More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2378 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01000  RND family efflux transporter  39.13 
 
 		 1044 aa  744    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.703446  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1848  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.81 
 
 		 1054 aa  655    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2384  AcrB/AcrD/AcrF family protein  39.33 
 
 		 1060 aa  724    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4648  AcrB/AcrD/AcrF family protein  40.62 
 
 		 1041 aa  768    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0945  AcrB/AcrD/AcrF family protein  38.68 
 
 		 1067 aa  777    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2166  acriflavin resistance protein  35.37 
 
 		 1060 aa  668    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  47.45 
 
 		 1052 aa  904    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0838  acriflavin resistance protein  39.41 
 
 		 1063 aa  781    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.64825  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2177  acriflavin resistance protein  34.57 
 
 		 1057 aa  647    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.754609  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0765  acriflavin resistance protein  39.36 
 
 		 1049 aa  748    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.114262 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2269  RND family efflux transporter  40.12 
 
 		 1039 aa  708    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3095  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.89 
 
 		 1093 aa  636    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.396369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3934  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  43.85 
 
 		 1042 aa  869    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0888  acriflavin resistance protein  38.89 
 
 		 1055 aa  777    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.869514 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2362  acriflavin resistance protein  54.55 
 
 		 1032 aa  1078    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000980319  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1710  acriflavin resistance protein  35.58 
 
 		 1060 aa  661    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0432348  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0890  acriflavin resistance protein  38.97 
 
 		 1053 aa  758    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0403  acriflavin resistance protein  35.27 
 
 		 1069 aa  635    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2469  acriflavin resistance protein  35.29 
 
 		 1073 aa  655    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.969761  normal  0.0970954 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0788  acriflavin resistance protein  39.38 
 
 		 1067 aa  775    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3648  acriflavin resistance protein  39.41 
 
 		 1063 aa  779    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3235  acriflavin resistance protein  39.4 
 
 		 1067 aa  776    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.890283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0658  acriflavin resistance protein  39.02 
 
 		 1050 aa  765    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1929  acriflavin resistance protein  35.16 
 
 		 1061 aa  652    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.323076  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6348  acriflavin resistance protein  46.62 
 
 		 1121 aa  914    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1895  acriflavin resistance protein  44.24 
 
 		 1051 aa  790    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.691491  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3454  acriflavin resistance protein  39.41 
 
 		 1063 aa  780    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2378  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1038 aa  2072    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0800  acriflavin resistance protein  38.99 
 
 		 1048 aa  785    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3338  acriflavin resistance protein  39.41 
 
 		 1067 aa  775    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0885  acriflavin resistance protein  39.36 
 
 		 1063 aa  787    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2744  AcrB/AcrD/AcrF family protein  39.77 
 
 		 1067 aa  761    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3529  acriflavin resistance protein  39.41 
 
 		 1063 aa  778    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4864  acriflavin resistance protein  44.47 
 
 		 1034 aa  830    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.120441 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4483  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.66 
 
 		 1074 aa  617  1e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0475  acriflavin resistance protein  36.42 
 
 		 1072 aa  619  1e-175  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06545  hypothetical protein  34.17 
 
 		 1052 aa  613  9.999999999999999e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02660  putative multidrug resistance protein, AcrB/AcrD/AcrF family  35.66 
 
 		 1056 aa  606  9.999999999999999e-173  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.814389  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3036  efflux transporter  36.91 
 
 		 1075 aa  604  1.0000000000000001e-171  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000668  RND multidrug efflux transporter  34.11 
 
 		 1050 aa  603  1.0000000000000001e-171  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644957  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2011  acriflavin resistance protein  34.33 
 
 		 1060 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0404797 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3677  acriflavin resistance protein  34.29 
 
 		 1053 aa  593  1e-168  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3597  acriflavin resistance protein  35.03 
 
 		 1068 aa  588  1e-166  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335598  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3188  acriflavin resistance protein  33.49 
 
 		 1033 aa  577  1.0000000000000001e-163  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.53306  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0308  acriflavin resistance protein  35.45 
 
 		 1050 aa  576  1.0000000000000001e-163  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0813  acriflavin resistance protein  34.19 
 
 		 1053 aa  560  1e-158  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1447  acriflavin resistance protein  34.47 
 
 		 1066 aa  557  1e-157  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.387723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1210  acriflavin resistance protein  35.4 
 
 		 1074 aa  558  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154202  normal  0.271752 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3901  acriflavin resistance protein  34.47 
 
 		 1041 aa  550  1e-155  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406058 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1563  acriflavin resistance protein  30.98 
 
 		 1041 aa  546  1e-154  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  34.22 
 
 		 1033 aa  545  1e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1975  acriflavin resistance protein  33.79 
 
 		 1062 aa  546  1e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.240252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0258  acriflavin resistance protein  34.53 
 
 		 1040 aa  539  9.999999999999999e-153  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.359322  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2936  acriflavin resistance protein  34.25 
 
 		 1053 aa  537  1e-151  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2915  acriflavin resistance protein  31.66 
 
 		 1035 aa  535  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.369342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1568  acriflavin resistance protein  33.71 
 
 		 1043 aa  531  1e-149  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.888167  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1842  acriflavin resistance protein  33.21 
 
 		 1098 aa  528  1e-148  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06541  hypothetical protein  30.57 
 
 		 1033 aa  524  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0709  RND family efflux transporter  33.14 
 
 		 1048 aa  524  1e-147  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0718585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1635  acriflavin resistance protein  32.65 
 
 		 1054 aa  523  1e-147  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.346585 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0380  integral membrane protein, AcrB/AcrD/AcrF family  30.93 
 
 		 1034 aa  524  1e-147  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2206  acriflavin resistance protein  30.57 
 
 		 1063 aa  526  1e-147  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.577957  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01595  RND family efflux transporter  32.14 
 
 		 1071 aa  523  1e-147  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1756  acriflavin resistance protein  30.34 
 
 		 1041 aa  523  1e-147  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3565  acriflavin resistance protein  31.47 
 
 		 1036 aa  521  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.909012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1057  acriflavin resistance protein  32.59 
 
 		 1035 aa  521  1e-146  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.828249  normal  0.914688 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3096  acriflavin resistance protein  31.35 
 
 		 1030 aa  521  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1733  acriflavin resistance protein  35.25 
 
 		 1064 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373856  normal  0.683525 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0243  acriflavin resistance protein  31.46 
 
 		 1054 aa  500  1e-140  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0292102  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1637  acriflavin resistance protein  31.23 
 
 		 1048 aa  495  9.999999999999999e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000116339  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2447  RND family efflux transporter  30.47 
 
 		 1053 aa  492  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0926263  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3898  acriflavin resistance protein  31.09 
 
 		 1131 aa  419  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.377402 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1066  acriflavin resistance protein  30.1 
 
 		 1035 aa  399  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0284295  hitchhiker  0.000200954 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1402  acriflavin resistance protein  30.18 
 
 		 1030 aa  394  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.335441 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3081  efflux transporter  31.65 
 
 		 1135 aa  395  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00863053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  27.83 
 
 		 1044 aa  379  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3066  acriflavin resistance protein  31.17 
 
 		 1137 aa  374  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  27.95 
 
 		 1038 aa  365  2e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  30.72 
 
 		 1043 aa  365  2e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  27.78 
 
 		 1050 aa  360  9.999999999999999e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  25.65 
 
 		 1191 aa  352  2e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3332  acriflavin resistance protein  27.54 
 
 		 1057 aa  350  6e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2050  acriflavin resistance protein  27.08 
 
 		 1069 aa  349  1e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440026  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4620  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.68 
 
 		 1052 aa  349  2e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2569  integral membrane protein, putative multidrug resistance protein  28.66 
 
 		 1042 aa  349  2e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0974879  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  26.61 
 
 		 1044 aa  347  1e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  26.86 
 
 		 1041 aa  339  9.999999999999999e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  27 
 
 		 1034 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1969  acriflavin resistance protein  26.04 
 
 		 1064 aa  338  2.9999999999999997e-91  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00241443  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  26.52 
 
 		 1092 aa  335  3e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2513  cation/multidrug efflux pump  26.41 
 
 		 1134 aa  335  3e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.422561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  26.52 
 
 		 1011 aa  334  5e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  27.96 
 
 		 1036 aa  333  8e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1499  resistance-nodulation-cell division family transporter  27.26 
 
 		 1005 aa  333  8e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3537  acriflavin resistance protein  29.51 
 
 		 1025 aa  332  2e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0823297  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  27.42 
 
 		 1043 aa  332  2e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  27.67 
 
 		 1046 aa  332  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  26.16 
 
 		 1009 aa  331  4e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  26.76 
 
 		 1071 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5504  acriflavin resistance protein  25.56 
 
 		 1146 aa  329  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39476  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>