More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0190 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1211  type II and III secretion system protein  98.95 
 
 		 380 aa  746    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0190  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 380 aa  753    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0347  type II and III secretion system protein  42.93 
 
 		 391 aa  298  1e-79  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000362536  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2274  protein yitk  96.74 
 
 		 128 aa  173  3.9999999999999995e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.555431  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1100  ABC transporter ATP-binding protein YojI  27 
 
 		 389 aa  94  4e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0019  hypothetical protein  27 
 
 		 389 aa  94  4e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0078  general secretion pathway protein D  27.37 
 
 		 660 aa  82  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003452  putative maturation protein  24.11 
 
 		 353 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.171199  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2024  general secretion pathway protein D  23.22 
 
 		 779 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0993324 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0683  general secretion pathway protein D  25.9 
 
 		 641 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00528314  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1329  type II and III secretion system protein  24.44 
 
 		 747 aa  70.5  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16070  general secretion pathway protein D  23.74 
 
 		 752 aa  70.1  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1457  type II and III secretion system protein  26.36 
 
 		 395 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.447998  normal  0.0646338 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1968  type II and III secretion system protein  30.85 
 
 		 506 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.150823  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1791  general secretion pathway protein D  24.11 
 
 		 784 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1281  general secretion pathway protein D  26.38 
 
 		 648 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4150  general secretion pathway protein D  25.2 
 
 		 829 aa  67  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0456168  hitchhiker  0.0000162446 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1112  competence protein E  25.63 
 
 		 377 aa  66.6  0.0000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0144354  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3141  type II and III secretion system protein:NolW-like  25.58 
 
 		 776 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.529282  normal  0.96586 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2693  type II and III secretion system protein  24.73 
 
 		 479 aa  65.5  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000595981  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0756  general secretion pathway protein D  24.55 
 
 		 738 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1698  type II/III secretion system protein  24.37 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2703  type II and III secretion system protein  26.71 
 
 		 386 aa  65.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1699  type II and III secretion system protein  23.12 
 
 		 387 aa  64.3  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0103666  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0609  general secretion pathway protein D  23.25 
 
 		 635 aa  64.7  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.73081e-17 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2924  general secretion pathway protein D  23.93 
 
 		 675 aa  63.5  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3364  type II and III secretion system protein:NolW-like  24.64 
 
 		 636 aa  63.2  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000168391  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001892  general secretion pathway protein D/type II secretion outermembrane pore forming protein (PulD)  22.74 
 
 		 672 aa  62.8  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3307  general secretion pathway protein D  25 
 
 		 763 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.335208  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1227  PP family ATPase  30.56 
 
 		 508 aa  62.8  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0233  type II and III secretion system protein  24.57 
 
 		 491 aa  62  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0542  type II and III secretion system protein  24.06 
 
 		 702 aa  62.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1836  type II and III secretion system protein  25.95 
 
 		 494 aa  62.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1007  type II and III secretion system protein  27.41 
 
 		 512 aa  62  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0097  general secretion pathway protein D  24.09 
 
 		 662 aa  62.4  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.395857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0667  general secretion pathway protein D  23.08 
 
 		 781 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.509623 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1309  general secretion pathway protein D  22.39 
 
 		 819 aa  61.6  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0418049  normal  0.0430257 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0595  general secretion pathway protein D  23.9 
 
 		 630 aa  62  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.788546  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1057  type II and III secretion system protein  25.48 
 
 		 451 aa  61.6  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0322  outer membrane porin HofQ  23.67 
 
 		 386 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000700239  normal  0.175294 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3587  outer membrane porin HofQ  23.67 
 
 		 412 aa  62  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000785668  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1626  type II and III secretion system protein  23.46 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1994  type II and III secretion system protein  24.83 
 
 		 499 aa  61.2  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0646  general secretion pathway protein D  23.08 
 
 		 781 aa  61.2  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255398  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0045  type III secretion protein SctC  25.56 
 
 		 672 aa  60.8  0.00000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3204  type II and III secretion system protein  24.84 
 
 		 451 aa  60.8  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.154583 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1784  type II and III secretion system protein  20.52 
 
 		 479 aa  60.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3768  outer membrane porin HofQ  23.27 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000640301  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0735  type II and III secretion system protein  33.58 
 
 		 509 aa  60.5  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1622  type II and III secretion system protein  22.5 
 
 		 673 aa  60.5  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03243  predicted fimbrial transporter  23.27 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00734996  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0322  type IV pilus secretin PilQ  23.27 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000212409  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3427  general secretion pathway protein D  23.6 
 
 		 753 aa  60.1  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000756806 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4695  outer membrane porin HofQ  23.27 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00163721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3861  outer membrane porin HofQ  23.27 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000844499  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03195  hypothetical protein  23.27 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0104711  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3804  outer membrane porin HofQ  22.22 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0625572  normal  0.855535 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3687  outer membrane porin HofQ  23.46 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00260345  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3760  outer membrane porin HofQ  23.46 
 
 		 426 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00726017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5069  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  24.7 
 
 		 512 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.240332 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3667  outer membrane porin HofQ  22.95 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000045876  normal  0.0733814 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2609  putative general secretion pathway protein D  22.48 
 
 		 780 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3025  type II/III secretion system protein  20.88 
 
 		 576 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3794  outer membrane porin HofQ  23.46 
 
 		 426 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0667  type IV pilus secretin PilQ  23.77 
 
 		 580 aa  58.9  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00540746  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3403  type IV pilus secretin PilQ  23.83 
 
 		 726 aa  57.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.613607 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03956  general secretion pathway protein D  24.16 
 
 		 681 aa  57.4  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3713  type II and III secretion system protein  22.27 
 
 		 492 aa  57.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1438  type II and III secretion system protein  21.15 
 
 		 812 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12402  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2028  type IV pilus biogenesis protein PilQ  22.78 
 
 		 894 aa  57  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0895  type II and III secretion system protein  21.63 
 
 		 475 aa  57  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.276547  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0917  general secretion pathway protein D  24.47 
 
 		 810 aa  57  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.460737  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0648  type II and III secretion system protein  25.95 
 
 		 422 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1587  general secretion pathway protein D  20.96 
 
 		 801 aa  56.6  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.089404 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0975  type II and III secretion system secretin  29.17 
 
 		 870 aa  56.6  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.338671 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0231  general secretion pathway protein D  27.15 
 
 		 689 aa  56.6  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0294  type IV pilus secretin PilQ  21.17 
 
 		 573 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.882341 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02838  GspD, hypothetical type II secretion protein  22.87 
 
 		 686 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000664316  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0329  general secretion pathway protein D, putative  23.1 
 
 		 632 aa  55.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.989309  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3247  general secretion pathway protein GspD  22.87 
 
 		 686 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4591  general secretion pathway protein D  26.06 
 
 		 697 aa  55.8  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3138  general secretion pathway protein D  22.87 
 
 		 686 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3427  general secretion pathway protein D  22.87 
 
 		 686 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2173  general secretion pathway protein D  23.53 
 
 		 745 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3520  type II and III secretion system protein  21.24 
 
 		 480 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02788  hypothetical protein  22.87 
 
 		 686 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000655056  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3236  type II and III secretion system protein  22.91 
 
 		 711 aa  55.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.284362  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0381  general secretion pathway protein D  22.18 
 
 		 650 aa  55.8  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.693227  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3067  general secretion pathway protein D  20.55 
 
 		 803 aa  55.8  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0574712  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0667  type II and III secretion system protein  22.32 
 
 		 478 aa  56.2  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703933  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0703  type IV pilus secretin PilQ  20.85 
 
 		 696 aa  55.1  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853833  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02977  putative GSPD-related protein  25.62 
 
 		 754 aa  55.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.220061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2370  general secretion pathway protein D  22.22 
 
 		 670 aa  55.1  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2072  type II and III secretion system protein  25.3 
 
 		 492 aa  55.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00565214  normal  0.624153 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0109  type II and III secretion system protein  25.28 
 
 		 547 aa  55.1  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.379094  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3347  type II and III secretion system protein  29.65 
 
 		 549 aa  55.5  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.292077  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29100  type II and III secretion system protein  25.42 
 
 		 614 aa  55.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0223781  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3529  general secretion pathway protein D  21.98 
 
 		 740 aa  55.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1035  type II and III secretion system protein  21.16 
 
 		 1421 aa  55.1  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1791  type II and III secretion system protein  20.14 
 
 		 524 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.561359 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>