More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3060 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3060  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 230 aa  461  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0482313 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3467  TetR family transcriptional regulator  85.33 
 
 		 228 aa  335  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4442  TetR family transcriptional regulator  78.26 
 
 		 229 aa  335  5e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4215  TetR family transcriptional regulator  78.76 
 
 		 229 aa  330  8e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.582437  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4281  TetR family transcriptional regulator  78.76 
 
 		 229 aa  330  8e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.439471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10234  TetR/AcrR family transcriptional regulator  74.01 
 
 		 229 aa  310  2e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3834  transcriptional regulator, TetR family  47.87 
 
 		 218 aa  189  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 218 aa  85.5  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23280  transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03740  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3140  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  25.43 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0969  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19098 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4675  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3834  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000963392 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3295  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 208 aa  62  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0322  transcriptional regulator, TetR family  25.99 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.541277 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1837  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2592  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000712719  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1584  transcriptional regulator, TetR family  24.22 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  27.56 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0081  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1444  transcriptional regulator, TetR family  21.95 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0101817  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0652  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00127288  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27950  transcriptional regulator  26.36 
 
 		 207 aa  57  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00827834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0097  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2456  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0797268  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0675  regulatory protein, TetR  48.15 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  40.4 
 
 		 259 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 186 aa  54.7  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 218 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5412  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00435132  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 210 aa  55.1  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  31.51 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0594  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0201579  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0771  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.353788  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5083  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2510  TetR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1468  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 190 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0639  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 220 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307578  hitchhiker  0.000146714 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  53.5  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4569  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 220 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000245113  hitchhiker  0.00602594 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 196 aa  53.5  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  35.38 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0634  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 220 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000435144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0683  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000557469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  25.62 
 
 		 204 aa  53.1  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 228 aa  52.8  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 204 aa  52.4  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1692  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 224 aa  52.4  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4876  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 208 aa  52.4  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0224524  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 212 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4003  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 242 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0419  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 217 aa  52.4  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00785696  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3958  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 242 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1859  transcriptional regulator  29.85 
 
 		 179 aa  52  0.000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 202 aa  51.6  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 211 aa  52  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  29.79 
 
 		 194 aa  51.6  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3699  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 220 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06672  hypothetical protein  32.39 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4638  putative transcriptional regulator, TetR family  27.4 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.856697 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1059  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.659814 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5376  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 445 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0622  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  51.6  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5245  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 251 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  22.88 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  21.38 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  26.88 
 
 		 264 aa  50.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6229  transcriptional regulator TetR family  28.75 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.93873  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0536  transcriptional regulator, TetR family  20.8 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.613933  normal  0.25181 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0705  regulatory protein, TetR  26.73 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  27.15 
 
 		 246 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1121  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>