More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2974 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2974  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 209 aa  424  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 223 aa  142  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  28.25 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  27.68 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5095  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.666558  normal  0.638711 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  27.78 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  23.15 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  24.71 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  22.51 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  28.05 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  21.69 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  25.29 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0242  transcriptional regulator, TetR family  23.56 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  25.73 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6157  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 193 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 235 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  24.62 
 
 		 229 aa  57  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  23.64 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5283  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  24.72 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0827  transcriptional regulator, TetR family  26.58 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6450  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.717411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  23.83 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  23.43 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1618  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  25.28 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 236 aa  54.7  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 248 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  20.43 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 247 aa  54.3  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  24.4 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1613  regulatory protein TetR  27.06 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00523  transcriptional regulator, TetR family protein  26.29 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0371  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1638  TetR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.181149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0119  TetR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000566826  decreased coverage  0.00000000000241144 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1499  TetR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  23.71 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1534  TetR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114781  normal  0.468022 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  23.37 
 
 		 184 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  23.37 
 
 		 184 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 234 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 203 aa  52  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2896  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 150 aa  52  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335686 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  23.59 
 
 		 217 aa  52  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1203  TetR family transcriptional regulator  22.78 
 
 		 203 aa  52  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 207 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3822  transcriptional regulator, TetR family  25.74 
 
 		 219 aa  52  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.526815  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4148  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 212 aa  52  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1779  regulatory protein TetR  25.91 
 
 		 208 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16684 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  22.56 
 
 		 184 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25800  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.2464 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 239 aa  51.6  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2204  putative transcriptional regulator  24.62 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1500  regulatory protein TetR  25.91 
 
 		 216 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.570959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 257 aa  51.6  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  22.01 
 
 		 249 aa  51.6  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 224 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1968  TetR family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000902359 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35360  transcriptional regulator  29.59 
 
 		 250 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1501  regulatory protein TetR  24.87 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0856799  normal  0.774912 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0524  transcriptional regulator, TetR family  22.83 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.576052  hitchhiker  0.0000164085 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  26.79 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 189 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>