More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0208 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0208  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 193 aa  378  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0755  putative transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 210 aa  77.8  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5333  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4085  putative transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0209  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14890  transcriptional regulator, tetR family  31.9 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0325223  normal  0.0343336 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3660  transcriptional regulator, TetR family  37.27 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.880035  normal  0.502238 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  59.65 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2422  transcriptional regulator, TetR family  37.9 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.789804  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  40.4 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  42.27 
 
 		 207 aa  62  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  57.89 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4278  transcriptional regulator, TetR family  54.24 
 
 		 199 aa  61.2  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  38.39 
 
 		 193 aa  61.2  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  57.63 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2768  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5092  transcriptional regulator, TetR family  33.99 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.193405 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  35.06 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4064  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.528803  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1327  transcriptional regulator, TetR family  46.58 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8649  regulatory protein TetR  37.41 
 
 		 185 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6310  putative transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 185 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.523655  normal  0.0800729 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 173 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  47.69 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0429  transcriptional regulator, TetR family  50.88 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5576  transcriptional regulator, TetR family  31.74 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.440854 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0423  transcriptional regulator, TetR family  39.18 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.567311  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  39 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4980  regulatory protein TetR  31.52 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432657  normal  0.695564 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7432  transcriptional regulator, TetR family  34.45 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  34.41 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4273  regulatory protein TetR  30.77 
 
 		 190 aa  53.9  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.532743  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0144  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 186 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21920  transcriptional regulator  53.33 
 
 		 191 aa  53.9  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.048177  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0928  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  49.35 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1664  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354997  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  53.33 
 
 		 299 aa  53.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27910  transcriptional regulator, tetR family  32.45 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.794272 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 266 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  42.55 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2459  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 198 aa  52.4  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.285748  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2000  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  23.58 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 219 aa  52  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2615  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 216 aa  52  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2994  TetR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 231 aa  52  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  50 
 
 		 190 aa  51.6  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 188 aa  51.6  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 206 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 194 aa  51.2  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 188 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3350  transcriptional regulator, TetR family  25.86 
 
 		 199 aa  51.2  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5370  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 187 aa  51.2  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  30.98 
 
 		 203 aa  51.2  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0927  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.468026  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5356  transcriptional regulator, TetR family  39.56 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 223 aa  50.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 176 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 223 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2557  transcriptional regulator, TetR family  36.52 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  50.88 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  35.97 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1993  transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8897  transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1988  transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6422  putative transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790445 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3865  transcriptional regulator, TetR family protein  28.21 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  39.81 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>