187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1185 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1185  TRAG family protein  100 
 
 		 630 aa  1278    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0894  TRAG family protein  87.56 
 
 		 627 aa  1098    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1649  TRAG family protein  34.3 
 
 		 823 aa  316  9.999999999999999e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3708  conjugal transfer coupling protein TraG  34.73 
 
 		 669 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0440  conjugal transfer coupling protein TraG  35.04 
 
 		 673 aa  313  3.9999999999999997e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2701  conjugal transfer coupling protein TraG  34.73 
 
 		 669 aa  314  3.9999999999999997e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.143285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1893  conjugal transfer coupling protein TraG  34.93 
 
 		 670 aa  312  1e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2913  conjugal transfer coupling protein TraG  34.33 
 
 		 665 aa  311  2e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30960  conjugal transfer coupling protein TraG  34.33 
 
 		 666 aa  310  4e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501937  unclonable  1.70004e-21 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3508  conjugal transfer coupling protein TraG  34.53 
 
 		 667 aa  310  5.9999999999999995e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0724  conjugal transfer coupling protein TraG  34.39 
 
 		 668 aa  309  9e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3006  conjugal transfer coupling protein TraG  34.4 
 
 		 663 aa  309  9e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1548  conjugal transfer coupling protein TraG  34.33 
 
 		 664 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.11101  normal  0.84656 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2348  conjugal transfer coupling protein TraG  34.13 
 
 		 669 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.801098 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2586  conjugal transfer coupling protein TraG  33.73 
 
 		 675 aa  306  9.000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1339  conjugal transfer coupling protein TraG  34.33 
 
 		 664 aa  304  4.0000000000000003e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.953058  normal  0.786812 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2002  conjugal transfer coupling protein TraG  33.66 
 
 		 665 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0417239  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3849  conjugal transfer coupling protein TraG  33.33 
 
 		 664 aa  303  8.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00986433  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35740  conjugal transfer coupling protein TraG  33.73 
 
 		 666 aa  303  9e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1280  conjugal transfer coupling protein TraG  34.13 
 
 		 665 aa  301  3e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4193  conjugal transfer coupling protein TraG  33.46 
 
 		 663 aa  301  3e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2643  conjugal transfer coupling protein TraG  34.12 
 
 		 672 aa  301  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2327  conjugal transfer coupling protein TraG  31.74 
 
 		 662 aa  299  1e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.58309  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3356  conjugal transfer coupling protein TraG  30.57 
 
 		 666 aa  298  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.456046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2344  conjugal transfer coupling protein TraG  30.07 
 
 		 723 aa  298  2e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.743545  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4317  conjugal transfer coupling protein TraG  33.76 
 
 		 634 aa  297  4e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.184857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3188  conjugal transfer coupling protein TraG  33.73 
 
 		 669 aa  296  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6525  conjugal transfer coupling protein TraG  34.28 
 
 		 637 aa  295  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.646585  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6612  conjugal transfer coupling protein TraG  34.28 
 
 		 637 aa  295  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2025  conjugal transfer coupling protein TraG  33.73 
 
 		 678 aa  294  4e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0515  conjugal transfer coupling protein TraG  31.43 
 
 		 662 aa  293  6e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.246818  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0142  conjugal transfer coupling protein TraG  34 
 
 		 674 aa  291  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0589  conjugal transfer coupling protein TraG  33.73 
 
 		 659 aa  291  3e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4007  conjugal transfer coupling protein TraG  33.46 
 
 		 659 aa  291  3e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0751  conjugal transfer coupling protein TraG  31.4 
 
 		 661 aa  290  4e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3689  conjugal transfer coupling protein TraG  32.6 
 
 		 676 aa  290  6e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0701  conjugal transfer coupling protein TraG  31.89 
 
 		 661 aa  290  8e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2618  conjugal transfer coupling protein TraG  32.81 
 
 		 687 aa  289  1e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3193  conjugal transfer coupling protein TraG  30.26 
 
 		 661 aa  289  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0684551  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3548  conjugal transfer coupling protein TraG  33.4 
 
 		 664 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3084  conjugal transfer coupling protein TraG  33.66 
 
 		 661 aa  288  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.847978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1833  conjugal transfer coupling protein TraG  33.01 
 
 		 687 aa  288  2.9999999999999996e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1506  conjugal transfer coupling protein TraG  33.6 
 
 		 661 aa  287  4e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2876  conjugal transfer coupling protein TraG  33.4 
 
 		 662 aa  287  5e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2256  conjugal transfer coupling protein TraG  33.47 
 
 		 573 aa  287  5e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0320  conjugal transfer coupling protein TraG  32.21 
 
 		 661 aa  286  8e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0236522  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1733  conjugal transfer coupling protein TraG  30.97 
 
 		 660 aa  286  1.0000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1023  conjugal transfer coupling protein TraG  32.4 
 
 		 660 aa  283  5.000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3903  conjugal transfer coupling protein TraG  29.26 
 
 		 665 aa  283  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1316  TRAG family protein  35.92 
 
 		 670 aa  283  8.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1196  conjugal transfer coupling protein TraG  30 
 
 		 663 aa  282  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0400673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3539  conjugal transfer coupling protein TraG  30 
 
 		 663 aa  282  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3825  conjugal transfer coupling protein TraG  33.27 
 
 		 666 aa  281  3e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7739  conjugal transfer coupling protein TraG  32.6 
 
 		 661 aa  280  4e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.477093 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0686  conjugal transfer coupling protein TraG  29.59 
 
 		 756 aa  280  4e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2530  TRAG family protein  33.64 
 
 		 661 aa  280  8e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.684984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0968  conjugal transfer coupling protein TraG  33.33 
 
 		 666 aa  279  1e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2818  conjugal transfer coupling protein TraG  31.98 
 
 		 660 aa  276  9e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.443273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1493  conjugal transfer coupling protein TraG  31.42 
 
 		 700 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00200644  normal  0.246461 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7438  conjugal transfer coupling protein TraG  31.88 
 
 		 660 aa  272  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291662  normal  0.932105 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2248  conjugal transfer coupling protein TraG  32.72 
 
 		 644 aa  270  5.9999999999999995e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4715  conjugal transfer coupling protein TraG  31.65 
 
 		 626 aa  270  7e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0025  conjugal transfer coupling protein TraG  31.21 
 
 		 645 aa  265  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000549825  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1699  TraG/TraD family protein  35.44 
 
 		 834 aa  256  6e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0262  TRAG family protein  35.23 
 
 		 809 aa  254  4.0000000000000004e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.963876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1398  TRAG family protein  35.31 
 
 		 828 aa  254  5.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.277319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0247  putative type IV secretory pathway protein VirD4  31.3 
 
 		 648 aa  229  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.865084 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5000  TRAG family protein  29.58 
 
 		 670 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0018  type IV secretion system component VirD4  29.22 
 
 		 723 aa  204  4e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.512537  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0040  type IV secretion system component VirD4  29.22 
 
 		 714 aa  204  5e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4368  TRAG family protein  28.5 
 
 		 713 aa  203  9e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.538935 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5160  TRAG family protein  28.34 
 
 		 638 aa  203  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0008  type IV secretion system component VirD4  28.54 
 
 		 648 aa  200  5e-50  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.325178  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0739  type IV secretion system component VirD4  27.11 
 
 		 641 aa  198  3e-49  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0479  TRAG family protein  32.56 
 
 		 531 aa  196  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5823  TRAG family protein  28.29 
 
 		 651 aa  194  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5331  TRAG family protein  27.58 
 
 		 658 aa  194  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.390385 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6143  type IV secretion system protein VirD4  28.74 
 
 		 548 aa  189  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4192  TRAG family protein  29.05 
 
 		 570 aa  188  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2451  TRAG family protein  26.81 
 
 		 559 aa  187  4e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.885622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3323  TRAG family protein  28.84 
 
 		 570 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0862  TRAG family protein  27.11 
 
 		 677 aa  185  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.777114 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4843  TRAG protein  28.69 
 
 		 557 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4975  TRAG family protein  28.54 
 
 		 560 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24546  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6559  TRAG family protein  28.87 
 
 		 561 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0040  cmgD4  26.59 
 
 		 603 aa  182  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0680  agrobacteirum virulence protein VirD4  28.17 
 
 		 554 aa  182  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8210  type IV secretion system protein VirD4  27.92 
 
 		 663 aa  179  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.493038  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6495  TRAG family protein  29.41 
 
 		 583 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0172  TRAG family protein  28.66 
 
 		 594 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.218422 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1764  putative type IV secretory pathway protein VirD4  29.67 
 
 		 575 aa  174  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347607  normal  0.197247 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2647  putative Type IV secretory pathway protein VirD4  28.16 
 
 		 576 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4554  TRAG family protein  28.63 
 
 		 695 aa  172  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4169  TRAG protein  30.39 
 
 		 678 aa  171  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5019  TRAG family protein  29.34 
 
 		 758 aa  170  7e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a021  conjugal transfer protein TraG/VirD4  25.29 
 
 		 598 aa  168  2.9999999999999998e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0170  cmgd4  27.47 
 
 		 658 aa  168  2.9999999999999998e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.035471  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0458  putative type IV secretory pathway protein VirD4  27.56 
 
 		 593 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6396  TRAG family protein  27.04 
 
 		 699 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.969912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2342  TRAG family protein  30.34 
 
 		 585 aa  164  4.0000000000000004e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.910402  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>