189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4975 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012854  Rleg_6559  TRAG family protein  88.06 
 
 		 561 aa  981    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4975  TRAG family protein  100 
 
 		 560 aa  1129    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0680  agrobacteirum virulence protein VirD4  67.82 
 
 		 554 aa  746    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6812  hypothetical protein  88.89 
 
 		 192 aa  251  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.269314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3188  conjugal transfer coupling protein TraG  37.31 
 
 		 669 aa  239  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2256  conjugal transfer coupling protein TraG  36.88 
 
 		 573 aa  239  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3548  conjugal transfer coupling protein TraG  37.04 
 
 		 664 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6326  TRAG family protein  33.61 
 
 		 588 aa  236  6e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0142  conjugal transfer coupling protein TraG  36.66 
 
 		 674 aa  235  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1733  conjugal transfer coupling protein TraG  32.66 
 
 		 660 aa  233  5e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1970  TRAG family protein  34.98 
 
 		 580 aa  233  5e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0701  conjugal transfer coupling protein TraG  36.49 
 
 		 661 aa  233  8.000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0320  conjugal transfer coupling protein TraG  36.92 
 
 		 661 aa  233  9e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0236522  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7438  conjugal transfer coupling protein TraG  36.36 
 
 		 660 aa  232  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291662  normal  0.932105 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3006  conjugal transfer coupling protein TraG  36.54 
 
 		 663 aa  231  4e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0515  conjugal transfer coupling protein TraG  36.68 
 
 		 662 aa  230  5e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.246818  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1023  conjugal transfer coupling protein TraG  36.15 
 
 		 660 aa  230  6e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2618  conjugal transfer coupling protein TraG  35.59 
 
 		 687 aa  229  8e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2327  conjugal transfer coupling protein TraG  34.71 
 
 		 662 aa  228  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.58309  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3356  conjugal transfer coupling protein TraG  36.54 
 
 		 666 aa  228  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.456046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3849  conjugal transfer coupling protein TraG  35.81 
 
 		 664 aa  227  5.0000000000000005e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00986433  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1493  conjugal transfer coupling protein TraG  35.51 
 
 		 700 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00200644  normal  0.246461 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1196  conjugal transfer coupling protein TraG  36.32 
 
 		 663 aa  227  5.0000000000000005e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0400673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3539  conjugal transfer coupling protein TraG  36.32 
 
 		 663 aa  227  5.0000000000000005e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3903  conjugal transfer coupling protein TraG  36.54 
 
 		 665 aa  226  7e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3193  conjugal transfer coupling protein TraG  36.3 
 
 		 661 aa  226  8e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0684551  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0535  TRAG family protein  37.5 
 
 		 509 aa  226  9e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.379254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2818  conjugal transfer coupling protein TraG  36.34 
 
 		 660 aa  226  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.443273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2002  conjugal transfer coupling protein TraG  36.17 
 
 		 665 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0417239  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4007  conjugal transfer coupling protein TraG  36.46 
 
 		 659 aa  225  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0968  conjugal transfer coupling protein TraG  36.32 
 
 		 666 aa  223  7e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3689  conjugal transfer coupling protein TraG  35.13 
 
 		 676 aa  223  9e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35740  conjugal transfer coupling protein TraG  35.51 
 
 		 666 aa  223  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2876  conjugal transfer coupling protein TraG  35.81 
 
 		 662 aa  222  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3084  conjugal transfer coupling protein TraG  35.36 
 
 		 661 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.847978  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2586  conjugal transfer coupling protein TraG  35.67 
 
 		 675 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2348  conjugal transfer coupling protein TraG  35.73 
 
 		 669 aa  221  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.801098 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4193  conjugal transfer coupling protein TraG  35.13 
 
 		 663 aa  220  5e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0724  conjugal transfer coupling protein TraG  35.29 
 
 		 668 aa  220  6e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7739  conjugal transfer coupling protein TraG  36.46 
 
 		 661 aa  220  7e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.477093 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3825  conjugal transfer coupling protein TraG  35.6 
 
 		 666 aa  219  7.999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2643  conjugal transfer coupling protein TraG  35.24 
 
 		 672 aa  219  7.999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0589  conjugal transfer coupling protein TraG  35.81 
 
 		 659 aa  219  8.999999999999998e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0440  conjugal transfer coupling protein TraG  35.36 
 
 		 673 aa  219  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1893  conjugal transfer coupling protein TraG  35.36 
 
 		 670 aa  219  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1506  conjugal transfer coupling protein TraG  34.92 
 
 		 661 aa  218  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2913  conjugal transfer coupling protein TraG  35.45 
 
 		 665 aa  218  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1833  conjugal transfer coupling protein TraG  34.92 
 
 		 687 aa  218  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0751  conjugal transfer coupling protein TraG  34.93 
 
 		 661 aa  217  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1548  conjugal transfer coupling protein TraG  35.23 
 
 		 664 aa  217  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.11101  normal  0.84656 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2701  conjugal transfer coupling protein TraG  35.45 
 
 		 669 aa  217  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.143285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3708  conjugal transfer coupling protein TraG  35.29 
 
 		 669 aa  217  4e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30960  conjugal transfer coupling protein TraG  35.23 
 
 		 666 aa  217  5e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501937  unclonable  1.70004e-21 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3508  conjugal transfer coupling protein TraG  35.13 
 
 		 667 aa  214  3.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1339  conjugal transfer coupling protein TraG  35.23 
 
 		 664 aa  213  5.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.953058  normal  0.786812 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1280  conjugal transfer coupling protein TraG  34.35 
 
 		 665 aa  212  1e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2025  conjugal transfer coupling protein TraG  33.33 
 
 		 678 aa  212  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0593  TRAG protein  32.96 
 
 		 575 aa  204  5e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1649  TRAG family protein  32.71 
 
 		 823 aa  199  2.0000000000000003e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2530  TRAG family protein  31.38 
 
 		 661 aa  194  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.684984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2342  TRAG family protein  34.3 
 
 		 585 aa  191  4e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.910402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2344  conjugal transfer coupling protein TraG  33.33 
 
 		 723 aa  189  1e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.743545  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1316  TRAG family protein  35.03 
 
 		 670 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1185  TRAG family protein  28.74 
 
 		 630 aa  184  4.0000000000000006e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0686  conjugal transfer coupling protein TraG  32.29 
 
 		 756 aa  184  5.0000000000000004e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0018  type IV secretion system component VirD4  30.53 
 
 		 723 aa  183  7e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.512537  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0739  type IV secretion system component VirD4  30.55 
 
 		 641 aa  183  7e-45  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0040  type IV secretion system component VirD4  30.75 
 
 		 714 aa  182  1e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0894  TRAG family protein  28 
 
 		 627 aa  180  4.999999999999999e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4317  conjugal transfer coupling protein TraG  29.4 
 
 		 634 aa  179  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.184857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6525  conjugal transfer coupling protein TraG  28.97 
 
 		 637 aa  178  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.646585  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6612  conjugal transfer coupling protein TraG  28.97 
 
 		 637 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0479  TRAG family protein  36.47 
 
 		 531 aa  175  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0025  conjugal transfer coupling protein TraG  29.2 
 
 		 645 aa  175  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000549825  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0008  type IV secretion system component VirD4  30.11 
 
 		 648 aa  174  5e-42  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.325178  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0247  putative type IV secretory pathway protein VirD4  30.75 
 
 		 648 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.865084 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2647  putative Type IV secretory pathway protein VirD4  29.43 
 
 		 576 aa  169  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4368  TRAG family protein  31.58 
 
 		 713 aa  169  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.538935 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2248  conjugal transfer coupling protein TraG  27.98 
 
 		 644 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1764  putative type IV secretory pathway protein VirD4  29.35 
 
 		 575 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347607  normal  0.197247 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0458  putative type IV secretory pathway protein VirD4  28.28 
 
 		 593 aa  162  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08203  conjugal transfer protein TraK  28.52 
 
 		 592 aa  160  5e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0172  TRAG family protein  28.76 
 
 		 594 aa  160  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.218422 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5000  TRAG family protein  29.15 
 
 		 670 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2451  TRAG family protein  26.52 
 
 		 559 aa  159  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.885622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0262  TRAG family protein  29.1 
 
 		 809 aa  158  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.963876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1398  TRAG family protein  29 
 
 		 828 aa  157  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.277319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6495  TRAG family protein  29 
 
 		 583 aa  158  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1699  TraG/TraD family protein  29.09 
 
 		 834 aa  157  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6396  TRAG family protein  28.54 
 
 		 699 aa  155  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.969912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2793  TRAG protein  29.82 
 
 		 661 aa  153  8.999999999999999e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0977234  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9810  conjugative coupling protein  28.4 
 
 		 699 aa  150  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4715  conjugal transfer coupling protein TraG  26.69 
 
 		 626 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3323  TRAG family protein  28.67 
 
 		 570 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4192  TRAG family protein  28.45 
 
 		 570 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6143  type IV secretion system protein VirD4  29.67 
 
 		 548 aa  147  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4554  TRAG family protein  27.76 
 
 		 695 aa  145  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0862  TRAG family protein  29.21 
 
 		 677 aa  144  6e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.777114 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4843  TRAG protein  28.15 
 
 		 557 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5823  TRAG family protein  29.35 
 
 		 651 aa  142  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>