126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4962 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_4962  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 203 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.643195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4579  TetR family transcriptional regulator  99.51 
 
 		 203 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4667  TetR family transcriptional regulator  99.51 
 
 		 203 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.519146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1599  TetR family transcriptional regulator  78.79 
 
 		 198 aa  291  4e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5158  TetR family transcriptional regulator  77.78 
 
 		 198 aa  288  3e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.420731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10782  hypothetical protein  69.65 
 
 		 213 aa  274  5e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.882967 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1722  TetR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 194 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.287966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5714  TetR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 189 aa  117  9e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5095  TetR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0948615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5183  TetR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5474  TetR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.413213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3846  regulatory protein TetR  37.63 
 
 		 193 aa  112  5e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4585  TetR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 195 aa  102  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0832555  normal  0.934265 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  28.78 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3380  regulatory protein, TetR  28.79 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386273  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1348  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0410  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 212 aa  49.3  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 237 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 217 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 227 aa  49.3  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 208 aa  48.5  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 209 aa  48.1  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0184  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0724  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0595  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2679  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 233 aa  46.6  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.196743  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  26.82 
 
 		 208 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 187 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13075  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 226 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.576817 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1705  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164694  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 218 aa  45.8  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  26.84 
 
 		 201 aa  45.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  39.24 
 
 		 204 aa  45.8  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 191 aa  45.8  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2515  TetR family transcriptional regulator  20.57 
 
 		 202 aa  45.8  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 232 aa  45.4  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 222 aa  45.8  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  26.89 
 
 		 192 aa  45.8  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  32.1 
 
 		 193 aa  45.4  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  30 
 
 		 194 aa  45.4  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1996  regulatory protein TetR  24.16 
 
 		 215 aa  45.4  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 200 aa  45.4  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1262  hypothetical protein  35.82 
 
 		 233 aa  45.1  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.683399  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  28.38 
 
 		 205 aa  45.1  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 192 aa  45.1  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  20.97 
 
 		 205 aa  44.7  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2323  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 206 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.169023  normal  0.0173664 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2032  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.44645  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  28.57 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  24.66 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 239 aa  43.9  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2354  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0622512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2312  TetR family transcriptional regulator  20.79 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394535  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2270  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2530  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.828016  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3146  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.303801  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  32.94 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1694  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0960426 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  37.84 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0167  TetR family transcriptional regulator  22.37 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1772  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.706828  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1689  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0605741  hitchhiker  0.00000000000000310562 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2545  transcriptional regulator, TetR family  24.55 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.91976e-46 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4635  regulatory protein, TetR  25.81 
 
 		 226 aa  43.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1809  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300582  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0108  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 222 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1856  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 191 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1790  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.305772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0114  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 220 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.621262  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0191  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 243 aa  43.1  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00113557  decreased coverage  0.000257741 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1311  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 241 aa  42.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 204 aa  43.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 220 aa  42.4  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 185 aa  42.7  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 203 aa  42.4  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  30.87 
 
 		 224 aa  42.7  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 224 aa  42.7  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 203 aa  42.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 199 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  29.87 
 
 		 204 aa  42.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 229 aa  42.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4314  TetR family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 212 aa  42.4  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.316546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 209 aa  42.4  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>