15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3603 on replicon NC_009471
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009471  Acry_3603  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  100 
 
 		 129 aa  266  1e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.720206  normal  0.831231 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3531  conjugal transfer coupling protein TraG  97.48 
 
 		 606 aa  241  3e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4242  conjugal transfer coupling protein TraG  50.85 
 
 		 682 aa  118  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0995866  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9589  conjugal transfer coupling protein TraG  42.86 
 
 		 629 aa  84  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.283815  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5572  conjugal transfer coupling protein TraG  38.46 
 
 		 674 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0224305  normal  0.0294254 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7061  conjugal transfer coupling protein TraG  40.87 
 
 		 655 aa  82.4  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.920891  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6100  conjugal transfer coupling protein TraG  37.5 
 
 		 663 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5517  conjugal transfer coupling protein TraG  38.26 
 
 		 665 aa  77.8  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0112559 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9186  conjugal transfer coupling protein TraG  39.13 
 
 		 656 aa  77.4  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.995414  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8128  conjugal transfer coupling protein TraG  39.13 
 
 		 654 aa  77  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.147947  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5396  conjugal transfer coupling protein TraG  39.32 
 
 		 639 aa  73.6  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.457132 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0647  conjugal transfer coupling protein TraG  35.04 
 
 		 637 aa  71.6  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.600969  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4331  conjugal transfer coupling protein TraG  33.61 
 
 		 639 aa  70.1  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5000  conjugal transfer coupling protein TraG  35.65 
 
 		 635 aa  69.7  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.763698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4672  conjugal transfer coupling protein TraG  32.17 
 
 		 641 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.811781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>