734886 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4592  type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  28.67 
 
 		 708 aa  63.5  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4430  Type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  28.67 
 
 		 708 aa  63.5  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4515  type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  28 
 
 		 708 aa  61.6  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4169  TRAG protein  21.88 
 
 		 678 aa  59.3  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0815  TRAG family protein  23.82 
 
 		 648 aa  58.9  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.805111  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0652  putative type IV secretory pathway VirD4 components  24.56 
 
 		 602 aa  58.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6944  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  20.54 
 
 		 702 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2490  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  30.23 
 
 		 629 aa  57  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6396  TRAG family protein  21.76 
 
 		 699 aa  57  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.969912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3560  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  27.34 
 
 		 604 aa  56.6  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.486257  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0843  TRAG family protein  23.6 
 
 		 682 aa  56.6  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1502  TRAG family protein  30.51 
 
 		 610 aa  55.8  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.343787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1362  TRAG family protein  24.18 
 
 		 663 aa  55.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.824009  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2425  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  26.59 
 
 		 616 aa  55.5  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146549  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0821  TRAG family protein  20.67 
 
 		 673 aa  54.7  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.153462  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4308  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  28.45 
 
 		 840 aa  54.7  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0280519 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0001  type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  25.84 
 
 		 743 aa  54.3  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0076  putative type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  28.47 
 
 		 681 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0031  hypothetical protein  25.45 
 
 		 611 aa  52.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0918  TRAG family protein  22.81 
 
 		 677 aa  50.8  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4554  TRAG family protein  21.61 
 
 		 695 aa  50.8  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9810  conjugative coupling protein  21.78 
 
 		 699 aa  50.4  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1111  type IV secretion system protein VirD4  28.89 
 
 		 509 aa  50.4  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1567  putative type IV secretory pathway VirD4 component  23.08 
 
 		 571 aa  48.9  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0011  conjugal transfer protein TraD  32.47 
 
 		 723 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0976  TRAG family protein  20.53 
 
 		 912 aa  48.9  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1821  putative type IV secretory pathway VirD4 component  27.5 
 
 		 565 aa  48.5  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.49149 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0559  TraG/TraD family membrane protein  31.53 
 
 		 666 aa  47.8  0.0005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1699  TraG/TraD family protein  22.73 
 
 		 834 aa  47.8  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1398  TRAG family protein  22.73 
 
 		 828 aa  47.8  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.277319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0262  TRAG family protein  22.98 
 
 		 809 aa  47.8  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.963876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08203  conjugal transfer protein TraK  34.88 
 
 		 592 aa  47.4  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2738  TRAG family protein  23.15 
 
 		 606 aa  47.4  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0738  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  23.51 
 
 		 557 aa  47.4  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0038  hypothetical protein  22.97 
 
 		 667 aa  47.4  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.140641  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1514  TRAG family protein  22.69 
 
 		 606 aa  47  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5000  TRAG family protein  21.2 
 
 		 670 aa  46.6  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2793  TRAG protein  27.08 
 
 		 661 aa  46.6  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0977234  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1016  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  22.95 
 
 		 602 aa  46.6  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00046304  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0263  conjugal transfer protein  26.45 
 
 		 583 aa  46.6  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0192996  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3982  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  21.26 
 
 		 776 aa  45.8  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2184  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  23.08 
 
 		 798 aa  46.2  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4706  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  23.08 
 
 		 490 aa  45.4  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.220064  normal  0.843758 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2647  putative Type IV secretory pathway protein VirD4  20.98 
 
 		 576 aa  45.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5823  TRAG family protein  32.1 
 
 		 651 aa  45.1  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9186  conjugal transfer coupling protein TraG  22.05 
 
 		 656 aa  44.7  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.995414  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0680  agrobacteirum virulence protein VirD4  23.59 
 
 		 554 aa  44.7  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7061  conjugal transfer coupling protein TraG  27.89 
 
 		 655 aa  44.3  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.920891  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6215  TRAG family protein  21.27 
 
 		 902 aa  44.3  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.371474 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>