38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4381 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1490  TraG family protein  48.5 
 
 		 669 aa  654    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.179815 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4381  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  100 
 
 		 662 aa  1364    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0399338  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3760  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  73.79 
 
 		 658 aa  1039    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.195316  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3019  hypothetical protein  51.27 
 
 		 694 aa  681    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3564  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  73.52 
 
 		 662 aa  1020    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6700  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  47.35 
 
 		 685 aa  613  9.999999999999999e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.170783 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6838  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  33.18 
 
 		 633 aa  256  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00343153  normal  0.0724614 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0886  hypothetical protein  29.87 
 
 		 597 aa  193  1e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.309534 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0023  transfer complex protein TrsK-like  25.07 
 
 		 588 aa  85.9  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0044  hypothetical protein  24.43 
 
 		 608 aa  84.3  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.612223  normal  0.249044 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3886  transfer complex protein TrsK-like protein  23.06 
 
 		 569 aa  77.4  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2469  transfer complex protein TrsK-like protein  22.74 
 
 		 569 aa  76.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0805174 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1514  TRAG family protein  25.25 
 
 		 606 aa  67  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5456  transfer complex protein TrsK-like protein  24.39 
 
 		 638 aa  63.9  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5695  transfer complex protein TrsK-like protein  24.39 
 
 		 638 aa  63.9  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.604846 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2738  TRAG family protein  24.56 
 
 		 606 aa  57.4  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1687  putative type IV secretory pathway VirD4 components  37.61 
 
 		 784 aa  57.4  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00283538  normal  0.176159 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2467  TRAG family protein  24.69 
 
 		 511 aa  57  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.606871  hitchhiker  0.00000000721319 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0365  TRAG protein  22.85 
 
 		 661 aa  53.1  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00756366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0788  TRAG family protein  26.63 
 
 		 590 aa  52.4  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1805  TRAG family protein  23.59 
 
 		 598 aa  52  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2519  TRAG family protein  26.67 
 
 		 625 aa  51.2  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166499  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0815  TRAG family protein  23.96 
 
 		 648 aa  48.1  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.805111  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0739  type IV secretion system component VirD4  22.09 
 
 		 641 aa  47.8  0.0006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1026  hypothetical protein  22.31 
 
 		 657 aa  47.8  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.272564 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1362  TRAG family protein  22.44 
 
 		 663 aa  47.4  0.0009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.824009  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0652  putative type IV secretory pathway VirD4 components  24.31 
 
 		 602 aa  47.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7061  conjugal transfer coupling protein TraG  23.78 
 
 		 655 aa  46.2  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.920891  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4194  hypothetical protein  30.3 
 
 		 665 aa  46.2  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0224168 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1405  TRAG family protein  21.84 
 
 		 827 aa  46.2  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4975  TRAG family protein  20.98 
 
 		 560 aa  45.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24546  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5517  conjugal transfer coupling protein TraG  23.37 
 
 		 665 aa  45.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0112559 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1016  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  23.27 
 
 		 602 aa  45.1  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00046304  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_20  conjugative transfer protein TraD  21.6 
 
 		 692 aa  44.7  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18910  type IV secretory pathway, VirD4 component  21.64 
 
 		 627 aa  45.1  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.755696  normal  0.106526 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0559  TraG/TraD family membrane protein  28.68 
 
 		 666 aa  44.3  0.007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9186  conjugal transfer coupling protein TraG  23.13 
 
 		 656 aa  44.3  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.995414  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2451  TRAG family protein  25.53 
 
 		 559 aa  43.9  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.885622  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>