28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3760 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1490  TraG family protein  47.9 
 
 
669 aa  649    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.179815 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3019  hypothetical protein  50.82 
 
 
694 aa  681    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3564  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  70.61 
 
 
662 aa  976    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3760  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  100 
 
 
658 aa  1365    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.195316  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4381  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  73.79 
 
 
662 aa  1020    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0399338  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6700  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  46.61 
 
 
685 aa  616  1e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.170783 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6838  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  31.01 
 
 
633 aa  234  5e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00343153  normal  0.0724614 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0886  hypothetical protein  30.43 
 
 
597 aa  194  5e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.309534 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0023  transfer complex protein TrsK-like  26.81 
 
 
588 aa  90.1  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0044  hypothetical protein  23.66 
 
 
608 aa  81.6  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.612223  normal  0.249044 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2469  transfer complex protein TrsK-like protein  25.5 
 
 
569 aa  72  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0805174 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3886  transfer complex protein TrsK-like protein  25.75 
 
 
569 aa  71.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5456  transfer complex protein TrsK-like protein  23.38 
 
 
638 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5695  transfer complex protein TrsK-like protein  23.38 
 
 
638 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.604846 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1514  TRAG family protein  24.1 
 
 
606 aa  62.4  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2467  TRAG family protein  22.72 
 
 
511 aa  56.2  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.606871  hitchhiker  0.00000000721319 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1687  putative type IV secretory pathway VirD4 components  35.9 
 
 
784 aa  54.3  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00283538  normal  0.176159 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2738  TRAG family protein  24.21 
 
 
606 aa  51.6  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2519  TRAG family protein  24.25 
 
 
625 aa  51.2  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166499  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0788  TRAG family protein  35.58 
 
 
590 aa  50.8  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5160  hypothetical protein  22.66 
 
 
768 aa  50.8  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0652  putative type IV secretory pathway VirD4 components  28.45 
 
 
602 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_20  conjugative transfer protein TraD  21.53 
 
 
692 aa  45.8  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5224  hypothetical protein  22.85 
 
 
763 aa  45.8  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.440863  normal  0.967503 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1026  hypothetical protein  22.92 
 
 
657 aa  45.4  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.272564 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1362  TRAG family protein  22.13 
 
 
663 aa  45.1  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.824009  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2959  AAA ATPase central domain protein  25.53 
 
 
466 aa  44.3  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.968368 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4194  hypothetical protein  29.7 
 
 
665 aa  43.9  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0224168 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>