32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3625 on replicon NC_014214
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014214  Mesil_3625  TRAG family protein  100 
 
 		 742 aa  1501    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0509  Type IV secretory pathway VirD4 protein  28.37 
 
 		 789 aa  186  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.453337 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0522  Type IV secretory pathway VirD4 protein  27.92 
 
 		 761 aa  174  3.9999999999999995e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.155716 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2951  ATPase involved in conjugal plasmid transfer TRAG  25.93 
 
 		 935 aa  158  3e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0821  TRAG family protein  26.26 
 
 		 673 aa  90.5  9e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.153462  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2467  TRAG family protein  25.54 
 
 		 511 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.606871  hitchhiker  0.00000000721319 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1805  TRAG family protein  35.66 
 
 		 598 aa  76.3  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0788  TRAG family protein  29.34 
 
 		 590 aa  73.6  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0976  TRAG family protein  23.87 
 
 		 912 aa  73.2  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0365  TRAG protein  24.07 
 
 		 661 aa  73.2  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00756366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1362  TRAG family protein  24.02 
 
 		 663 aa  65.1  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.824009  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1405  TRAG family protein  21.79 
 
 		 827 aa  63.9  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18910  type IV secretory pathway, VirD4 component  27.6 
 
 		 627 aa  64.3  0.000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.755696  normal  0.106526 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4368  TRAG family protein  25.45 
 
 		 713 aa  63.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.538935 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0815  TRAG family protein  25.77 
 
 		 648 aa  61.6  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.805111  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2519  TRAG family protein  24 
 
 		 625 aa  61.2  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166499  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1514  TRAG family protein  22.3 
 
 		 606 aa  58.2  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0843  TRAG family protein  22.53 
 
 		 682 aa  57.4  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1502  TRAG family protein  28.48 
 
 		 610 aa  57.4  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.343787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3157  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  30.56 
 
 		 332 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.104836  normal  0.929615 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2738  TRAG family protein  22.25 
 
 		 606 aa  55.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0018  type IV secretion system component VirD4  22.63 
 
 		 723 aa  51.6  0.00006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.512537  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5000  conjugal transfer coupling protein TraG  23.28 
 
 		 635 aa  51.2  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.763698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28380  type IV secretory pathway, VirD4 component  25 
 
 		 445 aa  49.7  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.125371 
 
 
-
 
NC_002978  WD0008  type IV secretion system component VirD4  22.13 
 
 		 648 aa  50.1  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.325178  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5000  TRAG family protein  30.59 
 
 		 670 aa  49.7  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0040  type IV secretion system component VirD4  22.93 
 
 		 714 aa  48.9  0.0004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0739  type IV secretion system component VirD4  22.38 
 
 		 641 aa  48.5  0.0005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0647  conjugal transfer coupling protein TraG  20.24 
 
 		 637 aa  47  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.600969  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2184  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  23.38 
 
 		 798 aa  46.2  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1023  conjugal transfer coupling protein TraG  25.32 
 
 		 660 aa  44.7  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3794  TRAG protein  24.64 
 
 		 668 aa  44.3  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>