32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_2274 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_2274  protein yitk  100 
 
 		 128 aa  253  9e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.555431  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0190  type II and III secretion system protein  96.74 
 
 		 380 aa  173  7e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1211  type II and III secretion system protein  93.48 
 
 		 380 aa  167  4e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0347  type II and III secretion system protein  59.3 
 
 		 391 aa  102  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000362536  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4150  general secretion pathway protein D  34.48 
 
 		 829 aa  46.2  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0456168  hitchhiker  0.0000162446 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2024  general secretion pathway protein D  25 
 
 		 779 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0993324 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1699  type II and III secretion system protein  38.6 
 
 		 387 aa  43.5  0.0009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0103666  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1277  general secretion pathway protein D  30.95 
 
 		 751 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2609  putative general secretion pathway protein D  35.71 
 
 		 780 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4170  type II and III secretion system protein  38.03 
 
 		 743 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16070  general secretion pathway protein D  28.79 
 
 		 752 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4210  type II and III secretion system protein  38.03 
 
 		 899 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1029  Type II secretory pathway component PulD-like  48.57 
 
 		 588 aa  42.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0448021 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1265  type II and III secretion system protein  28.83 
 
 		 1519 aa  42  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00244048  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1698  type II/III secretion system protein  34.92 
 
 		 406 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1994  type II and III secretion system protein  29.49 
 
 		 499 aa  41.6  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1791  general secretion pathway protein D  25 
 
 		 784 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1384  type II and III secretion system protein  33.93 
 
 		 563 aa  41.2  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.157655  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0975  type II and III secretion system secretin  31.82 
 
 		 870 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.338671 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1836  type II and III secretion system protein  34.55 
 
 		 494 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1626  type II and III secretion system protein  38.78 
 
 		 387 aa  40.8  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1791  type II and III secretion system protein  27.63 
 
 		 524 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.561359 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0742  type II and III secretion system protein  34 
 
 		 773 aa  40.4  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1027  type II and III secretion system protein  30.99 
 
 		 552 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.40658 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3728  putative outer membrane porin HofQ  34.33 
 
 		 500 aa  40.4  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000295342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0224  putative outer membrane porin HofQ  34.33 
 
 		 460 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000817003  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1587  general secretion pathway protein D  23.94 
 
 		 801 aa  40.4  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.089404 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3067  general secretion pathway protein D  23.94 
 
 		 803 aa  40.4  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0574712  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2665  type IV pilus secretin PilQ  32.39 
 
 		 926 aa  40.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000377004 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3967  putative outer membrane porin HofQ  34.33 
 
 		 458 aa  40  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1457  type II and III secretion system protein  29.89 
 
 		 395 aa  40  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.447998  normal  0.0646338 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0639  type II and III secretion system protein  31.94 
 
 		 569 aa  40  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>