146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2342 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2342  TRAG family protein  100 
 
 		 585 aa  1217    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.910402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0680  agrobacteirum virulence protein VirD4  28.51 
 
 		 554 aa  192  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4975  TRAG family protein  30.16 
 
 		 560 aa  191  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24546  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6559  TRAG family protein  29.92 
 
 		 561 aa  189  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1185  TRAG family protein  30.34 
 
 		 630 aa  164  5.0000000000000005e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0894  TRAG family protein  29.55 
 
 		 627 aa  162  1e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0247  putative type IV secretory pathway protein VirD4  31.31 
 
 		 648 aa  160  8e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.865084 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4554  TRAG family protein  30.93 
 
 		 695 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0008  type IV secretion system component VirD4  30.49 
 
 		 648 aa  154  4e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.325178  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0739  type IV secretion system component VirD4  30.47 
 
 		 641 aa  153  8e-36  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0018  type IV secretion system component VirD4  29.52 
 
 		 723 aa  152  1e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.512537  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0040  type IV secretion system component VirD4  29.52 
 
 		 714 aa  153  1e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2618  conjugal transfer coupling protein TraG  28.53 
 
 		 687 aa  152  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6396  TRAG family protein  29.87 
 
 		 699 aa  152  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.969912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1196  conjugal transfer coupling protein TraG  29.08 
 
 		 663 aa  151  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0400673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3539  conjugal transfer coupling protein TraG  29.08 
 
 		 663 aa  151  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2818  conjugal transfer coupling protein TraG  29.62 
 
 		 660 aa  151  4e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.443273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3548  conjugal transfer coupling protein TraG  28.57 
 
 		 664 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0535  TRAG family protein  32.23 
 
 		 509 aa  150  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.379254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3193  conjugal transfer coupling protein TraG  29.35 
 
 		 661 aa  150  8e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0684551  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0701  conjugal transfer coupling protein TraG  28.8 
 
 		 661 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1398  TRAG family protein  27.35 
 
 		 828 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.277319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3084  conjugal transfer coupling protein TraG  29.65 
 
 		 661 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.847978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0142  conjugal transfer coupling protein TraG  28.26 
 
 		 674 aa  148  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2530  TRAG family protein  25.69 
 
 		 661 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.684984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2025  conjugal transfer coupling protein TraG  28.84 
 
 		 678 aa  148  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0262  TRAG family protein  27.15 
 
 		 809 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.963876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3006  conjugal transfer coupling protein TraG  27.99 
 
 		 663 aa  148  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2256  conjugal transfer coupling protein TraG  28.73 
 
 		 573 aa  147  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2344  conjugal transfer coupling protein TraG  28.46 
 
 		 723 aa  147  5e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.743545  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3825  conjugal transfer coupling protein TraG  29.01 
 
 		 666 aa  147  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3356  conjugal transfer coupling protein TraG  28.8 
 
 		 666 aa  147  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.456046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1699  TraG/TraD family protein  27.15 
 
 		 834 aa  147  6e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3188  conjugal transfer coupling protein TraG  27.99 
 
 		 669 aa  146  8.000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0589  conjugal transfer coupling protein TraG  29.92 
 
 		 659 aa  147  8.000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0751  conjugal transfer coupling protein TraG  29.38 
 
 		 661 aa  146  8.000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0968  conjugal transfer coupling protein TraG  29.38 
 
 		 666 aa  146  8.000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2586  conjugal transfer coupling protein TraG  28.57 
 
 		 675 aa  146  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2793  TRAG protein  28.05 
 
 		 661 aa  145  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0977234  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1506  conjugal transfer coupling protein TraG  27.99 
 
 		 661 aa  145  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7739  conjugal transfer coupling protein TraG  28.26 
 
 		 661 aa  145  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.477093 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4007  conjugal transfer coupling protein TraG  28.8 
 
 		 659 aa  145  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9810  conjugative coupling protein  29.33 
 
 		 699 aa  145  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3903  conjugal transfer coupling protein TraG  28.57 
 
 		 665 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35740  conjugal transfer coupling protein TraG  28.3 
 
 		 666 aa  145  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4169  TRAG protein  29.19 
 
 		 678 aa  144  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0515  conjugal transfer coupling protein TraG  28.8 
 
 		 662 aa  144  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.246818  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0440  conjugal transfer coupling protein TraG  28.3 
 
 		 673 aa  144  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1970  TRAG family protein  31.58 
 
 		 580 aa  144  4e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1893  conjugal transfer coupling protein TraG  28.3 
 
 		 670 aa  144  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3708  conjugal transfer coupling protein TraG  28.3 
 
 		 669 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1339  conjugal transfer coupling protein TraG  28.03 
 
 		 664 aa  144  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.953058  normal  0.786812 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1548  conjugal transfer coupling protein TraG  28.03 
 
 		 664 aa  144  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.11101  normal  0.84656 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2002  conjugal transfer coupling protein TraG  28.3 
 
 		 665 aa  144  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0417239  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2701  conjugal transfer coupling protein TraG  28.03 
 
 		 669 aa  144  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.143285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1023  conjugal transfer coupling protein TraG  27.99 
 
 		 660 aa  143  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1316  TRAG family protein  28.3 
 
 		 670 aa  143  8e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2876  conjugal transfer coupling protein TraG  29.11 
 
 		 662 aa  143  8e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30960  conjugal transfer coupling protein TraG  28.03 
 
 		 666 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501937  unclonable  1.70004e-21 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0724  conjugal transfer coupling protein TraG  27.72 
 
 		 668 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2913  conjugal transfer coupling protein TraG  28.03 
 
 		 665 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2643  conjugal transfer coupling protein TraG  27.45 
 
 		 672 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1733  conjugal transfer coupling protein TraG  27.72 
 
 		 660 aa  142  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3849  conjugal transfer coupling protein TraG  27.2 
 
 		 664 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00986433  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4193  conjugal transfer coupling protein TraG  27.17 
 
 		 663 aa  142  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7438  conjugal transfer coupling protein TraG  28.38 
 
 		 660 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291662  normal  0.932105 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2348  conjugal transfer coupling protein TraG  27.72 
 
 		 669 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.801098 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2327  conjugal transfer coupling protein TraG  28.26 
 
 		 662 aa  140  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.58309  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1833  conjugal transfer coupling protein TraG  28.03 
 
 		 687 aa  140  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3689  conjugal transfer coupling protein TraG  27.99 
 
 		 676 aa  140  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3508  conjugal transfer coupling protein TraG  27.76 
 
 		 667 aa  140  7.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4317  conjugal transfer coupling protein TraG  27.93 
 
 		 634 aa  140  8.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.184857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4715  conjugal transfer coupling protein TraG  26.73 
 
 		 626 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4436  TRAG protein  27.11 
 
 		 714 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6326  TRAG family protein  29.77 
 
 		 588 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0320  conjugal transfer coupling protein TraG  27.17 
 
 		 661 aa  137  5e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0236522  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1649  TRAG family protein  26.61 
 
 		 823 aa  137  5e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0593  TRAG protein  31.25 
 
 		 575 aa  136  8e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6612  conjugal transfer coupling protein TraG  27.36 
 
 		 637 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5331  TRAG family protein  26.41 
 
 		 658 aa  136  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.390385 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6525  conjugal transfer coupling protein TraG  27.36 
 
 		 637 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.646585  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1493  conjugal transfer coupling protein TraG  29.11 
 
 		 700 aa  135  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00200644  normal  0.246461 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1280  conjugal transfer coupling protein TraG  26.42 
 
 		 665 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0458  putative type IV secretory pathway protein VirD4  30.16 
 
 		 593 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8210  type IV secretion system protein VirD4  28.47 
 
 		 663 aa  129  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.493038  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5000  TRAG family protein  30.29 
 
 		 670 aa  127  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2647  putative Type IV secretory pathway protein VirD4  26.83 
 
 		 576 aa  127  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6143  type IV secretion system protein VirD4  28.25 
 
 		 548 aa  126  9e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4192  TRAG family protein  30.02 
 
 		 570 aa  126  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6495  TRAG family protein  29.81 
 
 		 583 aa  126  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4843  TRAG protein  30.59 
 
 		 557 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3323  TRAG family protein  30.08 
 
 		 570 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0479  TRAG family protein  29.48 
 
 		 531 aa  125  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2451  TRAG family protein  29.97 
 
 		 559 aa  124  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.885622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1764  putative type IV secretory pathway protein VirD4  26.29 
 
 		 575 aa  124  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347607  normal  0.197247 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4368  TRAG family protein  31.07 
 
 		 713 aa  124  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.538935 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0172  TRAG family protein  30.43 
 
 		 594 aa  124  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.218422 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0686  conjugal transfer coupling protein TraG  24.56 
 
 		 756 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0025  conjugal transfer coupling protein TraG  25.48 
 
 		 645 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000549825  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5823  TRAG family protein  30.27 
 
 		 651 aa  118  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>