118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2679 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2679  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
260 aa  518  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3929  glycoside hydrolase family 16  56.92 
 
 
271 aa  288  6e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  45.7 
 
 
289 aa  199  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4150  glycoside hydrolase family 16  50.39 
 
 
269 aa  198  7.999999999999999e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  47.44 
 
 
423 aa  192  6e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  44.96 
 
 
291 aa  169  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  40.65 
 
 
426 aa  166  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  41.8 
 
 
588 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  39.93 
 
 
279 aa  159  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  41.46 
 
 
283 aa  156  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  38.43 
 
 
274 aa  151  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.9 
 
 
288 aa  150  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  39.42 
 
 
633 aa  148  8e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  37.36 
 
 
281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  38.4 
 
 
384 aa  146  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  35.97 
 
 
569 aa  144  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  37.55 
 
 
627 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  37.5 
 
 
1290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  38.31 
 
 
383 aa  140  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  36.12 
 
 
389 aa  139  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.23 
 
 
282 aa  138  7.999999999999999e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.87 
 
 
252 aa  135  6.0000000000000005e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  37.55 
 
 
642 aa  135  8e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  37.55 
 
 
641 aa  135  9e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  37.76 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  33.58 
 
 
286 aa  130  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  36.29 
 
 
301 aa  123  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  36.51 
 
 
556 aa  122  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  36.51 
 
 
1028 aa  122  6e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  33.83 
 
 
394 aa  121  9e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  35.79 
 
 
276 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  35.32 
 
 
291 aa  119  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  31.37 
 
 
503 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  33.06 
 
 
883 aa  115  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3121  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.1 
 
 
742 aa  115  8.999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.57 
 
 
884 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  33.85 
 
 
1321 aa  108  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  31.54 
 
 
469 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  35.74 
 
 
409 aa  108  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6737  glycoside hydrolase family 16  36.29 
 
 
286 aa  108  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  31.82 
 
 
328 aa  107  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3843  glycoside hydrolase family protein  30.92 
 
 
346 aa  103  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.86 
 
 
819 aa  104  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.75 
 
 
912 aa  103  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.74 
 
 
1694 aa  101  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  35.64 
 
 
752 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3954  glycoside hydrolase family 16  36.04 
 
 
318 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.913325  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  32.01 
 
 
1059 aa  96.3  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  35.42 
 
 
470 aa  95.9  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54973  endo-1,3-beta-glucosidase  33.2 
 
 
467 aa  95.5  8e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  28.9 
 
 
330 aa  95.1  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0554  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.8 
 
 
532 aa  94.7  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0919  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.75 
 
 
315 aa  93.6  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0544  glycoside hydrolase family 16  35.89 
 
 
238 aa  93.2  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.673841 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  32.71 
 
 
1441 aa  92.8  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  33.07 
 
 
446 aa  92.4  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  32.97 
 
 
469 aa  91.7  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1319  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.25 
 
 
358 aa  90.5  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  37.08 
 
 
427 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.54 
 
 
1007 aa  88.6  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2739  glycoside hydrolase family protein  34.36 
 
 
308 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.77425  normal  0.433839 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  33.09 
 
 
464 aa  87.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1608  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.37 
 
 
306 aa  85.9  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  31.42 
 
 
1332 aa  86.3  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.56 
 
 
547 aa  85.1  9e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4347  glycoside hydrolase family 16  30.25 
 
 
405 aa  85.5  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0666302  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  32.96 
 
 
479 aa  83.6  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  32.88 
 
 
479 aa  82.8  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  30.8 
 
 
1918 aa  80.1  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0560  glycoside hydrolase family 16  30 
 
 
263 aa  80.1  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06620  endo-1,3(4)-beta-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14540)  29.96 
 
 
388 aa  79.3  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.240126 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0247  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.86 
 
 
328 aa  78.6  0.00000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0724  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.15 
 
 
290 aa  78.6  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.337879 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.73 
 
 
639 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  28.29 
 
 
694 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3127  glycoside hydrolase family 16  34.01 
 
 
275 aa  77  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  29.72 
 
 
1707 aa  75.9  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3399  glycoside hydrolase family 16  33.67 
 
 
275 aa  75.9  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.117609 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6434  glycoside hydrolase family 16  31.09 
 
 
286 aa  75.1  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.19 
 
 
815 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4793  glycoside hydrolase family protein  33.9 
 
 
320 aa  72.4  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3542  glycoside hydrolase family 16  35.42 
 
 
288 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4533  glycoside hydrolase family protein  30.74 
 
 
306 aa  70.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445894  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0284  glycoside hydrolase family 16  31.2 
 
 
256 aa  70.5  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0981  b-glucosidase  29.2 
 
 
334 aa  70.5  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.849748  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4792  glycoside hydrolase family protein  35.67 
 
 
608 aa  69.7  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0875  glycoside hydrolase family 16  26.37 
 
 
313 aa  68.2  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0584  glycoside hydrolase family 16  26.64 
 
 
277 aa  66.2  0.0000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.824584  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0724  beta-glucanase/beta-glucan synthetase-like protein  29.55 
 
 
295 aa  64.7  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.882839  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2578  glycoside hydrolase family protein  31.89 
 
 
277 aa  64.3  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164191  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4931  glycoside hydrolase family protein  32.78 
 
 
465 aa  62.8  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6754  glycoside hydrolase family protein  33.54 
 
 
284 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2285  glycoside hydrolase family 16  31.02 
 
 
539 aa  60.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0517847  hitchhiker  0.00991437 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0298  glycoside hydrolase family protein  31.64 
 
 
286 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0557225 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1873  glycoside hydrolase family 16  31.85 
 
 
287 aa  58.2  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0558  glycoside hydrolase family protein  27.8 
 
 
449 aa  57.4  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0874314  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0416  twin-arginine translocation pathway signal  31.78 
 
 
283 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0425  glycoside hydrolase family protein  31.78 
 
 
283 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal  0.978104 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0404  glycoside hydrolase family protein  31.78 
 
 
283 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.131377  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4667  glycoside hydrolase family 16  25.94 
 
 
275 aa  57  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>