11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1112 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1112  Type IV secretory pathway, VirD4 component  100 
 
 		 1006 aa  2089    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0014  conjugation protein  25.44 
 
 		 877 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3153  TRAG family protein  27.49 
 
 		 762 aa  69.3  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0559  TraG/TraD family membrane protein  25.62 
 
 		 666 aa  52.8  0.00004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1362  TRAG family protein  22.42 
 
 		 663 aa  50.1  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.824009  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0821  TRAG family protein  24.38 
 
 		 673 aa  49.3  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.153462  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0365  TRAG protein  23.28 
 
 		 661 aa  48.5  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00756366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2425  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  22.7 
 
 		 616 aa  46.6  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146549  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1821  putative type IV secretory pathway VirD4 component  27.08 
 
 		 565 aa  46.2  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.49149 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3620  TRAG family protein  23.47 
 
 		 896 aa  45.1  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0601306  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1805  TRAG family protein  21.47 
 
 		 598 aa  45.1  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>