153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1405 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0976  TRAG family protein  54.58 
 
 		 912 aa  838    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1405  TRAG family protein  100 
 
 		 827 aa  1700    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2467  TRAG family protein  55.51 
 
 		 511 aa  531  1e-149  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.606871  hitchhiker  0.00000000721319 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1362  TRAG family protein  40.47 
 
 		 663 aa  372  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.824009  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0843  TRAG family protein  35.64 
 
 		 682 aa  270  1e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0365  TRAG protein  29.87 
 
 		 661 aa  214  7e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00756366  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2519  TRAG family protein  26.88 
 
 		 625 aa  159  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166499  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0821  TRAG family protein  27.05 
 
 		 673 aa  159  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.153462  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0815  TRAG family protein  27.33 
 
 		 648 aa  156  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.805111  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1805  TRAG family protein  27.92 
 
 		 598 aa  152  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0918  TRAG family protein  24.91 
 
 		 677 aa  116  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1502  TRAG family protein  27.38 
 
 		 610 aa  106  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.343787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0788  TRAG family protein  27.53 
 
 		 590 aa  105  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1514  TRAG family protein  25.47 
 
 		 606 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2738  TRAG family protein  23.89 
 
 		 606 aa  95.9  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3153  TRAG family protein  28.07 
 
 		 762 aa  94.7  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28380  type IV secretory pathway, VirD4 component  26.93 
 
 		 445 aa  94.4  9e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.125371 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18910  type IV secretory pathway, VirD4 component  22.94 
 
 		 627 aa  89.4  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.755696  normal  0.106526 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4169  TRAG protein  20.49 
 
 		 678 aa  80.5  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4368  TRAG family protein  23.99 
 
 		 713 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.538935 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3157  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  28.7 
 
 		 332 aa  79  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.104836  normal  0.929615 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4672  conjugal transfer coupling protein TraG  22.25 
 
 		 641 aa  74.7  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.811781  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3794  TRAG protein  21.59 
 
 		 668 aa  73.6  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1493  conjugal transfer coupling protein TraG  22.31 
 
 		 700 aa  73.6  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00200644  normal  0.246461 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5517  conjugal transfer coupling protein TraG  23.35 
 
 		 665 aa  73.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0112559 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2530  TRAG family protein  23.06 
 
 		 661 aa  71.6  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.684984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9810  conjugative coupling protein  21.03 
 
 		 699 aa  71.6  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4554  TRAG family protein  22.09 
 
 		 695 aa  71.6  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2451  TRAG family protein  23.06 
 
 		 559 aa  71.6  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.885622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1280  conjugal transfer coupling protein TraG  22.5 
 
 		 665 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6396  TRAG family protein  21.49 
 
 		 699 aa  70.5  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.969912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3655  TRAG family protein  21.38 
 
 		 667 aa  70.9  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.291322  decreased coverage  0.00000244512 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3988  TRAG family protein  21.17 
 
 		 670 aa  69.3  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.420427  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0172  TRAG family protein  23.6 
 
 		 594 aa  68.2  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.218422 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2025  conjugal transfer coupling protein TraG  21.41 
 
 		 678 aa  67.8  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4193  conjugal transfer coupling protein TraG  21.38 
 
 		 663 aa  67.8  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2468  hypothetical protein  36.36 
 
 		 103 aa  67  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000314225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8942  conjugative transfer gene complex protein  25.76 
 
 		 613 aa  67.4  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.312755  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0458  putative type IV secretory pathway protein VirD4  22.7 
 
 		 593 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1548  conjugal transfer coupling protein TraG  21.59 
 
 		 664 aa  66.6  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.11101  normal  0.84656 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30960  conjugal transfer coupling protein TraG  21.8 
 
 		 666 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501937  unclonable  1.70004e-21 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0247  putative type IV secretory pathway protein VirD4  22.49 
 
 		 648 aa  66.2  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.865084 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1893  conjugal transfer coupling protein TraG  21.41 
 
 		 670 aa  66.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0023  transfer complex protein TrsK-like  27.12 
 
 		 588 aa  66.2  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3508  conjugal transfer coupling protein TraG  21.71 
 
 		 667 aa  65.5  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0440  conjugal transfer coupling protein TraG  21.41 
 
 		 673 aa  65.5  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2701  conjugal transfer coupling protein TraG  21.5 
 
 		 669 aa  65.5  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.143285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0025  conjugal transfer coupling protein TraG  23.54 
 
 		 645 aa  65.1  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000549825  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2348  conjugal transfer coupling protein TraG  21.71 
 
 		 669 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.801098 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2647  putative Type IV secretory pathway protein VirD4  22.57 
 
 		 576 aa  65.1  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3708  conjugal transfer coupling protein TraG  21.59 
 
 		 669 aa  64.7  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1833  conjugal transfer coupling protein TraG  22.03 
 
 		 687 aa  65.1  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7061  conjugal transfer coupling protein TraG  21.81 
 
 		 655 aa  64.7  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.920891  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0008  type IV secretion system component VirD4  22.46 
 
 		 648 aa  64.7  0.000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.325178  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4843  TRAG protein  23.81 
 
 		 557 aa  64.3  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9186  conjugal transfer coupling protein TraG  21.88 
 
 		 656 aa  64.3  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.995414  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3323  TRAG family protein  23.81 
 
 		 570 aa  64.3  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4192  TRAG family protein  23.81 
 
 		 570 aa  64.3  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0044  hypothetical protein  26.49 
 
 		 608 aa  63.5  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.612223  normal  0.249044 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3625  TRAG family protein  21.79 
 
 		 742 aa  63.9  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2002  conjugal transfer coupling protein TraG  21.71 
 
 		 665 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0417239  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4436  TRAG protein  22.58 
 
 		 714 aa  63.2  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1339  conjugal transfer coupling protein TraG  21.14 
 
 		 664 aa  63.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.953058  normal  0.786812 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1764  putative type IV secretory pathway protein VirD4  23.15 
 
 		 575 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347607  normal  0.197247 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0724  conjugal transfer coupling protein TraG  21.59 
 
 		 668 aa  62.8  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4317  conjugal transfer coupling protein TraG  24.68 
 
 		 634 aa  62.8  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.184857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2913  conjugal transfer coupling protein TraG  21.38 
 
 		 665 aa  62.8  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1649  TRAG family protein  21.51 
 
 		 823 aa  62.4  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0040  type IV secretion system component VirD4  22 
 
 		 714 aa  62  0.00000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2643  conjugal transfer coupling protein TraG  21.62 
 
 		 672 aa  62  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0018  type IV secretion system component VirD4  22.25 
 
 		 723 aa  61.2  0.00000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.512537  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6612  conjugal transfer coupling protein TraG  23.46 
 
 		 637 aa  61.2  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5396  conjugal transfer coupling protein TraG  22.54 
 
 		 639 aa  60.8  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.457132 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3084  conjugal transfer coupling protein TraG  21.81 
 
 		 661 aa  60.8  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.847978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1185  TRAG family protein  21.76 
 
 		 630 aa  60.5  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7438  conjugal transfer coupling protein TraG  22.25 
 
 		 660 aa  60.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291662  normal  0.932105 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0262  TRAG family protein  21.13 
 
 		 809 aa  60.8  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.963876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6525  conjugal transfer coupling protein TraG  23.75 
 
 		 637 aa  60.1  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.646585  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35740  conjugal transfer coupling protein TraG  21.17 
 
 		 666 aa  59.7  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3886  transfer complex protein TrsK-like protein  22.55 
 
 		 569 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0894  TRAG family protein  21.96 
 
 		 627 aa  59.7  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0680  agrobacteirum virulence protein VirD4  20.33 
 
 		 554 aa  59.7  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6495  TRAG family protein  23.02 
 
 		 583 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2586  conjugal transfer coupling protein TraG  20.96 
 
 		 675 aa  59.3  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3825  conjugal transfer coupling protein TraG  20.4 
 
 		 666 aa  58.9  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1398  TRAG family protein  21.65 
 
 		 828 aa  58.5  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.277319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1699  TraG/TraD family protein  21.65 
 
 		 834 aa  58.5  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4715  conjugal transfer coupling protein TraG  24.21 
 
 		 626 aa  58.5  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3620  TRAG family protein  22.64 
 
 		 896 aa  58.5  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0601306  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2344  conjugal transfer coupling protein TraG  22.2 
 
 		 723 aa  58.2  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.743545  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2469  transfer complex protein TrsK-like protein  22.28 
 
 		 569 aa  57.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0805174 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2818  conjugal transfer coupling protein TraG  23.5 
 
 		 660 aa  57.4  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.443273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2352  Sigma 54 interacting domain protein  29.3 
 
 		 672 aa  57  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0142  conjugal transfer coupling protein TraG  20.56 
 
 		 674 aa  57.4  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3019  hypothetical protein  23.26 
 
 		 694 aa  57  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6559  TRAG family protein  21.63 
 
 		 561 aa  57  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0968  conjugal transfer coupling protein TraG  22.51 
 
 		 666 aa  56.2  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3188  conjugal transfer coupling protein TraG  20.72 
 
 		 669 aa  56.2  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5000  TRAG family protein  21.99 
 
 		 670 aa  56.2  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1316  TRAG family protein  22.33 
 
 		 670 aa  56.6  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>