40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3157 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3157  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  100 
 
 		 332 aa  694    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.104836  normal  0.929615 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1805  TRAG family protein  60.26 
 
 		 598 aa  383  1e-105  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18910  type IV secretory pathway, VirD4 component  43.09 
 
 		 627 aa  209  4e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.755696  normal  0.106526 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0788  TRAG family protein  35.39 
 
 		 590 aa  191  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1502  TRAG family protein  35.27 
 
 		 610 aa  171  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.343787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0918  TRAG family protein  38.1 
 
 		 677 aa  171  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0365  TRAG protein  30.36 
 
 		 661 aa  117  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00756366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0815  TRAG family protein  26.44 
 
 		 648 aa  96.7  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.805111  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0821  TRAG family protein  27.07 
 
 		 673 aa  95.9  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.153462  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28380  type IV secretory pathway, VirD4 component  27.69 
 
 		 445 aa  94  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.125371 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0976  TRAG family protein  30.59 
 
 		 912 aa  93.2  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1514  TRAG family protein  28.84 
 
 		 606 aa  84  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1362  TRAG family protein  27.6 
 
 		 663 aa  84  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.824009  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2738  TRAG family protein  30.29 
 
 		 606 aa  82.8  0.000000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1405  TRAG family protein  28.7 
 
 		 827 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2519  TRAG family protein  28.19 
 
 		 625 aa  78.6  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166499  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2467  TRAG family protein  29.05 
 
 		 511 aa  69.7  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.606871  hitchhiker  0.00000000721319 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3153  TRAG family protein  31.18 
 
 		 762 aa  67  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0680  agrobacteirum virulence protein VirD4  23.31 
 
 		 554 aa  60.8  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4975  TRAG family protein  22.47 
 
 		 560 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24546  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6559  TRAG family protein  22.47 
 
 		 561 aa  57  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3625  TRAG family protein  30.56 
 
 		 742 aa  55.8  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0047  TraG/TraD family protein  23.67 
 
 		 620 aa  55.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1185  TRAG family protein  21.99 
 
 		 630 aa  54.7  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0894  TRAG family protein  21.67 
 
 		 627 aa  53.5  0.000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0014  conjugation protein  26.03 
 
 		 877 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2793  TRAG protein  29.46 
 
 		 661 aa  49.3  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0977234  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0843  TRAG family protein  24.38 
 
 		 682 aa  47.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0593  TRAG protein  23.49 
 
 		 575 aa  47.8  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3620  TRAG family protein  22.7 
 
 		 896 aa  47.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0601306  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a021  conjugal transfer protein TraG/VirD4  23.89 
 
 		 598 aa  47.4  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0535  TRAG family protein  23.98 
 
 		 509 aa  47  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.379254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6396  TRAG family protein  23.33 
 
 		 699 aa  46.2  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.969912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8942  conjugative transfer gene complex protein  26.49 
 
 		 613 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.312755  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08203  conjugal transfer protein TraK  22.55 
 
 		 592 aa  44.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9810  conjugative coupling protein  22.73 
 
 		 699 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4169  TRAG protein  20.26 
 
 		 678 aa  43.5  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2451  TRAG family protein  23.72 
 
 		 559 aa  43.1  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.885622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1970  TRAG family protein  24.43 
 
 		 580 aa  43.1  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5521  TRAG family protein  26.38 
 
 		 604 aa  43.1  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.197372  normal  0.646541 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>