183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0739 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD0008  type IV secretion system component VirD4  73.68 
 
 		 648 aa  884    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.325178  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0018  type IV secretion system component VirD4  74.43 
 
 		 723 aa  935    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.512537  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0739  type IV secretion system component VirD4  100 
 
 		 641 aa  1319    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0040  type IV secretion system component VirD4  75.47 
 
 		 714 aa  932    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0247  putative type IV secretory pathway protein VirD4  35.79 
 
 		 648 aa  331  3e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.865084 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5000  TRAG family protein  31.94 
 
 		 670 aa  319  1e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5823  TRAG family protein  35.92 
 
 		 651 aa  311  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4368  TRAG family protein  33.83 
 
 		 713 aa  307  5.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.538935 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3548  conjugal transfer coupling protein TraG  32.41 
 
 		 664 aa  280  7e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3084  conjugal transfer coupling protein TraG  33.72 
 
 		 661 aa  277  5e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.847978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3006  conjugal transfer coupling protein TraG  31.37 
 
 		 663 aa  274  3e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1733  conjugal transfer coupling protein TraG  32.75 
 
 		 660 aa  272  2e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2451  TRAG family protein  32.63 
 
 		 559 aa  271  2.9999999999999997e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.885622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3849  conjugal transfer coupling protein TraG  33.8 
 
 		 664 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00986433  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0142  conjugal transfer coupling protein TraG  33.22 
 
 		 674 aa  271  2.9999999999999997e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2025  conjugal transfer coupling protein TraG  33.28 
 
 		 678 aa  271  2.9999999999999997e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1833  conjugal transfer coupling protein TraG  33.16 
 
 		 687 aa  271  2.9999999999999997e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0162  hypothetical protein  33.81 
 
 		 633 aa  271  4e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0180  hypothetical protein  32.73 
 
 		 633 aa  270  5e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7739  conjugal transfer coupling protein TraG  32.11 
 
 		 661 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.477093 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0458  putative type IV secretory pathway protein VirD4  35.12 
 
 		 593 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1280  conjugal transfer coupling protein TraG  32.37 
 
 		 665 aa  267  4e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3188  conjugal transfer coupling protein TraG  33.63 
 
 		 669 aa  267  5e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0320  conjugal transfer coupling protein TraG  33.27 
 
 		 661 aa  266  5.999999999999999e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0236522  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7438  conjugal transfer coupling protein TraG  36.17 
 
 		 660 aa  266  5.999999999999999e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291662  normal  0.932105 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0589  conjugal transfer coupling protein TraG  33.1 
 
 		 659 aa  266  5.999999999999999e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4007  conjugal transfer coupling protein TraG  34.53 
 
 		 659 aa  266  5.999999999999999e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4193  conjugal transfer coupling protein TraG  33.16 
 
 		 663 aa  266  7e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0172  TRAG family protein  34.5 
 
 		 594 aa  266  7e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.218422 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3903  conjugal transfer coupling protein TraG  33.75 
 
 		 665 aa  266  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0515  conjugal transfer coupling protein TraG  33.39 
 
 		 662 aa  266  1e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.246818  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1506  conjugal transfer coupling protein TraG  32.63 
 
 		 661 aa  265  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3689  conjugal transfer coupling protein TraG  33.22 
 
 		 676 aa  265  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0724  conjugal transfer coupling protein TraG  33.27 
 
 		 668 aa  265  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0701  conjugal transfer coupling protein TraG  32.39 
 
 		 661 aa  265  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2327  conjugal transfer coupling protein TraG  31.62 
 
 		 662 aa  265  3e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.58309  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2913  conjugal transfer coupling protein TraG  33.27 
 
 		 665 aa  265  3e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0862  TRAG family protein  32.3 
 
 		 677 aa  264  4.999999999999999e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.777114 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2818  conjugal transfer coupling protein TraG  32.63 
 
 		 660 aa  263  6e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.443273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3193  conjugal transfer coupling protein TraG  32.86 
 
 		 661 aa  263  6e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0684551  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0440  conjugal transfer coupling protein TraG  32.41 
 
 		 673 aa  263  6e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2647  putative Type IV secretory pathway protein VirD4  33.86 
 
 		 576 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0968  conjugal transfer coupling protein TraG  31.76 
 
 		 666 aa  263  8e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3508  conjugal transfer coupling protein TraG  34.61 
 
 		 667 aa  262  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1493  conjugal transfer coupling protein TraG  31.99 
 
 		 700 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00200644  normal  0.246461 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1893  conjugal transfer coupling protein TraG  32.09 
 
 		 670 aa  261  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1196  conjugal transfer coupling protein TraG  34.59 
 
 		 663 aa  261  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0400673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3539  conjugal transfer coupling protein TraG  34.59 
 
 		 663 aa  261  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1548  conjugal transfer coupling protein TraG  33.1 
 
 		 664 aa  261  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.11101  normal  0.84656 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2618  conjugal transfer coupling protein TraG  32.09 
 
 		 687 aa  261  3e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30960  conjugal transfer coupling protein TraG  32.62 
 
 		 666 aa  261  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501937  unclonable  1.70004e-21 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2701  conjugal transfer coupling protein TraG  34.61 
 
 		 669 aa  261  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.143285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0751  conjugal transfer coupling protein TraG  31.76 
 
 		 661 aa  261  3e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5019  TRAG family protein  32.61 
 
 		 758 aa  260  5.0000000000000005e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1023  conjugal transfer coupling protein TraG  34.56 
 
 		 660 aa  260  5.0000000000000005e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6495  TRAG family protein  32.7 
 
 		 583 aa  259  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2876  conjugal transfer coupling protein TraG  34.73 
 
 		 662 aa  259  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2586  conjugal transfer coupling protein TraG  34.32 
 
 		 675 aa  258  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2002  conjugal transfer coupling protein TraG  34.39 
 
 		 665 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0417239  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3708  conjugal transfer coupling protein TraG  33.66 
 
 		 669 aa  259  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2348  conjugal transfer coupling protein TraG  34.18 
 
 		 669 aa  258  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.801098 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2643  conjugal transfer coupling protein TraG  34.45 
 
 		 672 aa  258  3e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3825  conjugal transfer coupling protein TraG  34.16 
 
 		 666 aa  258  3e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35740  conjugal transfer coupling protein TraG  34.53 
 
 		 666 aa  258  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2256  conjugal transfer coupling protein TraG  35.68 
 
 		 573 aa  256  6e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1764  putative type IV secretory pathway protein VirD4  33.18 
 
 		 575 aa  256  7e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347607  normal  0.197247 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4192  TRAG family protein  34.58 
 
 		 570 aa  256  9e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3356  conjugal transfer coupling protein TraG  33.99 
 
 		 666 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.456046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3323  TRAG family protein  33.4 
 
 		 570 aa  253  7e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4843  TRAG protein  33.62 
 
 		 557 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1339  conjugal transfer coupling protein TraG  32.62 
 
 		 664 aa  251  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.953058  normal  0.786812 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1649  TRAG family protein  33.96 
 
 		 823 aa  245  1.9999999999999999e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6143  type IV secretion system protein VirD4  34.05 
 
 		 548 aa  243  6e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8210  type IV secretion system protein VirD4  32.08 
 
 		 663 aa  239  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.493038  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0040  cmgD4  33.2 
 
 		 603 aa  238  3e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2344  conjugal transfer coupling protein TraG  30.22 
 
 		 723 aa  233  1e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.743545  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7522  TRAG family protein  32.65 
 
 		 601 aa  229  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.445518  normal  0.175078 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0170  cmgd4  29.87 
 
 		 658 aa  228  2e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.035471  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2530  TRAG family protein  30.89 
 
 		 661 aa  228  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.684984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0686  conjugal transfer coupling protein TraG  30.53 
 
 		 756 aa  227  4e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4169  TRAG protein  29.83 
 
 		 678 aa  222  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4554  TRAG family protein  30.82 
 
 		 695 aa  219  7.999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1316  TRAG family protein  31.45 
 
 		 670 aa  217  5e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4436  TRAG protein  28.1 
 
 		 714 aa  216  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a021  conjugal transfer protein TraG/VirD4  31.1 
 
 		 598 aa  214  3.9999999999999995e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0262  TRAG family protein  34.22 
 
 		 809 aa  214  4.9999999999999996e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.963876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1398  TRAG family protein  34 
 
 		 828 aa  213  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.277319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1699  TraG/TraD family protein  34 
 
 		 834 aa  212  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6396  TRAG family protein  28.79 
 
 		 699 aa  212  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.969912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0017  conjugal transfer protein TraK  30.05 
 
 		 655 aa  211  4e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9810  conjugative coupling protein  30.34 
 
 		 699 aa  206  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08203  conjugal transfer protein TraK  28.09 
 
 		 592 aa  206  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1185  TRAG family protein  27.11 
 
 		 630 aa  198  3e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6525  conjugal transfer coupling protein TraG  29.49 
 
 		 637 aa  197  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.646585  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0479  TRAG family protein  34.01 
 
 		 531 aa  197  6e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6612  conjugal transfer coupling protein TraG  29.49 
 
 		 637 aa  197  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3794  TRAG protein  30.08 
 
 		 668 aa  195  3e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0023  conjugal transfer protein  26.53 
 
 		 673 aa  194  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3655  TRAG family protein  29.89 
 
 		 667 aa  194  4e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.291322  decreased coverage  0.00000244512 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4317  conjugal transfer coupling protein TraG  29.26 
 
 		 634 aa  194  5e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.184857  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>