158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0647 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4331  conjugal transfer coupling protein TraG  75.79 
 
 		 639 aa  1011    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0647  conjugal transfer coupling protein TraG  100 
 
 		 637 aa  1313    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.600969  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5000  conjugal transfer coupling protein TraG  77.74 
 
 		 635 aa  1018    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.763698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7061  conjugal transfer coupling protein TraG  45.85 
 
 		 655 aa  476  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.920891  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9186  conjugal transfer coupling protein TraG  44.91 
 
 		 656 aa  467  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.995414  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5396  conjugal transfer coupling protein TraG  44.93 
 
 		 639 aa  459  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.457132 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8128  conjugal transfer coupling protein TraG  44.67 
 
 		 654 aa  457  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.147947  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5517  conjugal transfer coupling protein TraG  44.52 
 
 		 665 aa  451  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0112559 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9589  conjugal transfer coupling protein TraG  45.97 
 
 		 629 aa  448  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.283815  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4672  conjugal transfer coupling protein TraG  43.38 
 
 		 641 aa  443  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.811781  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6100  conjugal transfer coupling protein TraG  40.35 
 
 		 663 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5572  conjugal transfer coupling protein TraG  40.63 
 
 		 674 aa  404  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0224305  normal  0.0294254 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4242  conjugal transfer coupling protein TraG  38.28 
 
 		 682 aa  380  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0995866  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3531  conjugal transfer coupling protein TraG  40.24 
 
 		 606 aa  353  4e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1733  conjugal transfer coupling protein TraG  26.96 
 
 		 660 aa  112  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4975  TRAG family protein  24.77 
 
 		 560 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2327  conjugal transfer coupling protein TraG  26.83 
 
 		 662 aa  109  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.58309  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0535  TRAG family protein  25.79 
 
 		 509 aa  108  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.379254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3006  conjugal transfer coupling protein TraG  26.21 
 
 		 663 aa  108  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1023  conjugal transfer coupling protein TraG  26.95 
 
 		 660 aa  108  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3903  conjugal transfer coupling protein TraG  26.15 
 
 		 665 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0968  conjugal transfer coupling protein TraG  26.56 
 
 		 666 aa  105  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2618  conjugal transfer coupling protein TraG  26.55 
 
 		 687 aa  104  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6559  TRAG family protein  23.73 
 
 		 561 aa  103  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3548  conjugal transfer coupling protein TraG  26.09 
 
 		 664 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3188  conjugal transfer coupling protein TraG  26.39 
 
 		 669 aa  102  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3825  conjugal transfer coupling protein TraG  26.65 
 
 		 666 aa  102  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0515  conjugal transfer coupling protein TraG  25.95 
 
 		 662 aa  101  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.246818  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3356  conjugal transfer coupling protein TraG  26.44 
 
 		 666 aa  100  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.456046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2876  conjugal transfer coupling protein TraG  26.78 
 
 		 662 aa  100  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0320  conjugal transfer coupling protein TraG  25.35 
 
 		 661 aa  99.8  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0236522  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7739  conjugal transfer coupling protein TraG  25.96 
 
 		 661 aa  99.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.477093 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2818  conjugal transfer coupling protein TraG  25.84 
 
 		 660 aa  99.4  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.443273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0751  conjugal transfer coupling protein TraG  26.28 
 
 		 661 aa  98.6  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3084  conjugal transfer coupling protein TraG  26.52 
 
 		 661 aa  97.8  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.847978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0142  conjugal transfer coupling protein TraG  27.4 
 
 		 674 aa  97.8  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0680  agrobacteirum virulence protein VirD4  23.97 
 
 		 554 aa  97.4  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1833  conjugal transfer coupling protein TraG  25.87 
 
 		 687 aa  97.1  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3849  conjugal transfer coupling protein TraG  24.76 
 
 		 664 aa  96.7  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00986433  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1196  conjugal transfer coupling protein TraG  26.53 
 
 		 663 aa  96.3  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0400673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3539  conjugal transfer coupling protein TraG  26.53 
 
 		 663 aa  96.3  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4368  TRAG family protein  23.53 
 
 		 713 aa  95.9  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.538935 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1493  conjugal transfer coupling protein TraG  26.4 
 
 		 700 aa  96.3  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00200644  normal  0.246461 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3193  conjugal transfer coupling protein TraG  26.91 
 
 		 661 aa  96.3  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0684551  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0589  conjugal transfer coupling protein TraG  27.42 
 
 		 659 aa  95.5  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1970  TRAG family protein  22.71 
 
 		 580 aa  95.1  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1506  conjugal transfer coupling protein TraG  26.64 
 
 		 661 aa  94.4  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4193  conjugal transfer coupling protein TraG  25.12 
 
 		 663 aa  94  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3689  conjugal transfer coupling protein TraG  25.65 
 
 		 676 aa  93.6  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0701  conjugal transfer coupling protein TraG  26.06 
 
 		 661 aa  93.6  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7438  conjugal transfer coupling protein TraG  25.7 
 
 		 660 aa  92.8  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291662  normal  0.932105 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0018  type IV secretion system component VirD4  23.19 
 
 		 723 aa  89  3e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.512537  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0724  conjugal transfer coupling protein TraG  24.64 
 
 		 668 aa  88.6  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35740  conjugal transfer coupling protein TraG  24.64 
 
 		 666 aa  89  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4007  conjugal transfer coupling protein TraG  26.35 
 
 		 659 aa  87.8  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0040  type IV secretion system component VirD4  23.42 
 
 		 714 aa  87.8  6e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0008  type IV secretion system component VirD4  23.97 
 
 		 648 aa  87  9e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.325178  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2530  TRAG family protein  23.18 
 
 		 661 aa  87  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.684984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0739  type IV secretion system component VirD4  22.76 
 
 		 641 aa  85.9  0.000000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1548  conjugal transfer coupling protein TraG  24.41 
 
 		 664 aa  85.9  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.11101  normal  0.84656 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6495  TRAG family protein  23.4 
 
 		 583 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2647  putative Type IV secretory pathway protein VirD4  23 
 
 		 576 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2002  conjugal transfer coupling protein TraG  24.29 
 
 		 665 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0417239  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1280  conjugal transfer coupling protein TraG  24.88 
 
 		 665 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3708  conjugal transfer coupling protein TraG  24.41 
 
 		 669 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1893  conjugal transfer coupling protein TraG  24.82 
 
 		 670 aa  84.7  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2025  conjugal transfer coupling protein TraG  24.13 
 
 		 678 aa  85.1  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30960  conjugal transfer coupling protein TraG  24.41 
 
 		 666 aa  84.3  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501937  unclonable  1.70004e-21 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2643  conjugal transfer coupling protein TraG  24.41 
 
 		 672 aa  84.3  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0440  conjugal transfer coupling protein TraG  24.65 
 
 		 673 aa  84.3  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2586  conjugal transfer coupling protein TraG  24.41 
 
 		 675 aa  84  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2913  conjugal transfer coupling protein TraG  24.41 
 
 		 665 aa  84.3  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4554  TRAG family protein  22.86 
 
 		 695 aa  84.3  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2348  conjugal transfer coupling protein TraG  24.64 
 
 		 669 aa  84  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.801098 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6396  TRAG family protein  22.97 
 
 		 699 aa  83.6  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.969912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2701  conjugal transfer coupling protein TraG  24.41 
 
 		 669 aa  83.2  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.143285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3508  conjugal transfer coupling protein TraG  24.41 
 
 		 667 aa  82  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1764  putative type IV secretory pathway protein VirD4  22.33 
 
 		 575 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347607  normal  0.197247 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1649  TRAG family protein  23.72 
 
 		 823 aa  81.6  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2256  conjugal transfer coupling protein TraG  24.55 
 
 		 573 aa  81.6  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0593  TRAG protein  22.07 
 
 		 575 aa  81.3  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4169  TRAG protein  22.77 
 
 		 678 aa  80.5  0.00000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5000  TRAG family protein  25.54 
 
 		 670 aa  79.7  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2344  conjugal transfer coupling protein TraG  24.54 
 
 		 723 aa  79.3  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.743545  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0047  TraG/TraD family protein  21.72 
 
 		 620 aa  77.4  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1339  conjugal transfer coupling protein TraG  24.17 
 
 		 664 aa  77  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.953058  normal  0.786812 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0162  hypothetical protein  21.79 
 
 		 633 aa  75.1  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08203  conjugal transfer protein TraK  25.09 
 
 		 592 aa  74.3  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6334  TRAG family protein  26.54 
 
 		 897 aa  73.9  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1185  TRAG family protein  21.21 
 
 		 630 aa  73.9  0.000000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9810  conjugative coupling protein  20.38 
 
 		 699 aa  73.2  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0172  TRAG family protein  22.06 
 
 		 594 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.218422 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4436  TRAG protein  21.25 
 
 		 714 aa  73.2  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3603  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  35.04 
 
 		 129 aa  71.6  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.720206  normal  0.831231 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2793  TRAG protein  22.66 
 
 		 661 aa  71.2  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0977234  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1398  TRAG family protein  23.54 
 
 		 828 aa  70.9  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.277319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0262  TRAG family protein  23.83 
 
 		 809 aa  70.9  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.963876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6326  TRAG family protein  22.4 
 
 		 588 aa  70.5  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1502  TRAG family protein  28.4 
 
 		 610 aa  70.5  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.343787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0894  TRAG family protein  21.21 
 
 		 627 aa  70.5  0.0000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>