53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0559 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0559  TraG/TraD family membrane protein  100 
 
 		 666 aa  1340    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0365  TRAG protein  24.14 
 
 		 661 aa  103  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00756366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf601  hypothetical protein  60.47 
 
 		 84 aa  98.6  3e-19  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000155171  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1502  TRAG family protein  23.76 
 
 		 610 aa  98.6  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.343787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3153  TRAG family protein  25.31 
 
 		 762 aa  91.7  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18910  type IV secretory pathway, VirD4 component  23.06 
 
 		 627 aa  89  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.755696  normal  0.106526 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1805  TRAG family protein  23.06 
 
 		 598 aa  86.7  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2738  TRAG family protein  21.86 
 
 		 606 aa  85.5  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1514  TRAG family protein  22.15 
 
 		 606 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0815  TRAG family protein  24.75 
 
 		 648 aa  80.5  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.805111  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0788  TRAG family protein  20.69 
 
 		 590 aa  74.3  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0014  conjugation protein  28.65 
 
 		 877 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28380  type IV secretory pathway, VirD4 component  21.97 
 
 		 445 aa  68.9  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.125371 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1362  TRAG family protein  22.11 
 
 		 663 aa  67  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.824009  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5823  TRAG family protein  23 
 
 		 651 aa  66.6  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0821  TRAG family protein  19.87 
 
 		 673 aa  66.6  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.153462  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2519  TRAG family protein  22.46 
 
 		 625 aa  64.7  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166499  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0040  type IV secretion system component VirD4  21.58 
 
 		 714 aa  64.3  0.000000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0018  type IV secretion system component VirD4  21.58 
 
 		 723 aa  64.3  0.000000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.512537  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6525  conjugal transfer coupling protein TraG  20.98 
 
 		 637 aa  63.9  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.646585  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6612  conjugal transfer coupling protein TraG  20.98 
 
 		 637 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4317  conjugal transfer coupling protein TraG  20.42 
 
 		 634 aa  60.8  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.184857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0918  TRAG family protein  23.35 
 
 		 677 aa  59.3  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0739  type IV secretion system component VirD4  21.37 
 
 		 641 aa  55.8  0.000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0843  TRAG family protein  22.37 
 
 		 682 aa  54.7  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1112  Type IV secretory pathway, VirD4 component  25.62 
 
 		 1006 aa  52.8  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7061  conjugal transfer coupling protein TraG  21.18 
 
 		 655 aa  52.4  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.920891  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0008  type IV secretion system component VirD4  20.99 
 
 		 648 aa  51.2  0.00005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.325178  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9810  conjugative coupling protein  22.07 
 
 		 699 aa  50.8  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9186  conjugal transfer coupling protein TraG  20.68 
 
 		 656 aa  50.8  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.995414  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5517  conjugal transfer coupling protein TraG  20.55 
 
 		 665 aa  50.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0112559 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6495  TRAG family protein  21.49 
 
 		 583 aa  49.7  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0458  putative type IV secretory pathway protein VirD4  20.91 
 
 		 593 aa  49.3  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0172  TRAG family protein  20.22 
 
 		 594 aa  48.9  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.218422 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2647  putative Type IV secretory pathway protein VirD4  22.38 
 
 		 576 aa  48.9  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2451  TRAG family protein  23.43 
 
 		 559 aa  48.5  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.885622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0023  transfer complex protein TrsK-like  31.53 
 
 		 588 aa  48.1  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1185  TRAG family protein  24.12 
 
 		 630 aa  47.8  0.0007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0976  TRAG family protein  22.22 
 
 		 912 aa  47.4  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3019  hypothetical protein  21.83 
 
 		 694 aa  47  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2467  TRAG family protein  21.33 
 
 		 511 aa  47  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.606871  hitchhiker  0.00000000721319 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6396  TRAG family protein  21.28 
 
 		 699 aa  47  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.969912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2025  conjugal transfer coupling protein TraG  20.53 
 
 		 678 aa  47.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6215  TRAG family protein  20.05 
 
 		 902 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.371474 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8128  conjugal transfer coupling protein TraG  20.9 
 
 		 654 aa  45.8  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.147947  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2361  hypothetical protein  23.08 
 
 		 598 aa  44.7  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.210389  normal  0.401092 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4381  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  28.68 
 
 		 662 aa  44.7  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0399338  n/a   
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0007  hypothetical protein  22.22 
 
 		 628 aa  44.3  0.007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1764  putative type IV secretory pathway protein VirD4  21.76 
 
 		 575 aa  44.3  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347607  normal  0.197247 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0044  hypothetical protein  24.23 
 
 		 608 aa  44.3  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.612223  normal  0.249044 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3564  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  21.26 
 
 		 662 aa  43.9  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5695  transfer complex protein TrsK-like protein  25 
 
 		 638 aa  43.9  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.604846 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5456  transfer complex protein TrsK-like protein  25 
 
 		 638 aa  43.9  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>