93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_C0044 on replicon NC_007412
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007410  Ava_B0023  transfer complex protein TrsK-like  69.95 
 
 		 588 aa  817    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0044  hypothetical protein  100 
 
 		 608 aa  1252    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.612223  normal  0.249044 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2469  transfer complex protein TrsK-like protein  42.93 
 
 		 569 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0805174 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3886  transfer complex protein TrsK-like protein  42.98 
 
 		 569 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5695  transfer complex protein TrsK-like protein  43.29 
 
 		 638 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.604846 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5456  transfer complex protein TrsK-like protein  43.29 
 
 		 638 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5397  hypothetical protein  30.92 
 
 		 562 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2467  TRAG family protein  26.65 
 
 		 511 aa  91.3  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.606871  hitchhiker  0.00000000721319 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3019  hypothetical protein  25.81 
 
 		 694 aa  90.9  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1490  TraG family protein  25.26 
 
 		 669 aa  89  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.179815 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4381  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  24.43 
 
 		 662 aa  84.7  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0399338  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3564  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  24.81 
 
 		 662 aa  83.6  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3760  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  23.66 
 
 		 658 aa  82.4  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.195316  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0365  TRAG protein  26.02 
 
 		 661 aa  79.7  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00756366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4169  TRAG protein  23.65 
 
 		 678 aa  78.2  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6838  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  22.4 
 
 		 633 aa  76.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00343153  normal  0.0724614 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6396  TRAG family protein  23.37 
 
 		 699 aa  76.6  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.969912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6700  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  22.66 
 
 		 685 aa  75.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.170783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1026  hypothetical protein  29.19 
 
 		 657 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.272564 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2352  Sigma 54 interacting domain protein  30.67 
 
 		 672 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4194  hypothetical protein  25.62 
 
 		 665 aa  73.2  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0224168 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3905  hypothetical protein  24.81 
 
 		 760 aa  73.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0886  hypothetical protein  22.2 
 
 		 597 aa  70.9  0.00000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.309534 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5000  TRAG family protein  23.2 
 
 		 670 aa  69.3  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_20  conjugative transfer protein TraD  26.63 
 
 		 692 aa  69.3  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0843  TRAG family protein  22.84 
 
 		 682 aa  67  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4390  type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  26.32 
 
 		 708 aa  66.6  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.734886 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4515  type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  26.32 
 
 		 708 aa  66.6  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4425  type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  26.32 
 
 		 707 aa  66.6  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.664949 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4615  type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  26.32 
 
 		 708 aa  66.6  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4592  type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  26.32 
 
 		 708 aa  66.6  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4430  Type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  26.32 
 
 		 708 aa  66.6  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0976  TRAG family protein  24.19 
 
 		 912 aa  65.5  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1398  TRAG family protein  23.4 
 
 		 828 aa  64.7  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.277319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1699  TraG/TraD family protein  23.4 
 
 		 834 aa  64.7  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9810  conjugative coupling protein  23.23 
 
 		 699 aa  63.9  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1405  TRAG family protein  26.49 
 
 		 827 aa  63.5  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4554  TRAG family protein  20.81 
 
 		 695 aa  62.8  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2519  TRAG family protein  24.37 
 
 		 625 aa  62.4  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166499  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4308  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  23.56 
 
 		 840 aa  60.8  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0280519 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0262  TRAG family protein  23.36 
 
 		 809 aa  60.5  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.963876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6215  TRAG family protein  23.49 
 
 		 902 aa  59.3  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.371474 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0031  hypothetical protein  26.76 
 
 		 611 aa  59.7  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0680  agrobacteirum virulence protein VirD4  25.93 
 
 		 554 aa  59.3  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08203  conjugal transfer protein TraK  39.53 
 
 		 592 aa  58.9  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6944  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  21.76 
 
 		 702 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0001  type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  27.37 
 
 		 743 aa  58.5  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0076  putative type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  26.94 
 
 		 681 aa  58.2  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2490  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  27.04 
 
 		 629 aa  57.8  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1821  putative type IV secretory pathway VirD4 component  22.92 
 
 		 565 aa  56.6  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.49149 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0821  TRAG family protein  21.96 
 
 		 673 aa  55.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.153462  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0689  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  28.07 
 
 		 636 aa  55.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.01424  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4706  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  24.28 
 
 		 490 aa  56.2  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.220064  normal  0.843758 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3560  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  31.13 
 
 		 604 aa  55.1  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.486257  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2530  TRAG family protein  25 
 
 		 661 aa  54.7  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.684984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0652  putative type IV secretory pathway VirD4 components  26.79 
 
 		 602 aa  54.3  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1111  type IV secretion system protein VirD4  28.48 
 
 		 509 aa  54.3  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2425  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  26.44 
 
 		 616 aa  53.9  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146549  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1514  TRAG family protein  24.24 
 
 		 606 aa  53.9  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0263  conjugal transfer protein  23.66 
 
 		 583 aa  53.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0192996  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1576  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  24.34 
 
 		 453 aa  52.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540203  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2344  conjugal transfer coupling protein TraG  20.89 
 
 		 723 aa  52  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.743545  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4436  TRAG protein  22.88 
 
 		 714 aa  52  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2246  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  24.94 
 
 		 506 aa  52.4  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0011  conjugal transfer protein TraD  25.16 
 
 		 723 aa  52  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2451  TRAG family protein  20.09 
 
 		 559 aa  52  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.885622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2647  putative Type IV secretory pathway protein VirD4  21.39 
 
 		 576 aa  52  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0247  putative type IV secretory pathway protein VirD4  26.92 
 
 		 648 aa  52  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.865084 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1805  TRAG family protein  21.15 
 
 		 598 aa  51.2  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1016  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  19.35 
 
 		 602 aa  50.8  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00046304  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0862  TRAG family protein  23.54 
 
 		 677 aa  50.4  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.777114 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1567  putative type IV secretory pathway VirD4 component  19.7 
 
 		 571 aa  49.7  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2184  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  22.07 
 
 		 798 aa  49.3  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1502  TRAG family protein  28.12 
 
 		 610 aa  49.7  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.343787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2256  conjugal transfer coupling protein TraG  23.51 
 
 		 573 aa  48.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1185  TRAG family protein  26.81 
 
 		 630 aa  47.8  0.0006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3982  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  20.91 
 
 		 776 aa  47.8  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0047  TraG/TraD family protein  26.59 
 
 		 620 aa  47  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4368  TRAG family protein  23.6 
 
 		 713 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.538935 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4975  TRAG family protein  24.18 
 
 		 560 aa  47  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0739  type IV secretion system component VirD4  20.76 
 
 		 641 aa  47  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2793  TRAG protein  31.78 
 
 		 661 aa  47  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0977234  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0038  hypothetical protein  22.01 
 
 		 667 aa  45.8  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.140641  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0177  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  22.69 
 
 		 578 aa  46.2  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4843  TRAG protein  23.81 
 
 		 557 aa  45.4  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3323  TRAG family protein  23.81 
 
 		 570 aa  45.4  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4192  TRAG family protein  23.81 
 
 		 570 aa  45.4  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0172  TRAG family protein  20.15 
 
 		 594 aa  45.4  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.218422 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5823  TRAG family protein  30.43 
 
 		 651 aa  45.1  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6559  TRAG family protein  30.23 
 
 		 561 aa  44.3  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0559  TraG/TraD family membrane protein  24.23 
 
 		 666 aa  44.3  0.006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0522  Type IV secretory pathway VirD4 protein  23.45 
 
 		 761 aa  44.3  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.155716 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06490  type IV secretory pathway, VirD4 component  24.69 
 
 		 634 aa  43.9  0.009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00928914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>