196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_pVir0007 on replicon NC_008770
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008770  CJJ81176_pVir0007  hypothetical protein  100 
 
 
628 aa  1290    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1185  TRAG family protein  30 
 
 
630 aa  161  3e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3548  conjugal transfer coupling protein TraG  24.44 
 
 
664 aa  158  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0894  TRAG family protein  29.64 
 
 
627 aa  154  4e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3188  conjugal transfer coupling protein TraG  24.39 
 
 
669 aa  154  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3903  conjugal transfer coupling protein TraG  23.99 
 
 
665 aa  153  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342715  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2256  conjugal transfer coupling protein TraG  24.75 
 
 
573 aa  152  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0142  conjugal transfer coupling protein TraG  23.98 
 
 
674 aa  152  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7438  conjugal transfer coupling protein TraG  23.98 
 
 
660 aa  151  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291662  normal  0.932105 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3006  conjugal transfer coupling protein TraG  22.03 
 
 
663 aa  151  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2327  conjugal transfer coupling protein TraG  23.58 
 
 
662 aa  150  8e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.58309  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2618  conjugal transfer coupling protein TraG  23.64 
 
 
687 aa  150  9e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4193  conjugal transfer coupling protein TraG  24.9 
 
 
663 aa  149  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4317  conjugal transfer coupling protein TraG  26.4 
 
 
634 aa  148  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.184857  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5000  TRAG family protein  24.76 
 
 
670 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1506  conjugal transfer coupling protein TraG  22.34 
 
 
661 aa  147  5e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0320  conjugal transfer coupling protein TraG  23.68 
 
 
661 aa  147  6e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0236522  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0172  TRAG family protein  28.41 
 
 
594 aa  146  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.218422 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3356  conjugal transfer coupling protein TraG  24.23 
 
 
666 aa  146  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.456046  normal 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0025  conjugal transfer coupling protein TraG  25.68 
 
 
645 aa  146  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000549825  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1893  conjugal transfer coupling protein TraG  23.93 
 
 
670 aa  145  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3193  conjugal transfer coupling protein TraG  22.42 
 
 
661 aa  145  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0684551  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3084  conjugal transfer coupling protein TraG  23.78 
 
 
661 aa  145  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.847978  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0701  conjugal transfer coupling protein TraG  23.61 
 
 
661 aa  145  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2818  conjugal transfer coupling protein TraG  22.8 
 
 
660 aa  145  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.443273  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6525  conjugal transfer coupling protein TraG  25.63 
 
 
637 aa  144  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.646585  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6612  conjugal transfer coupling protein TraG  25.63 
 
 
637 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3689  conjugal transfer coupling protein TraG  24.08 
 
 
676 aa  144  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2248  conjugal transfer coupling protein TraG  25 
 
 
644 aa  144  5e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0686  conjugal transfer coupling protein TraG  23.61 
 
 
756 aa  144  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1649  TRAG family protein  25.3 
 
 
823 aa  143  7e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2025  conjugal transfer coupling protein TraG  23.81 
 
 
678 aa  144  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3849  conjugal transfer coupling protein TraG  23.31 
 
 
664 aa  143  8e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00986433  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0440  conjugal transfer coupling protein TraG  23.72 
 
 
673 aa  143  9e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5823  TRAG family protein  24.95 
 
 
651 aa  143  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0458  putative type IV secretory pathway protein VirD4  27.78 
 
 
593 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626492  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0515  conjugal transfer coupling protein TraG  23.89 
 
 
662 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.246818  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1280  conjugal transfer coupling protein TraG  24.17 
 
 
665 aa  141  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2002  conjugal transfer coupling protein TraG  23.88 
 
 
665 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0417239  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1833  conjugal transfer coupling protein TraG  24.29 
 
 
687 aa  141  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4007  conjugal transfer coupling protein TraG  23.31 
 
 
659 aa  140  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2913  conjugal transfer coupling protein TraG  23.88 
 
 
665 aa  140  6e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4368  TRAG family protein  26.09 
 
 
713 aa  140  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.538935 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0589  conjugal transfer coupling protein TraG  22.9 
 
 
659 aa  140  7.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1733  conjugal transfer coupling protein TraG  22.94 
 
 
660 aa  139  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1548  conjugal transfer coupling protein TraG  23.88 
 
 
664 aa  139  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.11101  normal  0.84656 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2348  conjugal transfer coupling protein TraG  23.88 
 
 
669 aa  139  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.801098 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2586  conjugal transfer coupling protein TraG  23.67 
 
 
675 aa  138  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2647  putative Type IV secretory pathway protein VirD4  26.77 
 
 
576 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452126  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2701  conjugal transfer coupling protein TraG  23.88 
 
 
669 aa  138  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.143285  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30960  conjugal transfer coupling protein TraG  23.67 
 
 
666 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501937  unclonable  1.70004e-21 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0724  conjugal transfer coupling protein TraG  23.64 
 
 
668 aa  138  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1493  conjugal transfer coupling protein TraG  23.39 
 
 
700 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00200644  normal  0.246461 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0751  conjugal transfer coupling protein TraG  23.18 
 
 
661 aa  138  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3508  conjugal transfer coupling protein TraG  23.67 
 
 
667 aa  137  4e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1023  conjugal transfer coupling protein TraG  23.06 
 
 
660 aa  138  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1196  conjugal transfer coupling protein TraG  23.01 
 
 
663 aa  138  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0400673  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3539  conjugal transfer coupling protein TraG  23.01 
 
 
663 aa  138  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0862  TRAG family protein  25.64 
 
 
677 aa  138  4e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.777114 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3825  conjugal transfer coupling protein TraG  22.61 
 
 
666 aa  137  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2643  conjugal transfer coupling protein TraG  23.67 
 
 
672 aa  137  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0968  conjugal transfer coupling protein TraG  23.98 
 
 
666 aa  136  9e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1764  putative type IV secretory pathway protein VirD4  26.44 
 
 
575 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347607  normal  0.197247 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0680  agrobacteirum virulence protein VirD4  24.54 
 
 
554 aa  136  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7739  conjugal transfer coupling protein TraG  23.12 
 
 
661 aa  136  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.477093 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0018  type IV secretion system component VirD4  24.52 
 
 
723 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.512537  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4975  TRAG family protein  23.3 
 
 
560 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24546  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2876  conjugal transfer coupling protein TraG  22.61 
 
 
662 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0040  type IV secretion system component VirD4  23.75 
 
 
714 aa  134  3e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35740  conjugal transfer coupling protein TraG  23.52 
 
 
666 aa  135  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1316  TRAG family protein  24.83 
 
 
670 aa  135  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0008  type IV secretion system component VirD4  26.39 
 
 
648 aa  134  3.9999999999999996e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.325178  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1339  conjugal transfer coupling protein TraG  24.65 
 
 
664 aa  134  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.953058  normal  0.786812 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3708  conjugal transfer coupling protein TraG  23.67 
 
 
669 aa  134  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2344  conjugal transfer coupling protein TraG  22.68 
 
 
723 aa  134  6e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.743545  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2530  TRAG family protein  26 
 
 
661 aa  133  9e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.684984  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0247  putative type IV secretory pathway protein VirD4  24.47 
 
 
648 aa  132  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.865084 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6495  TRAG family protein  26.74 
 
 
583 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2451  TRAG family protein  24.53 
 
 
559 aa  130  6e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.885622  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3655  TRAG family protein  25.43 
 
 
667 aa  130  7.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.291322  decreased coverage  0.00000244512 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3988  TRAG family protein  25.22 
 
 
670 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.420427  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0162  hypothetical protein  23.75 
 
 
633 aa  129  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0739  type IV secretion system component VirD4  24.09 
 
 
641 aa  129  2.0000000000000002e-28  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3794  TRAG protein  25 
 
 
668 aa  128  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0180  hypothetical protein  23.78 
 
 
633 aa  125  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5019  TRAG family protein  26.28 
 
 
758 aa  125  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a021  conjugal transfer protein TraG/VirD4  24.52 
 
 
598 aa  124  4e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7522  TRAG family protein  25.78 
 
 
601 aa  124  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.445518  normal  0.175078 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8210  type IV secretion system protein VirD4  22.33 
 
 
663 aa  124  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.493038  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6559  TRAG family protein  21.75 
 
 
561 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4192  TRAG family protein  25.35 
 
 
570 aa  120  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4843  TRAG protein  26.05 
 
 
557 aa  120  9e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3323  TRAG family protein  26.05 
 
 
570 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4715  conjugal transfer coupling protein TraG  25.99 
 
 
626 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0040  cmgD4  24.3 
 
 
603 aa  116  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1398  TRAG family protein  25.57 
 
 
828 aa  116  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.277319  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0262  TRAG family protein  25.36 
 
 
809 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.963876  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6143  type IV secretion system protein VirD4  22.72 
 
 
548 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1699  TraG/TraD family protein  25.15 
 
 
834 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4169  TRAG protein  23.62 
 
 
678 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>