101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2412 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2412  hypothetical protein  100 
 
 		 386 aa  740    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2307  putative transcriptional regulator, PucR family  32.81 
 
 		 365 aa  82.8  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2687  transcriptional regulator, CdaR  32.61 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2639  transcriptional regulator, CdaR  32.61 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2860  transcriptional regulator CdaR  32.61 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2728  transcriptional regulator, CdaR  32.61 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09280  Fis family regulatory protein  37.41 
 
 		 411 aa  56.6  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.739433  normal  0.888606 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06864  transcriptional regulator  33.1 
 
 		 376 aa  55.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  42.86 
 
 		 406 aa  55.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2802  Fis family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 384 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6696  putative transcriptional regulator, PucR family  37.5 
 
 		 410 aa  53.5  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 552 aa  52.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1423  transcriptional regulator, PucR family  37.09 
 
 		 456 aa  52  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal  0.788034 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 502 aa  51.6  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5234  putative DNA-binding protein  38.96 
 
 		 515 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5322  putative DNA-binding protein  38.96 
 
 		 515 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5614  putative DNA-binding protein  38.96 
 
 		 515 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  50 
 
 		 485 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  45.16 
 
 		 481 aa  51.2  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  35.1 
 
 		 515 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  41.94 
 
 		 486 aa  50.8  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2063  transcriptional regulator, PucR family  38.41 
 
 		 561 aa  50.4  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20553  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 558 aa  50.1  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  31.31 
 
 		 404 aa  50.1  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  35.66 
 
 		 486 aa  49.3  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1111  hypothetical protein  30.21 
 
 		 328 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  56.52 
 
 		 425 aa  49.3  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  47.37 
 
 		 515 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1203  hypothetical protein  36.9 
 
 		 453 aa  48.9  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129823 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 403 aa  48.5  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  50 
 
 		 554 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  50 
 
 		 554 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  48.15 
 
 		 525 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  50 
 
 		 554 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  54.55 
 
 		 538 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4083  putative carbohydrate diacid regulator  35.09 
 
 		 375 aa  48.1  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.329455 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  45.31 
 
 		 393 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  47.69 
 
 		 392 aa  48.5  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 429 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 429 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 429 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0936  hypothetical protein  32.5 
 
 		 412 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2218  PucR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 414 aa  47.4  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.025406  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  35.2 
 
 		 514 aa  47.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  35.51 
 
 		 459 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4050  putative carbohydrate diacid regulator  35.09 
 
 		 375 aa  47  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0113  transcriptional regulator, CdaR  34.48 
 
 		 375 aa  47.4  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1627  regulator of polyketide synthase expression  47.73 
 
 		 276 aa  47  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2075  hypothetical protein  41.77 
 
 		 414 aa  47  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300029  normal  0.31372 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3377  hypothetical protein  50 
 
 		 473 aa  47  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.541372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  37.41 
 
 		 540 aa  47  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  46.15 
 
 		 537 aa  47  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1722  transcriptional regulator, PucR family  44.07 
 
 		 502 aa  47  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  36.17 
 
 		 501 aa  46.6  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2411  putative transcriptional regulator, PucR family  35.64 
 
 		 417 aa  46.6  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000974619  hitchhiker  0.000254155 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3619  PucR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 408 aa  46.2  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000689812 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 494 aa  46.2  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0332  hypothetical protein  35.21 
 
 		 379 aa  45.8  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  31.76 
 
 		 425 aa  45.8  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12040  transcriptional regulator, CdaR family  51.85 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0292097  normal  0.187885 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1394  CdaR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 381 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  36.25 
 
 		 562 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2703  transcriptional regulator, CdaR  36.67 
 
 		 383 aa  45.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.601624  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  42.86 
 
 		 547 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  39.73 
 
 		 543 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4185  transcriptional regulator, CdaR  41.94 
 
 		 392 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 537 aa  45.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  40.91 
 
 		 504 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  32.35 
 
 		 520 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3797  hypothetical protein  35.54 
 
 		 495 aa  44.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00410976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3547  CdaR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 532 aa  44.7  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1140  transcriptional regulator, CdaR  30.77 
 
 		 377 aa  44.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000252697 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23280  hypothetical protein  47.92 
 
 		 512 aa  44.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  37.68 
 
 		 739 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  45.28 
 
 		 493 aa  44.3  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  36.67 
 
 		 558 aa  44.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  30.77 
 
 		 618 aa  44.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5059  putative transcriptional regulator, PucR family  40.48 
 
 		 395 aa  44.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2598  transcriptional regulator CdaR  48.08 
 
 		 511 aa  44.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0076  transcriptional regulator, CdaR  48.33 
 
 		 611 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.105438  normal  0.388356 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  49.02 
 
 		 519 aa  44.3  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  34.02 
 
 		 501 aa  44.3  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03504  sugar diacide regulator  34.41 
 
 		 168 aa  44.3  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  46 
 
 		 418 aa  44.3  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 517 aa  44.3  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  46.3 
 
 		 413 aa  43.9  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4754  putative transcriptional regulator, PucR family  37.97 
 
 		 416 aa  43.9  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2205  putative transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 505 aa  43.9  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0290612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  30.77 
 
 		 505 aa  43.9  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  40 
 
 		 429 aa  43.5  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0764  putative transcriptional regulator, PucR family  32.8 
 
 		 311 aa  43.1  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.829875  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5328  putative transcriptional regulator, PucR family  42.19 
 
 		 479 aa  43.1  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2630  transcriptional regulator, PucR family  39 
 
 		 528 aa  43.5  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0196857  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0879  hypothetical protein  46.3 
 
 		 384 aa  43.1  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0278062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  36.51 
 
 		 404 aa  43.1  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  48.08 
 
 		 529 aa  43.1  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1518  transcriptional regulator, CdaR  35 
 
 		 385 aa  43.1  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3370  putative transcriptional regulator, PucR family  35.77 
 
 		 460 aa  42.7  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00329007  normal  0.365111 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3130  transcriptional regulator, CdaR  36.67 
 
 		 382 aa  42.7  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>