202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_0365 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007644  Moth_0365  TRAG protein  100 
 
 
661 aa  1358    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00756366  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0815  TRAG family protein  44.05 
 
 
648 aa  437  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.805111  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0821  TRAG family protein  44.12 
 
 
673 aa  424  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.153462  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2519  TRAG family protein  40.91 
 
 
625 aa  390  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166499  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1805  TRAG family protein  34.57 
 
 
598 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1362  TRAG family protein  32.43 
 
 
663 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.824009  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1405  TRAG family protein  29.87 
 
 
827 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0976  TRAG family protein  27.96 
 
 
912 aa  203  8e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0788  TRAG family protein  29.98 
 
 
590 aa  197  4.0000000000000005e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18910  type IV secretory pathway, VirD4 component  30.35 
 
 
627 aa  192  2e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.755696  normal  0.106526 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2467  TRAG family protein  31.01 
 
 
511 aa  192  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.606871  hitchhiker  0.00000000721319 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1502  TRAG family protein  30.18 
 
 
610 aa  190  5.999999999999999e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.343787  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0843  TRAG family protein  29.89 
 
 
682 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0918  TRAG family protein  25.83 
 
 
677 aa  159  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2738  TRAG family protein  27.11 
 
 
606 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1514  TRAG family protein  27.44 
 
 
606 aa  134  5e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3153  TRAG family protein  26.7 
 
 
762 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28380  type IV secretory pathway, VirD4 component  28.22 
 
 
445 aa  125  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.125371 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3157  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  30.36 
 
 
332 aa  117  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.104836  normal  0.929615 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6396  TRAG family protein  25.91 
 
 
699 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.969912  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9810  conjugative coupling protein  26.12 
 
 
699 aa  114  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0680  agrobacteirum virulence protein VirD4  24.51 
 
 
554 aa  111  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0040  type IV secretion system component VirD4  24.92 
 
 
714 aa  110  9.000000000000001e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4554  TRAG family protein  25.65 
 
 
695 aa  109  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4975  TRAG family protein  25.24 
 
 
560 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24546  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0018  type IV secretion system component VirD4  23.78 
 
 
723 aa  107  7e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.512537  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4169  TRAG protein  25.56 
 
 
678 aa  107  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1185  TRAG family protein  25.42 
 
 
630 aa  104  5e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0593  TRAG protein  24.9 
 
 
575 aa  103  9e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3188  conjugal transfer coupling protein TraG  26 
 
 
669 aa  103  9e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3903  conjugal transfer coupling protein TraG  25.12 
 
 
665 aa  100  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342715  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6559  TRAG family protein  25.12 
 
 
561 aa  100  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2618  conjugal transfer coupling protein TraG  25.49 
 
 
687 aa  100  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0894  TRAG family protein  25.05 
 
 
627 aa  99.8  1e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4436  TRAG protein  26.34 
 
 
714 aa  99  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2913  conjugal transfer coupling protein TraG  23.97 
 
 
665 aa  99  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1493  conjugal transfer coupling protein TraG  27.1 
 
 
700 aa  99  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00200644  normal  0.246461 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3356  conjugal transfer coupling protein TraG  25.21 
 
 
666 aa  99  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.456046  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0142  conjugal transfer coupling protein TraG  25.37 
 
 
674 aa  98.6  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0559  TraG/TraD family membrane protein  21.64 
 
 
666 aa  98.2  4e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2025  conjugal transfer coupling protein TraG  26.28 
 
 
678 aa  98.2  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1833  conjugal transfer coupling protein TraG  25.53 
 
 
687 aa  98.2  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1970  TRAG family protein  23.74 
 
 
580 aa  98.2  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1280  conjugal transfer coupling protein TraG  23.84 
 
 
665 aa  97.1  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0701  conjugal transfer coupling protein TraG  24.95 
 
 
661 aa  97.4  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5823  TRAG family protein  25.39 
 
 
651 aa  97.1  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3708  conjugal transfer coupling protein TraG  23.62 
 
 
669 aa  97.1  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0008  type IV secretion system component VirD4  23.63 
 
 
648 aa  96.7  1e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.325178  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1339  conjugal transfer coupling protein TraG  24.66 
 
 
664 aa  96.7  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.953058  normal  0.786812 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2876  conjugal transfer coupling protein TraG  24.54 
 
 
662 aa  96.3  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1548  conjugal transfer coupling protein TraG  24.27 
 
 
664 aa  95.9  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.11101  normal  0.84656 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2327  conjugal transfer coupling protein TraG  25.96 
 
 
662 aa  96.3  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.58309  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35740  conjugal transfer coupling protein TraG  22.95 
 
 
666 aa  95.9  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2256  conjugal transfer coupling protein TraG  25.21 
 
 
573 aa  95.1  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1196  conjugal transfer coupling protein TraG  25.3 
 
 
663 aa  95.1  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0400673  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3539  conjugal transfer coupling protein TraG  25.3 
 
 
663 aa  95.1  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0751  conjugal transfer coupling protein TraG  26.6 
 
 
661 aa  95.5  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2586  conjugal transfer coupling protein TraG  24.52 
 
 
675 aa  95.1  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30960  conjugal transfer coupling protein TraG  24.06 
 
 
666 aa  95.1  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501937  unclonable  1.70004e-21 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0724  conjugal transfer coupling protein TraG  22.92 
 
 
668 aa  94.7  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5000  TRAG family protein  25.96 
 
 
670 aa  94.7  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2002  conjugal transfer coupling protein TraG  24.3 
 
 
665 aa  94  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0417239  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3849  conjugal transfer coupling protein TraG  25.61 
 
 
664 aa  94  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00986433  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2701  conjugal transfer coupling protein TraG  24.52 
 
 
669 aa  94  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.143285  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0440  conjugal transfer coupling protein TraG  23.37 
 
 
673 aa  93.2  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3006  conjugal transfer coupling protein TraG  24.25 
 
 
663 aa  93.6  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4007  conjugal transfer coupling protein TraG  24.33 
 
 
659 aa  93.2  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2530  TRAG family protein  23.77 
 
 
661 aa  93.2  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.684984  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2348  conjugal transfer coupling protein TraG  24.3 
 
 
669 aa  92.8  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.801098 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1023  conjugal transfer coupling protein TraG  25.26 
 
 
660 aa  92  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3084  conjugal transfer coupling protein TraG  24.33 
 
 
661 aa  92  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.847978  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0247  putative type IV secretory pathway protein VirD4  26.61 
 
 
648 aa  92  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.865084 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3689  conjugal transfer coupling protein TraG  24.64 
 
 
676 aa  92  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1733  conjugal transfer coupling protein TraG  23.44 
 
 
660 aa  92  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2342  TRAG family protein  24.19 
 
 
585 aa  91.7  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.910402  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2643  conjugal transfer coupling protein TraG  24.09 
 
 
672 aa  91.7  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1893  conjugal transfer coupling protein TraG  23.75 
 
 
670 aa  91.7  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3193  conjugal transfer coupling protein TraG  24.95 
 
 
661 aa  91.3  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0684551  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7739  conjugal transfer coupling protein TraG  25.96 
 
 
661 aa  90.9  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.477093 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3508  conjugal transfer coupling protein TraG  24.09 
 
 
667 aa  90.1  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4193  conjugal transfer coupling protein TraG  23.28 
 
 
663 aa  89.7  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0686  conjugal transfer coupling protein TraG  23.77 
 
 
756 aa  90.1  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3988  TRAG family protein  25 
 
 
670 aa  89.4  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.420427  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2248  conjugal transfer coupling protein TraG  24.53 
 
 
644 aa  89.4  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0589  conjugal transfer coupling protein TraG  26.37 
 
 
659 aa  89  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4317  conjugal transfer coupling protein TraG  25.68 
 
 
634 aa  88.6  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.184857  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0515  conjugal transfer coupling protein TraG  26.17 
 
 
662 aa  88.2  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.246818  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6215  TRAG family protein  26.43 
 
 
902 aa  88.2  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.371474 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7438  conjugal transfer coupling protein TraG  25.53 
 
 
660 aa  87.8  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291662  normal  0.932105 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3825  conjugal transfer coupling protein TraG  24.69 
 
 
666 aa  87.8  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3794  TRAG protein  25.79 
 
 
668 aa  87.4  7e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8210  type IV secretion system protein VirD4  24.09 
 
 
663 aa  87  9e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.493038  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0320  conjugal transfer coupling protein TraG  24.28 
 
 
661 aa  87  9e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0236522  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0172  TRAG family protein  25.85 
 
 
594 aa  87  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.218422 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3655  TRAG family protein  25.58 
 
 
667 aa  87  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.291322  decreased coverage  0.00000244512 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2451  TRAG family protein  23.93 
 
 
559 aa  86.7  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.885622  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6525  conjugal transfer coupling protein TraG  25.1 
 
 
637 aa  85.1  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.646585  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0040  cmgD4  25.15 
 
 
603 aa  85.5  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4368  TRAG family protein  27.13 
 
 
713 aa  85.5  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.538935 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1316  TRAG family protein  24.26 
 
 
670 aa  85.1  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>