153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3153 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_3153  TRAG family protein  100 
 
 
762 aa  1590    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1514  TRAG family protein  27.08 
 
 
606 aa  141  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2738  TRAG family protein  28.28 
 
 
606 aa  139  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0365  TRAG protein  27.14 
 
 
661 aa  132  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00756366  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0815  TRAG family protein  26.87 
 
 
648 aa  130  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.805111  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0821  TRAG family protein  27.66 
 
 
673 aa  120  9e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.153462  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2519  TRAG family protein  26.19 
 
 
625 aa  117  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166499  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0843  TRAG family protein  27.96 
 
 
682 aa  115  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0014  conjugation protein  44.96 
 
 
877 aa  110  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1805  TRAG family protein  27.14 
 
 
598 aa  107  8e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2467  TRAG family protein  27.79 
 
 
511 aa  105  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.606871  hitchhiker  0.00000000721319 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0589  conjugal transfer coupling protein TraG  24.44 
 
 
659 aa  104  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1506  conjugal transfer coupling protein TraG  24.79 
 
 
661 aa  102  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4007  conjugal transfer coupling protein TraG  24.64 
 
 
659 aa  102  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1493  conjugal transfer coupling protein TraG  26.43 
 
 
700 aa  100  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00200644  normal  0.246461 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0976  TRAG family protein  27.11 
 
 
912 aa  99.8  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3084  conjugal transfer coupling protein TraG  24.23 
 
 
661 aa  98.2  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.847978  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7739  conjugal transfer coupling protein TraG  24.57 
 
 
661 aa  97.1  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.477093 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3825  conjugal transfer coupling protein TraG  24.19 
 
 
666 aa  96.7  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3193  conjugal transfer coupling protein TraG  26.38 
 
 
661 aa  95.9  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0684551  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1196  conjugal transfer coupling protein TraG  24.95 
 
 
663 aa  96.3  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0400673  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3539  conjugal transfer coupling protein TraG  24.95 
 
 
663 aa  96.3  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1405  TRAG family protein  28.07 
 
 
827 aa  94.7  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3356  conjugal transfer coupling protein TraG  25.61 
 
 
666 aa  93.2  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.456046  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0751  conjugal transfer coupling protein TraG  24.63 
 
 
661 aa  94  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2618  conjugal transfer coupling protein TraG  25.59 
 
 
687 aa  92.8  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0515  conjugal transfer coupling protein TraG  25.39 
 
 
662 aa  91.7  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.246818  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0559  TraG/TraD family membrane protein  24.95 
 
 
666 aa  91.3  6e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3849  conjugal transfer coupling protein TraG  24.6 
 
 
664 aa  90.9  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00986433  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2876  conjugal transfer coupling protein TraG  24.39 
 
 
662 aa  91.3  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2327  conjugal transfer coupling protein TraG  24.83 
 
 
662 aa  90.5  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.58309  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2818  conjugal transfer coupling protein TraG  25.35 
 
 
660 aa  89.4  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.443273  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0788  TRAG family protein  31.67 
 
 
590 aa  89  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8210  type IV secretion system protein VirD4  24.88 
 
 
663 aa  89  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.493038  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1502  TRAG family protein  32 
 
 
610 aa  89  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.343787  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6559  TRAG family protein  23.89 
 
 
561 aa  88.2  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0968  conjugal transfer coupling protein TraG  26.26 
 
 
666 aa  88.2  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3188  conjugal transfer coupling protein TraG  24.62 
 
 
669 aa  87.4  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0142  conjugal transfer coupling protein TraG  24.71 
 
 
674 aa  87  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0701  conjugal transfer coupling protein TraG  25.18 
 
 
661 aa  87  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3903  conjugal transfer coupling protein TraG  24.88 
 
 
665 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342715  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1833  conjugal transfer coupling protein TraG  24.72 
 
 
687 aa  86.3  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0040  type IV secretion system component VirD4  25.47 
 
 
714 aa  85.9  0.000000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3620  TRAG family protein  25.19 
 
 
896 aa  85.9  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0601306  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3548  conjugal transfer coupling protein TraG  23.83 
 
 
664 aa  85.5  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2002  conjugal transfer coupling protein TraG  25 
 
 
665 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0417239  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3689  conjugal transfer coupling protein TraG  24.44 
 
 
676 aa  85.1  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2025  conjugal transfer coupling protein TraG  25.51 
 
 
678 aa  84.7  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0018  type IV secretion system component VirD4  25.65 
 
 
723 aa  84.3  0.000000000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.512537  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35740  conjugal transfer coupling protein TraG  25 
 
 
666 aa  84.3  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6143  type IV secretion system protein VirD4  25.72 
 
 
548 aa  84.3  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1280  conjugal transfer coupling protein TraG  24.72 
 
 
665 aa  84.3  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0320  conjugal transfer coupling protein TraG  25.35 
 
 
661 aa  84  0.000000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0236522  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1893  conjugal transfer coupling protein TraG  25.07 
 
 
670 aa  83.6  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1362  TRAG family protein  24.82 
 
 
663 aa  83.2  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.824009  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5000  TRAG family protein  24.41 
 
 
670 aa  82.8  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3708  conjugal transfer coupling protein TraG  25.91 
 
 
669 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3006  conjugal transfer coupling protein TraG  24.67 
 
 
663 aa  83.2  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0008  type IV secretion system component VirD4  25.46 
 
 
648 aa  82.4  0.00000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.325178  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0440  conjugal transfer coupling protein TraG  25.07 
 
 
673 aa  82.4  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2586  conjugal transfer coupling protein TraG  25.35 
 
 
675 aa  81.6  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0739  type IV secretion system component VirD4  24.74 
 
 
641 aa  82  0.00000000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0724  conjugal transfer coupling protein TraG  25.63 
 
 
668 aa  81.6  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2913  conjugal transfer coupling protein TraG  25.34 
 
 
665 aa  81.6  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18910  type IV secretory pathway, VirD4 component  31.64 
 
 
627 aa  81.6  0.00000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.755696  normal  0.106526 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30960  conjugal transfer coupling protein TraG  24.72 
 
 
666 aa  81.3  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501937  unclonable  1.70004e-21 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1548  conjugal transfer coupling protein TraG  25.63 
 
 
664 aa  80.9  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.11101  normal  0.84656 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1339  conjugal transfer coupling protein TraG  25.63 
 
 
664 aa  80.9  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.953058  normal  0.786812 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28380  type IV secretory pathway, VirD4 component  26.16 
 
 
445 aa  80.9  0.00000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.125371 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1185  TRAG family protein  24.66 
 
 
630 aa  80.1  0.0000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1316  TRAG family protein  24.72 
 
 
670 aa  80.5  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0680  agrobacteirum virulence protein VirD4  25.3 
 
 
554 aa  79.7  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1023  conjugal transfer coupling protein TraG  23.6 
 
 
660 aa  79  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1649  TRAG family protein  23.56 
 
 
823 aa  79  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2701  conjugal transfer coupling protein TraG  24.58 
 
 
669 aa  79  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.143285  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4193  conjugal transfer coupling protein TraG  24.01 
 
 
663 aa  78.2  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2256  conjugal transfer coupling protein TraG  23.72 
 
 
573 aa  78.2  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2348  conjugal transfer coupling protein TraG  25.35 
 
 
669 aa  77.8  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.801098 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7438  conjugal transfer coupling protein TraG  24.32 
 
 
660 aa  77.4  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291662  normal  0.932105 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3508  conjugal transfer coupling protein TraG  25.48 
 
 
667 aa  77  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1398  TRAG family protein  24.26 
 
 
828 aa  76.3  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.277319  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4169  TRAG protein  26.18 
 
 
678 aa  76.6  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1699  TraG/TraD family protein  24.26 
 
 
834 aa  75.9  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4975  TRAG family protein  23.7 
 
 
560 aa  76.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24546  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0262  TRAG family protein  24.49 
 
 
809 aa  75.9  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.963876  normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4317  conjugal transfer coupling protein TraG  25.11 
 
 
634 aa  75.9  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.184857  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4554  TRAG family protein  25.69 
 
 
695 aa  75.9  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1733  conjugal transfer coupling protein TraG  23.36 
 
 
660 aa  75.1  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a021  conjugal transfer protein TraG/VirD4  24.95 
 
 
598 aa  75.1  0.000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5331  TRAG family protein  22.14 
 
 
658 aa  75.1  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.390385 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2643  conjugal transfer coupling protein TraG  24.52 
 
 
672 aa  74.3  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4368  TRAG family protein  23.76 
 
 
713 aa  74.3  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.538935 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3157  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  31.18 
 
 
332 aa  73.9  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.104836  normal  0.929615 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6525  conjugal transfer coupling protein TraG  24.28 
 
 
637 aa  72.8  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.646585  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6612  conjugal transfer coupling protein TraG  24.28 
 
 
637 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4715  conjugal transfer coupling protein TraG  24.17 
 
 
626 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0918  TRAG family protein  23.12 
 
 
677 aa  72.4  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6396  TRAG family protein  24.63 
 
 
699 aa  71.6  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.969912  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9810  conjugative coupling protein  25.12 
 
 
699 aa  71.2  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0894  TRAG family protein  24.66 
 
 
627 aa  71.6  0.00000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>