More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1027 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1027  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 552 aa  1122    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.40658 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1791  type II and III secretion system protein  72.03 
 
 		 524 aa  772    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.561359 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1994  type II and III secretion system protein  38.12 
 
 		 499 aa  329  9e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1406  type II and III secretion system protein  37.35 
 
 		 538 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.7882  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0735  fimbrial assembly protein PilQ, putative  30.69 
 
 		 784 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0883  type IV pilus secretin PilQ  30.69 
 
 		 784 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.126317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0252  type IV pilus secretin PilQ  32.31 
 
 		 1269 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.760209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1941  type IV pilus secretin PilQ  31.9 
 
 		 729 aa  198  3e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.77071  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0407  type II and III secretion system protein:NolW-like:NolW-like  31.34 
 
 		 718 aa  196  7e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1814  type IV pilus secretin PilQ  29.33 
 
 		 944 aa  196  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0612  type II and III secretion system protein  30.06 
 
 		 668 aa  194  4e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0385351  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0409  type II and III secretion system protein  30.07 
 
 		 692 aa  192  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714943  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5128  type IV pilus biogenesis protein PilQ  30.18 
 
 		 718 aa  189  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.981082  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0667  type IV pilus secretin PilQ  28.94 
 
 		 580 aa  188  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00540746  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0690  type IV pilus secretin PilQ  31.56 
 
 		 893 aa  187  5e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0975  type II and III secretion system secretin  30.21 
 
 		 870 aa  186  9e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.338671 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1473  type II and III secretion system protein  30.77 
 
 		 808 aa  186  9e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.401194  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2028  type IV pilus biogenesis protein PilQ  28.83 
 
 		 894 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0546  type IV pilus secretin PilQ  29.51 
 
 		 706 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45260  secretion system protein  29.61 
 
 		 717 aa  184  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1644  type IV pilus secretin PilQ  29.87 
 
 		 891 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5130  type IV pilus secretin PilQ  30.14 
 
 		 420 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.916141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66620  type 4 fimbrial biogenesis outer membrane protein PilQ precursor  29.09 
 
 		 710 aa  183  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.601921  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0471  type IV pilus biogenesis protein PilQ  29.59 
 
 		 706 aa  182  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0679  type IV pilus secretin PilQ  31.64 
 
 		 887 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00511  putative type IV pilus biogenesis protein PilQ (cytoplasmic ATPase)  29.55 
 
 		 547 aa  182  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.440225  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0679  type IV pilus secretin PilQ  31.42 
 
 		 887 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0329  type IV pilus secretin PilQ  30.23 
 
 		 987 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00519282  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0993  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  28.41 
 
 		 698 aa  180  5.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0962  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  28.41 
 
 		 698 aa  180  5.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0645  type II and III secretion system protein, secretin  30.6 
 
 		 882 aa  179  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2665  type IV pilus secretin PilQ  28.11 
 
 		 926 aa  177  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000377004 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0996  type IV pilus secretin PilQ  28.64 
 
 		 864 aa  176  8e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0279  type IV pilus secretin PilQ  29.89 
 
 		 710 aa  176  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.881103 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5777  type 4 fimbrial biogenesis protein PilQ  29.86 
 
 		 714 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1550  type IV pilus secretin PilQ  28.01 
 
 		 946 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0337  putative outer membrane porin HofQ  28.64 
 
 		 426 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0259  putative outer membrane porin HofQ  28.28 
 
 		 433 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0738011  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3369  type IV pilus biogenesis protein PilQ  28.54 
 
 		 685 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000110691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4953  type IV pilus secretin PilQ  29.89 
 
 		 420 aa  174  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4606  putative outer membrane porin HofQ  27.73 
 
 		 413 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000951162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3599  type IV pilus secretin PilQ  29.16 
 
 		 591 aa  172  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00505018  hitchhiker  0.0000000614182 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3249  type IV pilus secretin PilQ  30.46 
 
 		 721 aa  172  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2902  type IV pilus secretin PilQ  30.46 
 
 		 721 aa  172  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.123013 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0386  type IV pilus secretin PilQ  30.23 
 
 		 422 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.591623  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5080  type IV pilus secretin PilQ  29.66 
 
 		 420 aa  171  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4114  type IV pilus secretin PilQ  27.46 
 
 		 683 aa  170  6e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000574817  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0830  type IV pilus secretin PilQ  28.48 
 
 		 704 aa  169  8e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3794  outer membrane porin HofQ  28.06 
 
 		 426 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566687  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0285  type IV pilus biogenesis protein PilQ  27.88 
 
 		 684 aa  169  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0339  type IV pilus secretin PilQ  28.57 
 
 		 682 aa  168  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.201727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0358  putative fimbrial type-4 assembly signal peptide, PilQ-like  29.16 
 
 		 567 aa  168  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4085  type IV pilus secretin PilQ  27.23 
 
 		 683 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000349051  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0212  type IV pilus secretin PilQ  27.43 
 
 		 683 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00466535  normal  0.0124909 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4004  type IV pilus secretin PilQ  27.23 
 
 		 683 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0761872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3687  outer membrane porin HofQ  27.99 
 
 		 389 aa  168  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00260345  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4203  type IV pilus secretin PilQ  27.23 
 
 		 683 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0392005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0237  type IV pilus secretin PilQ  28.34 
 
 		 688 aa  167  4e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00361408  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0246  type IV pilus secretin PilQ  27.19 
 
 		 684 aa  167  4e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0240868  normal  0.818233 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3768  outer membrane porin HofQ  28.05 
 
 		 412 aa  167  5e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000640301  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3699  type IV pilus secretin PilQ  27.42 
 
 		 684 aa  167  5e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0929214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2759  type IV pilus secretin PilQ  28.67 
 
 		 694 aa  167  5.9999999999999996e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3707  type IV pilus secretin PilQ  27.23 
 
 		 683 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000259618  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3895  type IV pilus secretin PilQ  27.19 
 
 		 684 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000037843  normal  0.221034 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0260  type II and III secretion system protein  27.69 
 
 		 683 aa  166  8e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0149994  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2795  type IV pilus secretin PilQ  29.45 
 
 		 523 aa  166  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.747994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3760  outer membrane porin HofQ  27.58 
 
 		 426 aa  166  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00726017  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0322  type IV pilus secretin PilQ  28.05 
 
 		 412 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000212409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3861  outer membrane porin HofQ  28.05 
 
 		 412 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000844499  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3587  outer membrane porin HofQ  28.05 
 
 		 412 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000785668  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4695  outer membrane porin HofQ  28.05 
 
 		 412 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00163721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3667  outer membrane porin HofQ  28.28 
 
 		 412 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000045876  normal  0.0733814 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0734  type IV pilus secretin PilQ  28.73 
 
 		 696 aa  164  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0375525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0018  type IV pilus secretin PilQ  29 
 
 		 712 aa  164  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.845155 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2687  peptidase M41, FtsH  28.82 
 
 		 727 aa  164  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00137304  normal  0.0272245 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03243  predicted fimbrial transporter  27.83 
 
 		 412 aa  163  7e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00734996  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03195  hypothetical protein  27.83 
 
 		 412 aa  163  7e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0104711  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3804  outer membrane porin HofQ  28.74 
 
 		 413 aa  163  9e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0625572  normal  0.855535 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0703  type IV pilus secretin PilQ  28.51 
 
 		 696 aa  162  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853833  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2923  type II and III secretion system protein  28.76 
 
 		 710 aa  162  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0735  type II and III secretion system protein  27.45 
 
 		 509 aa  161  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2748  type II/III secretion system protein  28.93 
 
 		 527 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2798  type II/III secretion system protein  28.93 
 
 		 462 aa  162  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1756  type II/III secretion system protein  28.93 
 
 		 616 aa  162  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2207  fimbrial assembly protein  28.73 
 
 		 578 aa  161  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000276691  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3759  type IV pilus secretin PilQ  28.93 
 
 		 465 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.180527  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3205  type II/III secretion system protein  28.93 
 
 		 462 aa  162  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.278596  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0374  type IV pilus secretin PilQ  28.23 
 
 		 682 aa  161  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0344612  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3701  type IV pilus secretin PilQ  28.93 
 
 		 462 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0441702  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3730  type II/III secretion system protein  28.93 
 
 		 575 aa  161  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.605759  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0322  outer membrane porin HofQ  27.76 
 
 		 386 aa  161  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000700239  normal  0.175294 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2971  fimbrial type-4 assembly signal peptide protein  28.82 
 
 		 714 aa  160  5e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3236  type IV pilus secretin PilQ  28 
 
 		 657 aa  160  5e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0831475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1856  fimbrial assembly protein  29.01 
 
 		 630 aa  160  7e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0231369  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1980  type IV pilus secretin PilQ  28.34 
 
 		 693 aa  160  7e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0209745  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1785  type IV pilus secretin PilQ  29.23 
 
 		 636 aa  160  8e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0622717  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4062  putative outer membrane porin HofQ  27.99 
 
 		 424 aa  160  8e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000610431  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2457  type II and III secretion system protein  28.17 
 
 		 723 aa  159  9e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.345302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3268  type II and III secretion system protein  28.85 
 
 		 710 aa  159  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3028  type IV pilus secretin PilQ  28.05 
 
 		 711 aa  158  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.390023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>