137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0286 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  100 
 
 
282 aa  578  1e-164  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  64.16 
 
 
288 aa  355  3.9999999999999996e-97  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  60.96 
 
 
641 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  60.96 
 
 
642 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  49.46 
 
 
627 aa  275  6e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  54 
 
 
281 aa  271  1e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  48.91 
 
 
1290 aa  266  2.9999999999999995e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  50.83 
 
 
291 aa  248  1e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  46.24 
 
 
279 aa  242  6e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  48.46 
 
 
289 aa  236  4e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  49.4 
 
 
423 aa  236  4e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  48.79 
 
 
283 aa  228  8e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  48.24 
 
 
588 aa  223  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  45.77 
 
 
1321 aa  222  4.9999999999999996e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  48.79 
 
 
426 aa  221  8e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  48.18 
 
 
569 aa  215  5.9999999999999996e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  45.1 
 
 
633 aa  214  9.999999999999999e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  42.25 
 
 
274 aa  210  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  44.96 
 
 
883 aa  209  5e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  43.72 
 
 
383 aa  203  3e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  41.94 
 
 
389 aa  195  6e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  41.18 
 
 
252 aa  187  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  37.1 
 
 
328 aa  185  8e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  39.15 
 
 
276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  40.21 
 
 
503 aa  183  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  42.97 
 
 
409 aa  179  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  39.2 
 
 
556 aa  176  6e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  37.74 
 
 
384 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  41.11 
 
 
301 aa  171  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  41.26 
 
 
1694 aa  170  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1319  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.33 
 
 
358 aa  166  5e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  37.01 
 
 
286 aa  166  5e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0554  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.64 
 
 
532 aa  165  9e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  37.8 
 
 
1028 aa  164  2.0000000000000002e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  34.9 
 
 
394 aa  162  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  35.82 
 
 
694 aa  161  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  40.23 
 
 
1332 aa  159  7e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0919  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.27 
 
 
315 aa  158  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  37.79 
 
 
1059 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.03 
 
 
912 aa  156  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3929  glycoside hydrolase family 16  36.75 
 
 
271 aa  153  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4150  glycoside hydrolase family 16  32.97 
 
 
269 aa  152  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  39 
 
 
819 aa  152  7e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  37.41 
 
 
884 aa  152  8e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1608  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.68 
 
 
306 aa  149  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  36.7 
 
 
469 aa  149  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3121  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.34 
 
 
742 aa  149  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0247  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.44 
 
 
328 aa  149  5e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  31.21 
 
 
291 aa  148  9e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6737  glycoside hydrolase family 16  38.25 
 
 
286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0544  glycoside hydrolase family 16  36.21 
 
 
238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.673841 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2679  glycoside hydrolase family protein  36.43 
 
 
260 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  34.93 
 
 
330 aa  144  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  35.66 
 
 
752 aa  142  5e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2739  glycoside hydrolase family protein  37.02 
 
 
308 aa  142  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.77425  normal  0.433839 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  33.22 
 
 
1918 aa  135  8e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  38.06 
 
 
547 aa  135  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0724  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.46 
 
 
290 aa  132  5e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.337879 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.07 
 
 
261 aa  132  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4667  glycoside hydrolase family 16  35.17 
 
 
275 aa  132  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6434  glycoside hydrolase family 16  37.69 
 
 
286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  36.43 
 
 
1441 aa  129  7.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0875  glycoside hydrolase family 16  33.67 
 
 
313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4347  glycoside hydrolase family 16  32.25 
 
 
405 aa  125  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0666302  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  36.76 
 
 
427 aa  124  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4793  glycoside hydrolase family protein  36.46 
 
 
320 aa  118  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54973  endo-1,3-beta-glucosidase  32.9 
 
 
467 aa  118  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4931  glycoside hydrolase family protein  33.48 
 
 
465 aa  116  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  31.23 
 
 
1707 aa  113  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  30.45 
 
 
479 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0981  b-glucosidase  32.42 
 
 
334 aa  110  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.849748  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4533  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 
306 aa  109  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445894  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6224  endo-1,3-1,4-beta-glycanase, C-terminal secretion signal protein  29.66 
 
 
475 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380521  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4792  glycoside hydrolase family protein  31.38 
 
 
608 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3843  glycoside hydrolase family protein  31.64 
 
 
346 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0863  glycoside hydrolase family 16  28.11 
 
 
842 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0584  glycoside hydrolase family 16  27.3 
 
 
277 aa  101  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.824584  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  29.59 
 
 
907 aa  100  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  32.37 
 
 
479 aa  99.4  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  28.21 
 
 
464 aa  98.2  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3542  glycoside hydrolase family 16  27.31 
 
 
288 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06620  endo-1,3(4)-beta-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14540)  31.31 
 
 
388 aa  95.1  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.240126 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3954  glycoside hydrolase family 16  29.9 
 
 
318 aa  92  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.913325  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0724  beta-glucanase/beta-glucan synthetase-like protein  30.04 
 
 
295 aa  92  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.882839  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2108  glycoside hydrolase family 16  27.3 
 
 
319 aa  92  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.369089 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0560  glycoside hydrolase family 16  30.83 
 
 
263 aa  91.3  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.68 
 
 
639 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  32.91 
 
 
686 aa  90.5  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89444  predicted protein  28.78 
 
 
477 aa  90.1  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0724789  hitchhiker  0.00296553 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  30.63 
 
 
470 aa  89.7  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6754  glycoside hydrolase family protein  25.53 
 
 
284 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2578  glycoside hydrolase family protein  27.92 
 
 
277 aa  86.3  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164191  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3127  glycoside hydrolase family 16  28.08 
 
 
275 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0144  glycoside hydrolase family 16  27.54 
 
 
337 aa  83.6  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.568109  normal  0.0389127 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6178  glycoside hydrolase family 16  28.29 
 
 
329 aa  82  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474136  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0558  glycoside hydrolase family protein  28.19 
 
 
449 aa  81.6  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0874314  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3399  glycoside hydrolase family 16  27.31 
 
 
275 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.117609 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0392  glycoside hydrolase family 16  30.73 
 
 
691 aa  80.5  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  29 
 
 
446 aa  79.7  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  28.47 
 
 
469 aa  78.6  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>