More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7236 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6486  major facilitator transporter  92.47 
 
 		 488 aa  822    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.158233  normal  0.579657 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7236  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 484 aa  937    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.440846  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2711  major facilitator transporter  68.84 
 
 		 480 aa  621  1e-177  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0257064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1026  major facilitator transporter  66.32 
 
 		 494 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.76492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3612  major facilitator transporter  67.72 
 
 		 476 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.384434  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5143  major facilitator superfamily MFS_1  67.58 
 
 		 495 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4525  major facilitator transporter  67.57 
 
 		 493 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.432658 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3530  major facilitator superfamily MFS_1  68.51 
 
 		 491 aa  596  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0831333  normal  0.224408 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3027  major facilitator transporter  66.11 
 
 		 481 aa  595  1e-169  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0428  major facilitator superfamily sugar transporter  68.72 
 
 		 491 aa  597  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2729  major facilitator transporter  68.15 
 
 		 489 aa  587  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.876432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4643  major facilitator superfamily MFS_1  66.05 
 
 		 492 aa  580  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0915  major facilitator transporter  67.36 
 
 		 493 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.86159  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4276  major facilitator transporter  66.25 
 
 		 492 aa  580  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4791  major facilitator superfamily MFS_1  67.08 
 
 		 492 aa  580  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263491  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0576  major facilitator transporter  64.98 
 
 		 504 aa  580  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3624  major facilitator superfamily MFS_1  67.1 
 
 		 597 aa  578  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5496  major facilitator transporter  66.04 
 
 		 490 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2306  major facilitator transporter  64.44 
 
 		 483 aa  569  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.957896  normal  0.102132 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2500  major facilitator family transporter  63.88 
 
 		 483 aa  565  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.589471  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0395  major facilitator superfamily MFS_1  61.62 
 
 		 472 aa  520  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.90687 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0856  major facilitator superfamily protein  57.41 
 
 		 483 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0609243 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1458  major facilitator transporter  57.47 
 
 		 474 aa  477  1e-133  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.201779  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2715  major facilitator transporter  54.32 
 
 		 491 aa  455  1e-127  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2085  major facilitator superfamily transporter  54.41 
 
 		 501 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00714059  normal  0.900579 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1576  major facilitator superfamily MFS_1  54.95 
 
 		 483 aa  439  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9266  major facilitator transporter  53.05 
 
 		 479 aa  429  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248133 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1785  major facilitator transporter  52.39 
 
 		 493 aa  419  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4845  major facilitator transporter  56.89 
 
 		 457 aa  420  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08810  arabinose efflux permease family protein  51.67 
 
 		 494 aa  416  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0050  major facilitator transporter  51.46 
 
 		 484 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4810  MFS superfamily transporter permease  55.63 
 
 		 514 aa  417  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3353  major facilitator superfamily transporter  50.95 
 
 		 483 aa  412  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379633  decreased coverage  0.00165452 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2549  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 495 aa  412  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3249  major facilitator superfamily MFS_1  52.79 
 
 		 497 aa  403  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.468482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  34.62 
 
 		 446 aa  228  1e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2550  major facilitator transporter  34.29 
 
 		 481 aa  210  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0195  major facilitator transporter  33.57 
 
 		 465 aa  170  5e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  34.81 
 
 		 451 aa  137  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  31.28 
 
 		 456 aa  131  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 		 461 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  26.27 
 
 		 479 aa  126  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 463 aa  126  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  27.06 
 
 		 460 aa  126  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  29.34 
 
 		 455 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  26.27 
 
 		 479 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  39.29 
 
 		 435 aa  124  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  31.06 
 
 		 459 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 485 aa  120  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  28.09 
 
 		 462 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  28.33 
 
 		 455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  28.3 
 
 		 485 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  36.05 
 
 		 445 aa  118  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 		 459 aa  117  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  31.63 
 
 		 459 aa  117  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  28.09 
 
 		 462 aa  117  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 485 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  27.29 
 
 		 487 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 447 aa  116  8.999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 479 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 479 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  26.48 
 
 		 478 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  30.82 
 
 		 465 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  28.9 
 
 		 438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  34.25 
 
 		 471 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 457 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 		 458 aa  114  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  35.47 
 
 		 477 aa  113  7.000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  26.06 
 
 		 456 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3228  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 480 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  26.91 
 
 		 487 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4932  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 480 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.828486  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  31.99 
 
 		 470 aa  111  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  33.61 
 
 		 462 aa  111  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 		 456 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 487 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 487 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  34.58 
 
 		 467 aa  110  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  30.15 
 
 		 476 aa  110  7.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 		 477 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 434 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  24.68 
 
 		 451 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  28.48 
 
 		 450 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  31.19 
 
 		 473 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6265  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 480 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4090  major facilitator superfamily metabolite(sugar)/H(+) symporter  33.88 
 
 		 471 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25.63 
 
 		 468 aa  108  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1565  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 480 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523471  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  33.18 
 
 		 449 aa  107  4e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  26.27 
 
 		 470 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3530  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 469 aa  107  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.56 
 
 		 468 aa  107  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  30.34 
 
 		 479 aa  107  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  32.65 
 
 		 460 aa  106  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  34.68 
 
 		 473 aa  106  8e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0808  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 		 494 aa  106  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0463  major facilitator transporter  25.21 
 
 		 448 aa  106  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0213055  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  27.04 
 
 		 423 aa  105  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  26.05 
 
 		 466 aa  105  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4630  major facilitator superfamily MFS_1  24.74 
 
 		 467 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  hitchhiker  0.00910919 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>