141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1590 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  100 
 
 
289 aa  589  1e-167  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  75 
 
 
423 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  62.4 
 
 
283 aa  312  3.9999999999999997e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  59.43 
 
 
426 aa  279  3e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  59.66 
 
 
291 aa  272  5.000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  47.54 
 
 
279 aa  249  3e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  51.64 
 
 
1290 aa  249  3e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  50.6 
 
 
642 aa  248  7e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  50.6 
 
 
641 aa  248  8e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  49.6 
 
 
627 aa  236  4e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  48.62 
 
 
588 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  50 
 
 
281 aa  231  1e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  47.31 
 
 
282 aa  223  2e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  46.83 
 
 
1321 aa  216  4e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  47.04 
 
 
883 aa  209  4e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  45.16 
 
 
274 aa  209  6e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  42.7 
 
 
276 aa  208  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  41.16 
 
 
288 aa  204  1e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  45.71 
 
 
633 aa  202  4e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  41.49 
 
 
286 aa  202  6e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  44.71 
 
 
503 aa  202  6e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  46.37 
 
 
569 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  45.64 
 
 
556 aa  195  9e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  41.32 
 
 
384 aa  194  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  41.05 
 
 
389 aa  193  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  44.92 
 
 
383 aa  191  8e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3929  glycoside hydrolase family 16  42.11 
 
 
271 aa  191  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2679  glycoside hydrolase family protein  45.7 
 
 
260 aa  188  8e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  43.67 
 
 
301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  39.63 
 
 
394 aa  179  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  41.03 
 
 
328 aa  179  4.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  40 
 
 
252 aa  177  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  41.25 
 
 
261 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  39.84 
 
 
1028 aa  172  5.999999999999999e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6737  glycoside hydrolase family 16  43.04 
 
 
286 aa  171  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0544  glycoside hydrolase family 16  44.12 
 
 
238 aa  169  7e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.673841 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  35.47 
 
 
330 aa  167  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  38.33 
 
 
884 aa  167  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4150  glycoside hydrolase family 16  43.33 
 
 
269 aa  167  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  37.54 
 
 
912 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  39.92 
 
 
409 aa  161  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3121  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  38.83 
 
 
742 aa  161  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  40.62 
 
 
469 aa  160  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0554  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  38.08 
 
 
532 aa  158  9e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1319  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.56 
 
 
358 aa  158  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  38.4 
 
 
1332 aa  154  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  38.54 
 
 
694 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  37.69 
 
 
479 aa  152  8e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  40.27 
 
 
752 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0247  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  39.3 
 
 
328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  40.07 
 
 
479 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  36.25 
 
 
464 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  37.08 
 
 
1694 aa  146  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  34.9 
 
 
291 aa  147  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3843  glycoside hydrolase family protein  36.69 
 
 
346 aa  146  5e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  37.73 
 
 
470 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  36.59 
 
 
1918 aa  140  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  35.38 
 
 
1059 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.83 
 
 
547 aa  135  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0919  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.63 
 
 
315 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.13 
 
 
819 aa  132  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  38.75 
 
 
1441 aa  130  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1608  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.04 
 
 
306 aa  129  5.0000000000000004e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3954  glycoside hydrolase family 16  36.27 
 
 
318 aa  129  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.913325  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  40.53 
 
 
427 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  37.98 
 
 
446 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0724  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.82 
 
 
290 aa  120  3e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.337879 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0875  glycoside hydrolase family 16  31.94 
 
 
313 aa  117  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54973  endo-1,3-beta-glucosidase  34.1 
 
 
467 aa  115  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  34.94 
 
 
469 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4793  glycoside hydrolase family protein  38.73 
 
 
320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06620  endo-1,3(4)-beta-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14540)  33.56 
 
 
388 aa  113  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.240126 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4347  glycoside hydrolase family 16  31.43 
 
 
405 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0666302  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.4 
 
 
1007 aa  112  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2739  glycoside hydrolase family protein  36.86 
 
 
308 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.77425  normal  0.433839 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  33.33 
 
 
722 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6434  glycoside hydrolase family 16  33.21 
 
 
286 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4533  glycoside hydrolase family protein  37.85 
 
 
306 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445894  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0284  glycoside hydrolase family 16  37.65 
 
 
256 aa  106  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  30.67 
 
 
907 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4667  glycoside hydrolase family 16  33.7 
 
 
275 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.02 
 
 
815 aa  102  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.59 
 
 
639 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4792  glycoside hydrolase family protein  36.63 
 
 
608 aa  100  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89444  predicted protein  31.46 
 
 
477 aa  100  4e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0724789  hitchhiker  0.00296553 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0560  glycoside hydrolase family 16  29.13 
 
 
263 aa  99  7e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0584  glycoside hydrolase family 16  27.84 
 
 
277 aa  94.4  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.824584  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0558  glycoside hydrolase family protein  31.13 
 
 
449 aa  94.4  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0874314  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0981  b-glucosidase  32.53 
 
 
334 aa  92.4  8e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.849748  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  30.89 
 
 
1707 aa  90.1  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3127  glycoside hydrolase family 16  30.93 
 
 
275 aa  89.4  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2285  glycoside hydrolase family 16  30 
 
 
539 aa  89  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0517847  hitchhiker  0.00991437 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3399  glycoside hydrolase family 16  29.38 
 
 
275 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.117609 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4931  glycoside hydrolase family protein  33.19 
 
 
465 aa  88.6  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0724  beta-glucanase/beta-glucan synthetase-like protein  29.82 
 
 
295 aa  85.9  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.882839  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  30.93 
 
 
999 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0144  glycoside hydrolase family 16  31.34 
 
 
337 aa  84  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.568109  normal  0.0389127 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3542  glycoside hydrolase family 16  33.51 
 
 
288 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6224  endo-1,3-1,4-beta-glycanase, C-terminal secretion signal protein  30.62 
 
 
475 aa  83.2  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380521  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10320  beta-1,3-glucanase precursor  32.57 
 
 
294 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0132676  normal  0.819711 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>