274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_0347 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0347  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 391 aa  775    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000362536  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1211  type II and III secretion system protein  43.08 
 
 		 380 aa  300  3e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0190  type II and III secretion system protein  42.93 
 
 		 380 aa  298  1e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2274  protein yitk  59.3 
 
 		 128 aa  102  8e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.555431  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0019  hypothetical protein  28.47 
 
 		 389 aa  93.2  6e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1100  ABC transporter ATP-binding protein YojI  28.47 
 
 		 389 aa  93.2  6e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0078  general secretion pathway protein D  31.33 
 
 		 660 aa  79.7  0.00000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4150  general secretion pathway protein D  29.09 
 
 		 829 aa  67  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0456168  hitchhiker  0.0000162446 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2408  type II and III secretion system protein  24.48 
 
 		 502 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0667  general secretion pathway protein D  27.3 
 
 		 781 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.509623 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1309  general secretion pathway protein D  24.14 
 
 		 819 aa  64.3  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0418049  normal  0.0430257 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0063  general secretion pathway protein D  30.72 
 
 		 775 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0062  general secretion pathway protein D  30.12 
 
 		 771 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0052  general secretion pathway protein D  30.12 
 
 		 777 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2662  general secretion pathway protein D  30.06 
 
 		 757 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2786  general secretion pathway protein D  30.06 
 
 		 757 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.136433  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0220  general secretion pathway protein D  30.06 
 
 		 750 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.960002  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1890  general secretion pathway protein D  30.06 
 
 		 757 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.189433  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0007  general secretion pathway protein D  30.06 
 
 		 757 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3518  general secretion pathway protein D  30.06 
 
 		 757 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0007  general secretion pathway protein D  30.06 
 
 		 757 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0008  Type II secretion system gspD  30.12 
 
 		 774 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0062  general secretion pathway protein D  30.12 
 
 		 774 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348368  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0646  general secretion pathway protein D  26.95 
 
 		 781 aa  63.2  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255398  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2529  general secretion pathway protein D  23.86 
 
 		 728 aa  63.2  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151487  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0735  type II and III secretion system protein  31.08 
 
 		 509 aa  62.4  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2480  type II and III secretion system protein  24.48 
 
 		 502 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.906186 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3247  general secretion pathway protein GspD  24.23 
 
 		 686 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0081  general secretion pathway protein D  29.38 
 
 		 780 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4403  type II and III secretion system protein  28.4 
 
 		 495 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0742  type II and III secretion system protein  24.32 
 
 		 773 aa  60.5  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0231  general secretion pathway protein D  26.88 
 
 		 689 aa  60.1  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0917  general secretion pathway protein D  29.35 
 
 		 810 aa  60.1  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.460737  normal  0.382842 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02838  GspD, hypothetical type II secretion protein  27.95 
 
 		 686 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000664316  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1856  fimbrial assembly protein  22.98 
 
 		 630 aa  59.3  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0231369  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1785  type IV pilus secretin PilQ  22.98 
 
 		 636 aa  58.9  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0622717  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02788  hypothetical protein  27.95 
 
 		 686 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000655056  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3427  general secretion pathway protein D  27.95 
 
 		 686 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3138  general secretion pathway protein D  27.95 
 
 		 686 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3427  general secretion pathway protein D  29.88 
 
 		 753 aa  58.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000756806 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0542  type II and III secretion system protein  27.98 
 
 		 702 aa  58.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1836  type II and III secretion system protein  28.14 
 
 		 494 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2370  general secretion pathway protein D  30.34 
 
 		 670 aa  58.5  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003452  putative maturation protein  23.83 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.171199  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0609  general secretion pathway protein D  28.57 
 
 		 635 aa  58.2  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.73081e-17 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3529  general secretion pathway protein D  29.49 
 
 		 740 aa  58.2  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16070  general secretion pathway protein D  28.66 
 
 		 752 aa  57  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3244  type II and III secretion system protein  28.22 
 
 		 781 aa  57  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.549479 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0007  general secretion pathway protein D  28.31 
 
 		 744 aa  57  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4501  putative general secretory pathway protein D  29.52 
 
 		 814 aa  57  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1699  type II and III secretion system protein  21.75 
 
 		 387 aa  57  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0103666  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001892  general secretion pathway protein D/type II secretion outermembrane pore forming protein (PulD)  29.85 
 
 		 672 aa  56.6  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00601  general secretion pathway protein D  29.85 
 
 		 658 aa  56.6  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1281  general secretion pathway protein D  28.97 
 
 		 648 aa  56.6  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1057  type II and III secretion system protein  27.91 
 
 		 451 aa  56.6  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0250  type II and III secretion system protein  26.78 
 
 		 703 aa  56.2  0.0000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.980463  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0045  type III secretion protein SctC  28.32 
 
 		 672 aa  55.5  0.000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3936  general secretion pathway protein D  28.92 
 
 		 791 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.765741 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0683  general secretion pathway protein D  26.54 
 
 		 641 aa  55.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00528314  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2072  type II and III secretion system protein  25.81 
 
 		 492 aa  55.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00565214  normal  0.624153 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2703  type II and III secretion system protein  28.14 
 
 		 386 aa  55.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3687  outer membrane porin HofQ  24.12 
 
 		 389 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00260345  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5409  type II and III secretion system protein  23.73 
 
 		 469 aa  55.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.28985  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3794  outer membrane porin HofQ  24.12 
 
 		 426 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566687  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1332  type II and III secretion system protein  24.68 
 
 		 771 aa  55.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.106415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4248  type II and III secretion system protein  23.73 
 
 		 454 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.218711 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1329  type II and III secretion system protein  25.09 
 
 		 747 aa  55.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3204  type II and III secretion system protein  26.74 
 
 		 451 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.154583 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3760  outer membrane porin HofQ  24.12 
 
 		 426 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00726017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03956  general secretion pathway protein D  28.57 
 
 		 681 aa  55.5  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2027  general secretion pathway protein D  31.11 
 
 		 649 aa  55.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4358  type II and III secretion system protein  23.73 
 
 		 454 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.970058 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5697  general secretion pathway protein D  30.18 
 
 		 787 aa  54.3  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0549216 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0595  general secretion pathway protein D  28 
 
 		 630 aa  54.3  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.788546  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4606  putative outer membrane porin HofQ  21.13 
 
 		 413 aa  53.9  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000951162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2703  type II and III secretion system protein  22.69 
 
 		 499 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2028  type IV pilus biogenesis protein PilQ  27.41 
 
 		 894 aa  53.5  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0054  type III secretion outer membrane pore YscC  25.82 
 
 		 612 aa  53.9  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1747  Flp pilus assembly protein CpaC  27.04 
 
 		 507 aa  53.9  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7395  general secretion pathway protein D  26.67 
 
 		 717 aa  53.9  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103776  normal  0.699876 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1035  type II and III secretion system protein  24.02 
 
 		 1421 aa  53.9  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2924  general secretion pathway protein D  29.85 
 
 		 675 aa  53.9  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0381  general secretion pathway protein D  25.3 
 
 		 650 aa  53.5  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.693227  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3658  general secretion pathway protein D  24.38 
 
 		 793 aa  53.5  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1626  type II and III secretion system protein  21.03 
 
 		 387 aa  53.5  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3070  general secretion pathway protein D  29.52 
 
 		 787 aa  53.1  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00279328 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1814  type IV pilus secretin PilQ  21.78 
 
 		 944 aa  53.5  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2915  type II and III secretion system protein  24.54 
 
 		 484 aa  52.8  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2609  putative general secretion pathway protein D  24.64 
 
 		 780 aa  52.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2542  type II/III secretion system protein  24.86 
 
 		 441 aa  52.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1622  type II and III secretion system protein  23.46 
 
 		 673 aa  52.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2827  type II and III secretion system protein  24.54 
 
 		 487 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.863407  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0667  type IV pilus secretin PilQ  24.68 
 
 		 580 aa  52.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00540746  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02594  outer membrane channel signal peptide protein  22.6 
 
 		 454 aa  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4851  bacterial type II/III secretion system protein  27.17 
 
 		 419 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1439  type II secretion system protein D  28.76 
 
 		 656 aa  52  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0989759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0618  type II and III secretion system protein  24.28 
 
 		 634 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00736959  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1041  general secretion pathway protein D  28.47 
 
 		 799 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0180927  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2457  type II and III secretion system protein  24.52 
 
 		 723 aa  51.6  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.345302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3020  Type II secretory pathway component PulD-like protein  28.31 
 
 		 696 aa  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000150174  decreased coverage  0.00000000799268 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>