128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_5397 on replicon NC_011880
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011880  Cyan7425_5397  hypothetical protein  100 
 
 		 562 aa  1155    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2469  transfer complex protein TrsK-like protein  35.53 
 
 		 569 aa  292  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0805174 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3886  transfer complex protein TrsK-like protein  35.75 
 
 		 569 aa  292  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0044  hypothetical protein  33.77 
 
 		 608 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.612223  normal  0.249044 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0023  transfer complex protein TrsK-like  32.74 
 
 		 588 aa  248  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5456  transfer complex protein TrsK-like protein  31.52 
 
 		 638 aa  219  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5695  transfer complex protein TrsK-like protein  31.52 
 
 		 638 aa  219  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.604846 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0365  TRAG protein  20.04 
 
 		 661 aa  68.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00756366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6334  TRAG family protein  27.02 
 
 		 897 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4554  TRAG family protein  27.92 
 
 		 695 aa  65.1  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6396  TRAG family protein  26.73 
 
 		 699 aa  65.1  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.969912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1026  hypothetical protein  30.83 
 
 		 657 aa  64.3  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.272564 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7061  conjugal transfer coupling protein TraG  33.8 
 
 		 655 aa  64.3  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.920891  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5000  TRAG family protein  26.9 
 
 		 670 aa  63.9  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4169  TRAG protein  32.38 
 
 		 678 aa  63.5  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9186  conjugal transfer coupling protein TraG  33.86 
 
 		 656 aa  63.2  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.995414  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5517  conjugal transfer coupling protein TraG  27.66 
 
 		 665 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0112559 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9589  conjugal transfer coupling protein TraG  30.23 
 
 		 629 aa  62.4  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.283815  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1493  conjugal transfer coupling protein TraG  22.62 
 
 		 700 aa  62.4  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00200644  normal  0.246461 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1502  TRAG family protein  30.83 
 
 		 610 aa  61.6  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.343787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9810  conjugative coupling protein  29.75 
 
 		 699 aa  61.6  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4194  hypothetical protein  28.99 
 
 		 665 aa  60.1  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0224168 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0458  putative type IV secretory pathway protein VirD4  35.11 
 
 		 593 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0172  TRAG family protein  34.04 
 
 		 594 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.218422 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3905  hypothetical protein  24.32 
 
 		 760 aa  58.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6495  TRAG family protein  27.63 
 
 		 583 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0023  conjugal transfer protein  25 
 
 		 673 aa  58.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2647  putative Type IV secretory pathway protein VirD4  32.98 
 
 		 576 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1764  putative type IV secretory pathway protein VirD4  26.47 
 
 		 575 aa  56.6  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347607  normal  0.197247 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4368  TRAG family protein  24.44 
 
 		 713 aa  56.6  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.538935 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4672  conjugal transfer coupling protein TraG  32.17 
 
 		 641 aa  55.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.811781  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1649  TRAG family protein  37.17 
 
 		 823 aa  55.8  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2530  TRAG family protein  33.03 
 
 		 661 aa  55.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.684984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0076  putative type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  30.86 
 
 		 681 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4192  TRAG family protein  29.48 
 
 		 570 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4843  TRAG protein  29.48 
 
 		 557 aa  55.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3323  TRAG family protein  29.48 
 
 		 570 aa  55.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0001  type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  30.29 
 
 		 743 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2490  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  23.85 
 
 		 629 aa  54.7  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1514  TRAG family protein  30.83 
 
 		 606 aa  54.7  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4436  TRAG protein  20.52 
 
 		 714 aa  54.3  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a021  conjugal transfer protein TraG/VirD4  35.16 
 
 		 598 aa  53.9  0.000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5823  TRAG family protein  33.33 
 
 		 651 aa  53.5  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2025  conjugal transfer coupling protein TraG  28.22 
 
 		 678 aa  52.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2451  TRAG family protein  25.98 
 
 		 559 aa  52.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.885622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3794  TRAG protein  26.62 
 
 		 668 aa  52  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5000  conjugal transfer coupling protein TraG  25 
 
 		 635 aa  52  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.763698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3560  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  36.11 
 
 		 604 aa  51.2  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.486257  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0247  putative type IV secretory pathway protein VirD4  24.71 
 
 		 648 aa  51.2  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.865084 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8128  conjugal transfer coupling protein TraG  33.07 
 
 		 654 aa  50.8  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.147947  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3655  TRAG family protein  26.62 
 
 		 667 aa  50.8  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.291322  decreased coverage  0.00000244512 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08203  conjugal transfer protein TraK  28.45 
 
 		 592 aa  50.8  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3988  TRAG family protein  26.28 
 
 		 670 aa  50.8  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.420427  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1185  TRAG family protein  36.84 
 
 		 630 aa  50.8  0.00007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0162  hypothetical protein  26.21 
 
 		 633 aa  50.4  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1405  TRAG family protein  21.55 
 
 		 827 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1833  conjugal transfer coupling protein TraG  26.97 
 
 		 687 aa  49.7  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2519  TRAG family protein  22.7 
 
 		 625 aa  50.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166499  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2467  TRAG family protein  27.78 
 
 		 511 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.606871  hitchhiker  0.00000000721319 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0040  cmgD4  31.03 
 
 		 603 aa  49.3  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0976  TRAG family protein  30.83 
 
 		 912 aa  49.3  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5396  conjugal transfer coupling protein TraG  31.5 
 
 		 639 aa  49.3  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.457132 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0180  hypothetical protein  25.81 
 
 		 633 aa  48.5  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0142  conjugal transfer coupling protein TraG  23.8 
 
 		 674 aa  48.5  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0647  conjugal transfer coupling protein TraG  25.95 
 
 		 637 aa  48.5  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.600969  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1438  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  20.88 
 
 		 562 aa  48.9  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00273235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1567  putative type IV secretory pathway VirD4 component  26.17 
 
 		 571 aa  48.9  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4331  conjugal transfer coupling protein TraG  26.11 
 
 		 639 aa  48.5  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4308  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  22.62 
 
 		 840 aa  48.1  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0280519 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0701  conjugal transfer coupling protein TraG  22.38 
 
 		 661 aa  48.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0680  agrobacteirum virulence protein VirD4  27.82 
 
 		 554 aa  48.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1687  putative type IV secretory pathway VirD4 components  23.39 
 
 		 784 aa  48.1  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00283538  normal  0.176159 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0652  putative type IV secretory pathway VirD4 components  24.81 
 
 		 602 aa  47.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2425  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  23.72 
 
 		 616 aa  47.8  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146549  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1381  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  22.41 
 
 		 656 aa  47.8  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3305  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  23.87 
 
 		 690 aa  47.4  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000882445  normal  0.114382 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6944  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  25.74 
 
 		 702 aa  47.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0724  conjugal transfer coupling protein TraG  28.3 
 
 		 668 aa  47.8  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0515  conjugal transfer coupling protein TraG  29.1 
 
 		 662 aa  47  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.246818  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2586  conjugal transfer coupling protein TraG  27.36 
 
 		 675 aa  47  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4193  conjugal transfer coupling protein TraG  26.62 
 
 		 663 aa  47  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1548  conjugal transfer coupling protein TraG  28.3 
 
 		 664 aa  46.6  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.11101  normal  0.84656 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30960  conjugal transfer coupling protein TraG  28.3 
 
 		 666 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501937  unclonable  1.70004e-21 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2913  conjugal transfer coupling protein TraG  28.3 
 
 		 665 aa  46.6  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3708  conjugal transfer coupling protein TraG  28.3 
 
 		 669 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35740  conjugal transfer coupling protein TraG  28.3 
 
 		 666 aa  46.6  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3006  conjugal transfer coupling protein TraG  29.36 
 
 		 663 aa  46.6  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0440  conjugal transfer coupling protein TraG  28.3 
 
 		 673 aa  46.2  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2701  conjugal transfer coupling protein TraG  28.3 
 
 		 669 aa  46.6  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.143285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2643  conjugal transfer coupling protein TraG  28.3 
 
 		 672 aa  47  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06490  type IV secretory pathway, VirD4 component  23.7 
 
 		 634 aa  46.6  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00928914  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2002  conjugal transfer coupling protein TraG  30.53 
 
 		 665 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0417239  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3508  conjugal transfer coupling protein TraG  28.3 
 
 		 667 aa  46.2  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0821  TRAG family protein  23.4 
 
 		 673 aa  45.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.153462  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2876  conjugal transfer coupling protein TraG  22.64 
 
 		 662 aa  46.2  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2348  conjugal transfer coupling protein TraG  27.36 
 
 		 669 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.801098 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2352  Sigma 54 interacting domain protein  23.08 
 
 		 672 aa  45.8  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0862  TRAG family protein  28.85 
 
 		 677 aa  45.8  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.777114 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1893  conjugal transfer coupling protein TraG  28.3 
 
 		 670 aa  46.2  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1280  conjugal transfer coupling protein TraG  30.53 
 
 		 665 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>