175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0821 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0821  TRAG family protein  100 
 
 		 673 aa  1344    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.153462  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0365  TRAG protein  43.66 
 
 		 661 aa  426  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00756366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0815  TRAG family protein  45.59 
 
 		 648 aa  394  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.805111  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2519  TRAG family protein  40 
 
 		 625 aa  348  1e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166499  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1805  TRAG family protein  29.61 
 
 		 598 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0788  TRAG family protein  29.85 
 
 		 590 aa  201  5e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18910  type IV secretory pathway, VirD4 component  30.56 
 
 		 627 aa  197  6e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.755696  normal  0.106526 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1502  TRAG family protein  29.17 
 
 		 610 aa  188  3e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.343787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1362  TRAG family protein  33.5 
 
 		 663 aa  181  4e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.824009  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2467  TRAG family protein  30.05 
 
 		 511 aa  172  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.606871  hitchhiker  0.00000000721319 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1405  TRAG family protein  27.11 
 
 		 827 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0843  TRAG family protein  30.16 
 
 		 682 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0918  TRAG family protein  28.44 
 
 		 677 aa  156  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0976  TRAG family protein  24.76 
 
 		 912 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28380  type IV secretory pathway, VirD4 component  28.45 
 
 		 445 aa  129  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.125371 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3153  TRAG family protein  27.66 
 
 		 762 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9810  conjugative coupling protein  24.43 
 
 		 699 aa  116  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2738  TRAG family protein  27.67 
 
 		 606 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4554  TRAG family protein  25.57 
 
 		 695 aa  108  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3794  TRAG protein  25.66 
 
 		 668 aa  107  6e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0739  type IV secretion system component VirD4  24.14 
 
 		 641 aa  105  2e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6396  TRAG family protein  24.6 
 
 		 699 aa  105  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.969912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0018  type IV secretion system component VirD4  25.75 
 
 		 723 aa  103  1e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.512537  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0040  type IV secretion system component VirD4  25.35 
 
 		 714 aa  103  1e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3655  TRAG family protein  25.44 
 
 		 667 aa  103  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.291322  decreased coverage  0.00000244512 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3988  TRAG family protein  25.25 
 
 		 670 aa  103  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.420427  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1514  TRAG family protein  27.32 
 
 		 606 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4169  TRAG protein  24.52 
 
 		 678 aa  100  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0008  type IV secretion system component VirD4  25.18 
 
 		 648 aa  98.6  3e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.325178  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2530  TRAG family protein  24.43 
 
 		 661 aa  94.7  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.684984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3157  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  27.07 
 
 		 332 aa  94.7  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.104836  normal  0.929615 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5823  TRAG family protein  26.58 
 
 		 651 aa  93.6  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1833  conjugal transfer coupling protein TraG  26.22 
 
 		 687 aa  92  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3625  TRAG family protein  26.26 
 
 		 742 aa  90.9  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0172  TRAG family protein  23.77 
 
 		 594 aa  89.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.218422 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0458  putative type IV secretory pathway protein VirD4  24.78 
 
 		 593 aa  89  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4436  TRAG protein  24.32 
 
 		 714 aa  88.6  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4368  TRAG family protein  24.55 
 
 		 713 aa  88.2  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.538935 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2647  putative Type IV secretory pathway protein VirD4  24.95 
 
 		 576 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1649  TRAG family protein  23.98 
 
 		 823 aa  86.7  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0247  putative type IV secretory pathway protein VirD4  28.45 
 
 		 648 aa  86.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.865084 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1493  conjugal transfer coupling protein TraG  24.46 
 
 		 700 aa  85.9  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00200644  normal  0.246461 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5000  TRAG family protein  27.23 
 
 		 670 aa  86.3  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3188  conjugal transfer coupling protein TraG  25.58 
 
 		 669 aa  85.1  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3620  TRAG family protein  25.86 
 
 		 896 aa  84  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0601306  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6495  TRAG family protein  25.44 
 
 		 583 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1970  TRAG family protein  22.02 
 
 		 580 aa  82.8  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0680  agrobacteirum virulence protein VirD4  25.75 
 
 		 554 aa  82.8  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1764  putative type IV secretory pathway protein VirD4  24.42 
 
 		 575 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347607  normal  0.197247 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0593  TRAG protein  23.48 
 
 		 575 aa  82  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2025  conjugal transfer coupling protein TraG  26.22 
 
 		 678 aa  80.9  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0142  conjugal transfer coupling protein TraG  25.12 
 
 		 674 aa  80.5  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6215  TRAG family protein  25.07 
 
 		 902 aa  79.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.371474 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1023  conjugal transfer coupling protein TraG  25.95 
 
 		 660 aa  79.3  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1280  conjugal transfer coupling protein TraG  24.51 
 
 		 665 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0968  conjugal transfer coupling protein TraG  25.2 
 
 		 666 aa  79.3  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4975  TRAG family protein  25.16 
 
 		 560 aa  78.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1548  conjugal transfer coupling protein TraG  25.06 
 
 		 664 aa  77.4  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.11101  normal  0.84656 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0589  conjugal transfer coupling protein TraG  23.91 
 
 		 659 aa  77.8  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4843  TRAG protein  24.82 
 
 		 557 aa  77.4  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3323  TRAG family protein  24.82 
 
 		 570 aa  77.4  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0724  conjugal transfer coupling protein TraG  24.09 
 
 		 668 aa  77.4  0.0000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0162  hypothetical protein  22.32 
 
 		 633 aa  76.6  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2451  TRAG family protein  23.88 
 
 		 559 aa  77  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.885622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0686  conjugal transfer coupling protein TraG  23.12 
 
 		 756 aa  76.6  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2348  conjugal transfer coupling protein TraG  24.34 
 
 		 669 aa  77  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.801098 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4192  TRAG family protein  24.59 
 
 		 570 aa  77  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2586  conjugal transfer coupling protein TraG  24.84 
 
 		 675 aa  76.3  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0320  conjugal transfer coupling protein TraG  24.54 
 
 		 661 aa  75.9  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0236522  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2002  conjugal transfer coupling protein TraG  24.27 
 
 		 665 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0417239  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5019  TRAG family protein  23 
 
 		 758 aa  75.9  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2913  conjugal transfer coupling protein TraG  24.28 
 
 		 665 aa  75.9  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1733  conjugal transfer coupling protein TraG  24.66 
 
 		 660 aa  75.9  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2618  conjugal transfer coupling protein TraG  24.18 
 
 		 687 aa  75.9  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30960  conjugal transfer coupling protein TraG  25.05 
 
 		 666 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501937  unclonable  1.70004e-21 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3708  conjugal transfer coupling protein TraG  25.06 
 
 		 669 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35740  conjugal transfer coupling protein TraG  24.42 
 
 		 666 aa  75.1  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5331  TRAG family protein  23.9 
 
 		 658 aa  74.7  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.390385 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2793  TRAG protein  25.62 
 
 		 661 aa  73.9  0.000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0977234  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2701  conjugal transfer coupling protein TraG  24.56 
 
 		 669 aa  73.9  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.143285  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0180  hypothetical protein  22.93 
 
 		 633 aa  73.6  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4193  conjugal transfer coupling protein TraG  24.57 
 
 		 663 aa  73.2  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0440  conjugal transfer coupling protein TraG  24.58 
 
 		 673 aa  73.6  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1893  conjugal transfer coupling protein TraG  24.36 
 
 		 670 aa  72.8  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3548  conjugal transfer coupling protein TraG  25.27 
 
 		 664 aa  72.8  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0515  conjugal transfer coupling protein TraG  24.01 
 
 		 662 aa  73.2  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.246818  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3849  conjugal transfer coupling protein TraG  25.61 
 
 		 664 aa  72.8  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00986433  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8210  type IV secretion system protein VirD4  24.23 
 
 		 663 aa  72.4  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.493038  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2344  conjugal transfer coupling protein TraG  23.55 
 
 		 723 aa  72.4  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.743545  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3508  conjugal transfer coupling protein TraG  25.05 
 
 		 667 aa  72.8  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3356  conjugal transfer coupling protein TraG  25.74 
 
 		 666 aa  72.8  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.456046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1699  TraG/TraD family protein  23.94 
 
 		 834 aa  72.4  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2643  conjugal transfer coupling protein TraG  24.42 
 
 		 672 aa  72  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1398  TRAG family protein  23.94 
 
 		 828 aa  72  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.277319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0262  TRAG family protein  23.94 
 
 		 809 aa  72  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.963876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1339  conjugal transfer coupling protein TraG  24.84 
 
 		 664 aa  71.2  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.953058  normal  0.786812 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7438  conjugal transfer coupling protein TraG  24.84 
 
 		 660 aa  70.9  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291662  normal  0.932105 
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0014  conjugation protein  24.04 
 
 		 877 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3903  conjugal transfer coupling protein TraG  25.05 
 
 		 665 aa  70.5  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2342  TRAG family protein  24.52 
 
 		 585 aa  69.3  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.910402  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>