156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0170 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0170  cmgd4  100 
 
 		 658 aa  1339    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.035471  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0040  cmgD4  52.39 
 
 		 603 aa  596  1e-169  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a021  conjugal transfer protein TraG/VirD4  52.03 
 
 		 598 aa  598  1e-169  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0047  TraG/TraD family protein  34.54 
 
 		 620 aa  302  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2451  TRAG family protein  38.37 
 
 		 559 aa  300  8e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.885622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0092  TaxB  33.05 
 
 		 611 aa  299  9e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.393332 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6334  TRAG family protein  32.87 
 
 		 897 aa  288  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0172  TRAG family protein  35.16 
 
 		 594 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.218422 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0458  putative type IV secretory pathway protein VirD4  34.97 
 
 		 593 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5019  TRAG family protein  36.65 
 
 		 758 aa  279  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1764  putative type IV secretory pathway protein VirD4  34.89 
 
 		 575 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347607  normal  0.197247 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2647  putative Type IV secretory pathway protein VirD4  33.33 
 
 		 576 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6495  TRAG family protein  35.86 
 
 		 583 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3323  TRAG family protein  34.7 
 
 		 570 aa  270  8e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4843  TRAG protein  34.77 
 
 		 557 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0023  conjugal transfer protein  29.43 
 
 		 673 aa  266  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4192  TRAG family protein  34.7 
 
 		 570 aa  266  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5823  TRAG family protein  30.66 
 
 		 651 aa  258  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08203  conjugal transfer protein TraK  33.81 
 
 		 592 aa  258  3e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0862  TRAG family protein  32.94 
 
 		 677 aa  251  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.777114 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0247  putative type IV secretory pathway protein VirD4  33.27 
 
 		 648 aa  242  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.865084 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0017  conjugal transfer protein TraK  33.02 
 
 		 655 aa  239  8e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7522  TRAG family protein  31.05 
 
 		 601 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.445518  normal  0.175078 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0018  type IV secretion system component VirD4  31.22 
 
 		 723 aa  227  5.0000000000000005e-58  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.512537  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0739  type IV secretion system component VirD4  30.82 
 
 		 641 aa  226  8e-58  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0040  type IV secretion system component VirD4  31.06 
 
 		 714 aa  226  1e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4368  TRAG family protein  30.86 
 
 		 713 aa  225  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.538935 
 
 
-
 
NC_002978  WD0008  type IV secretion system component VirD4  31.46 
 
 		 648 aa  221  3e-56  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.325178  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2002  conjugal transfer coupling protein TraG  31.14 
 
 		 665 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0417239  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5000  TRAG family protein  30.83 
 
 		 670 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2348  conjugal transfer coupling protein TraG  29.8 
 
 		 669 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.801098 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3084  conjugal transfer coupling protein TraG  28.23 
 
 		 661 aa  213  9e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.847978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0751  conjugal transfer coupling protein TraG  26.44 
 
 		 661 aa  211  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4007  conjugal transfer coupling protein TraG  29.16 
 
 		 659 aa  211  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3849  conjugal transfer coupling protein TraG  28.1 
 
 		 664 aa  211  5e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00986433  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1196  conjugal transfer coupling protein TraG  29.05 
 
 		 663 aa  206  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0400673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3539  conjugal transfer coupling protein TraG  29.05 
 
 		 663 aa  206  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2876  conjugal transfer coupling protein TraG  28.84 
 
 		 662 aa  206  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2327  conjugal transfer coupling protein TraG  28.26 
 
 		 662 aa  205  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.58309  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4193  conjugal transfer coupling protein TraG  30.72 
 
 		 663 aa  205  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0589  conjugal transfer coupling protein TraG  28.4 
 
 		 659 aa  205  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1280  conjugal transfer coupling protein TraG  29.91 
 
 		 665 aa  204  4e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3193  conjugal transfer coupling protein TraG  29.84 
 
 		 661 aa  204  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0684551  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1506  conjugal transfer coupling protein TraG  28.2 
 
 		 661 aa  203  6e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30960  conjugal transfer coupling protein TraG  30.52 
 
 		 666 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501937  unclonable  1.70004e-21 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3356  conjugal transfer coupling protein TraG  28.79 
 
 		 666 aa  202  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.456046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3708  conjugal transfer coupling protein TraG  30.57 
 
 		 669 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35740  conjugal transfer coupling protein TraG  30.32 
 
 		 666 aa  202  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1893  conjugal transfer coupling protein TraG  30.26 
 
 		 670 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1548  conjugal transfer coupling protein TraG  29.94 
 
 		 664 aa  201  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.11101  normal  0.84656 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0440  conjugal transfer coupling protein TraG  30.52 
 
 		 673 aa  201  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2701  conjugal transfer coupling protein TraG  30.86 
 
 		 669 aa  201  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.143285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2913  conjugal transfer coupling protein TraG  30.08 
 
 		 665 aa  201  3.9999999999999996e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7739  conjugal transfer coupling protein TraG  26.75 
 
 		 661 aa  200  7.999999999999999e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.477093 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3903  conjugal transfer coupling protein TraG  28.34 
 
 		 665 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0724  conjugal transfer coupling protein TraG  29.45 
 
 		 668 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0701  conjugal transfer coupling protein TraG  27.2 
 
 		 661 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3508  conjugal transfer coupling protein TraG  30.32 
 
 		 667 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3689  conjugal transfer coupling protein TraG  27.87 
 
 		 676 aa  198  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2586  conjugal transfer coupling protein TraG  29.74 
 
 		 675 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2643  conjugal transfer coupling protein TraG  27.9 
 
 		 672 aa  197  6e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0142  conjugal transfer coupling protein TraG  28.71 
 
 		 674 aa  196  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1339  conjugal transfer coupling protein TraG  29.94 
 
 		 664 aa  195  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.953058  normal  0.786812 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3188  conjugal transfer coupling protein TraG  28.97 
 
 		 669 aa  196  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2618  conjugal transfer coupling protein TraG  29.09 
 
 		 687 aa  195  3e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0968  conjugal transfer coupling protein TraG  28.94 
 
 		 666 aa  194  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0320  conjugal transfer coupling protein TraG  29.11 
 
 		 661 aa  194  6e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0236522  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1493  conjugal transfer coupling protein TraG  27.41 
 
 		 700 aa  194  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00200644  normal  0.246461 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1733  conjugal transfer coupling protein TraG  27.67 
 
 		 660 aa  193  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0515  conjugal transfer coupling protein TraG  28.63 
 
 		 662 aa  192  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.246818  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7438  conjugal transfer coupling protein TraG  29.5 
 
 		 660 aa  192  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291662  normal  0.932105 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3006  conjugal transfer coupling protein TraG  27.23 
 
 		 663 aa  192  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3825  conjugal transfer coupling protein TraG  25.77 
 
 		 666 aa  191  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2256  conjugal transfer coupling protein TraG  27.57 
 
 		 573 aa  189  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3548  conjugal transfer coupling protein TraG  27.85 
 
 		 664 aa  188  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1023  conjugal transfer coupling protein TraG  28.11 
 
 		 660 aa  188  3e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1833  conjugal transfer coupling protein TraG  28.89 
 
 		 687 aa  188  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2025  conjugal transfer coupling protein TraG  28.43 
 
 		 678 aa  188  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2818  conjugal transfer coupling protein TraG  28.71 
 
 		 660 aa  186  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.443273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0686  conjugal transfer coupling protein TraG  27.02 
 
 		 756 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1316  TRAG family protein  31.12 
 
 		 670 aa  179  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2344  conjugal transfer coupling protein TraG  25.1 
 
 		 723 aa  176  9.999999999999999e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.743545  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2530  TRAG family protein  25.74 
 
 		 661 aa  173  7.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.684984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1185  TRAG family protein  27.91 
 
 		 630 aa  173  1e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0162  hypothetical protein  28.85 
 
 		 633 aa  166  9e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0180  hypothetical protein  28.97 
 
 		 633 aa  166  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0894  TRAG family protein  27.05 
 
 		 627 aa  159  1e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4169  TRAG protein  26.83 
 
 		 678 aa  159  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1649  TRAG family protein  26.74 
 
 		 823 aa  157  8e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4554  TRAG family protein  27.34 
 
 		 695 aa  154  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6143  type IV secretion system protein VirD4  26.72 
 
 		 548 aa  150  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9810  conjugative coupling protein  25.09 
 
 		 699 aa  145  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0680  agrobacteirum virulence protein VirD4  26.98 
 
 		 554 aa  145  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6396  TRAG family protein  25.52 
 
 		 699 aa  144  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.969912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0025  conjugal transfer coupling protein TraG  25.13 
 
 		 645 aa  139  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000549825  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4715  conjugal transfer coupling protein TraG  27.65 
 
 		 626 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6559  TRAG family protein  26.47 
 
 		 561 aa  137  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0479  TRAG family protein  28.27 
 
 		 531 aa  132  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4317  conjugal transfer coupling protein TraG  25.09 
 
 		 634 aa  131  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.184857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0262  TRAG family protein  27.22 
 
 		 809 aa  131  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.963876  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>