More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4859 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4859  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 186 aa  360  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.205859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4711  transcriptional regulator, TetR family  86.49 
 
 		 186 aa  312  9.999999999999999e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4342  regulatory protein TetR  86.49 
 
 		 186 aa  312  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2783  TetR family transcriptional regulator  55.8 
 
 		 187 aa  189  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2114  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 183 aa  92  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.328011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 		 415 aa  75.5  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  35.98 
 
 		 428 aa  74.7  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  39.41 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2157  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2620  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727172  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5492  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56711 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  34.5 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  33.53 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  57.69 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5162  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.186575 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  47.76 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 181 aa  57.8  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1884  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652086  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 208 aa  57  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 183 aa  57  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1464  TetR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0124  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3701  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.076632  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0763  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673415  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0778  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02650  transcriptional regulator, tetR family  56 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  50.91 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3664  regulatory protein, TetR  32.98 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1090  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 188 aa  54.3  0.0000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0286  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.945519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4086  putative transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 		 237 aa  54.7  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  54 
 
 		 180 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 186 aa  53.9  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1051  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0935  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 199 aa  53.1  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1498  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 189 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437225  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2801  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 179 aa  52.4  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2152  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 168 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 233 aa  52.4  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1094  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 168 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 201 aa  51.6  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 201 aa  51.6  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  38.03 
 
 		 202 aa  52  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0880  transcriptional regulator, TetR family  56.25 
 
 		 181 aa  51.6  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7001  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 221 aa  51.6  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0052  transcriptional regulator, TetR family  37.38 
 
 		 188 aa  51.6  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 		 237 aa  51.2  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2560  putative transcription regulator protein  30.82 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0102643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  28.78 
 
 		 181 aa  50.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2113  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 182 aa  50.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1116  TetR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 184 aa  50.4  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 204 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3984  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 191 aa  50.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 178 aa  50.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490432 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0142  TetR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 288 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1036  TetR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 288 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0186  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0425  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 216 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3018  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1499  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0951967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2940  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.333542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1819  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191224 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 200 aa  49.3  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2389  TetR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 200 aa  49.3  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.979129  normal  0.861655 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0169  TetR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 321 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.964419  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4488  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.14916  normal  0.0536152 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3610  TetR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 191 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1313  TetR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 321 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2773  TetR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 321 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2630  TetR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 321 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 213 aa  48.9  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2794  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 184 aa  48.9  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3407  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 178 aa  48.9  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1775  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 255 aa  48.9  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1142  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 202 aa  48.5  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180703  normal  0.158777 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4581  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 453 aa  48.5  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0520678  hitchhiker  0.00576912 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1153  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 189 aa  48.5  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22050  transcriptional regulator  31.97 
 
 		 199 aa  48.5  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0903673 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0675  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 271 aa  48.5  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886772  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0369  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 204 aa  48.5  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238864 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 220 aa  48.5  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  33.78 
 
 		 222 aa  48.1  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 221 aa  48.1  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 357 aa  48.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7032  transcriptional regulator TetR family  35.09 
 
 		 215 aa  48.1  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4803  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 193 aa  48.1  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.539659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>