19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6700 on replicon NC_013731
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1490  TraG family protein  54.32 
 
 		 669 aa  742    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.179815 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6700  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  100 
 
 		 685 aa  1415    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.170783 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3019  hypothetical protein  52.98 
 
 		 694 aa  742    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3564  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  47.23 
 
 		 662 aa  624  1e-177  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3760  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  46.61 
 
 		 658 aa  616  1e-175  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.195316  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4381  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  47.35 
 
 		 662 aa  605  1.0000000000000001e-171  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0399338  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6838  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  31.42 
 
 		 633 aa  244  3.9999999999999997e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00343153  normal  0.0724614 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0886  hypothetical protein  29.05 
 
 		 597 aa  177  5e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.309534 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0023  transfer complex protein TrsK-like  23.85 
 
 		 588 aa  84.7  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3886  transfer complex protein TrsK-like protein  25.82 
 
 		 569 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0044  hypothetical protein  22.66 
 
 		 608 aa  75.1  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.612223  normal  0.249044 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2469  transfer complex protein TrsK-like protein  24.68 
 
 		 569 aa  70.5  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0805174 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5456  transfer complex protein TrsK-like protein  24.28 
 
 		 638 aa  68.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5695  transfer complex protein TrsK-like protein  24.28 
 
 		 638 aa  68.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.604846 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1362  TRAG family protein  23.7 
 
 		 663 aa  55.8  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.824009  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1514  TRAG family protein  22.04 
 
 		 606 aa  49.7  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2467  TRAG family protein  21.98 
 
 		 511 aa  48.1  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.606871  hitchhiker  0.00000000721319 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1687  putative type IV secretory pathway VirD4 components  34.78 
 
 		 784 aa  47.8  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00283538  normal  0.176159 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0263  conjugal transfer protein  26.62 
 
 		 583 aa  44.7  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0192996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>