More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0019 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0019  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  759    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1100  ABC transporter ATP-binding protein YojI  100 
 
 		 389 aa  759    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1211  type II and III secretion system protein  27.38 
 
 		 380 aa  96.7  6e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0190  type II and III secretion system protein  27 
 
 		 380 aa  94  4e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0347  type II and III secretion system protein  28.47 
 
 		 391 aa  93.2  6e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000362536  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2703  type II and III secretion system protein  26.26 
 
 		 386 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0358  putative fimbrial type-4 assembly signal peptide, PilQ-like  23.67 
 
 		 567 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3599  type IV pilus secretin PilQ  23.53 
 
 		 591 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00505018  hitchhiker  0.0000000614182 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1277  general secretion pathway protein D  24.47 
 
 		 751 aa  67  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0078  general secretion pathway protein D  22.91 
 
 		 660 aa  65.1  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0294  type IV pilus secretin PilQ  22.5 
 
 		 573 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.882341 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00601  general secretion pathway protein D  24.54 
 
 		 658 aa  63.5  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1791  general secretion pathway protein D  26.32 
 
 		 784 aa  62.8  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2609  putative general secretion pathway protein D  23.33 
 
 		 780 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001892  general secretion pathway protein D/type II secretion outermembrane pore forming protein (PulD)  25 
 
 		 672 aa  62.4  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0612  type II and III secretion system protein  23.56 
 
 		 668 aa  62.4  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0385351  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4248  type II and III secretion system protein  23.97 
 
 		 454 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.218711 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4358  type II and III secretion system protein  23.97 
 
 		 454 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.970058 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2924  general secretion pathway protein D  25.77 
 
 		 675 aa  62  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3701  type IV pilus secretin PilQ  21.9 
 
 		 462 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0441702  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3205  type II/III secretion system protein  21.9 
 
 		 462 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.278596  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3025  type II/III secretion system protein  22.5 
 
 		 576 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2798  type II/III secretion system protein  21.9 
 
 		 462 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3759  type IV pilus secretin PilQ  21.9 
 
 		 465 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.180527  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4606  putative outer membrane porin HofQ  20.37 
 
 		 413 aa  61.6  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000951162  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2748  type II/III secretion system protein  22.5 
 
 		 527 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3730  type II/III secretion system protein  22.5 
 
 		 575 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.605759  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2795  type IV pilus secretin PilQ  23.81 
 
 		 523 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.747994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1438  type II and III secretion system protein  20.71 
 
 		 812 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12402  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1756  type II/III secretion system protein  22.5 
 
 		 616 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02594  outer membrane channel signal peptide protein  23.29 
 
 		 454 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0679  type IV pilus secretin PilQ  26.95 
 
 		 887 aa  60.1  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4118  type II and III secretion system protein  20.28 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000089242 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5409  type II and III secretion system protein  20.55 
 
 		 469 aa  59.7  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.28985  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0679  type IV pilus secretin PilQ  26.95 
 
 		 887 aa  59.7  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0645  type II and III secretion system protein, secretin  26.95 
 
 		 882 aa  59.7  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2024  general secretion pathway protein D  25 
 
 		 779 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0993324 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3488  type II and III secretion system protein  21.88 
 
 		 543 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4445  type II and III secretion system protein  22.41 
 
 		 457 aa  59.3  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0319  type IV pilus secretin PilQ  21.88 
 
 		 553 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.935194 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2716  Type IV pilus secretin PilQ  22.5 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00921837  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0310  type IV pilus secretin PilQ  21.88 
 
 		 553 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3007  type II and III secretion system protein  22.07 
 
 		 477 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0909  general secretion pathway protein D  25 
 
 		 805 aa  58.5  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.793401 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0370  type IV pilus secretin PilQ  22.5 
 
 		 543 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3654  pilus assembly protein  20.55 
 
 		 473 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0391  type IV pilus secretin PilQ  22.5 
 
 		 543 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3884  type II and III secretion system protein  21.49 
 
 		 760 aa  57.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3010  type II and III secretion system protein  23.76 
 
 		 774 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1299  general secretion pathway protein D  22.22 
 
 		 716 aa  58.2  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2106  general secretion pathway protein D  22.01 
 
 		 767 aa  57.4  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.832393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0251  fimbrial assembly protein pilQ precursor  24.84 
 
 		 699 aa  57  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.215469  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1336  type II and III secretion system protein  25.6 
 
 		 653 aa  57.4  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.474923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1300  type II secretion system protein D  23.53 
 
 		 667 aa  56.6  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.194357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1439  type II secretion system protein D  24.12 
 
 		 656 aa  56.6  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0989759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2255  type II and III secretion system protein  19.66 
 
 		 372 aa  56.6  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.936423  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06196  Flp pilus assembly protein, secretin CapC  21.14 
 
 		 456 aa  56.6  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00431  putative general secretion pathway GSPD-related protein  24.64 
 
 		 698 aa  56.2  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3216  type II and III secretion system secretin  23.87 
 
 		 667 aa  56.2  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141334 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1941  type IV pilus secretin PilQ  22.56 
 
 		 729 aa  55.8  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.77071  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0690  type IV pilus secretin PilQ  26.83 
 
 		 893 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1035  type II and III secretion system protein  23.69 
 
 		 1421 aa  55.8  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0045  type III secretion protein SctC  23.24 
 
 		 672 aa  55.1  0.000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1679  type II secretory pathway, component HofQ  26.9 
 
 		 767 aa  55.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0685  type II and III secretion system protein  25.16 
 
 		 423 aa  55.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0601  type II/III secretion system protein  25.16 
 
 		 439 aa  55.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.570142  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2971  fimbrial type-4 assembly signal peptide protein  25.31 
 
 		 714 aa  54.7  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3529  general secretion pathway protein D  25.26 
 
 		 740 aa  54.7  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2360  type II/III secretion system protein  22.86 
 
 		 482 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0252  type IV pilus secretin PilQ  23.98 
 
 		 1269 aa  54.7  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.760209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1175  general secretion pathway protein D  24.05 
 
 		 797 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3403  type IV pilus secretin PilQ  23.75 
 
 		 726 aa  53.9  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.613607 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0742  type II and III secretion system protein  22.34 
 
 		 773 aa  53.9  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02351  fimbrial assembly protein  20.61 
 
 		 655 aa  53.9  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.733093  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0003  general secretion pathway protein D  21.83 
 
 		 655 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0438473 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3236  type IV pilus secretin PilQ  23.35 
 
 		 657 aa  53.5  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0831475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2306  general secretion pathway protein D  25 
 
 		 674 aa  52.4  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0031  general secretion pathway protein D  23.45 
 
 		 794 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.412275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0848  type II and III secretion system protein  24.32 
 
 		 419 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0648  type II and III secretion system protein  23.86 
 
 		 422 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1836  type II and III secretion system protein  27.59 
 
 		 494 aa  52.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2072  type II and III secretion system protein  21.94 
 
 		 492 aa  52.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00565214  normal  0.624153 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2096  type II and III secretion system family protein  20.77 
 
 		 349 aa  52.4  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3514  type II and III secretion system protein  21.26 
 
 		 431 aa  52.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.91039  normal  0.283922 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03956  general secretion pathway protein D  23.72 
 
 		 681 aa  52.4  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02838  GspD, hypothetical type II secretion protein  22.09 
 
 		 686 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000664316  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3138  general secretion pathway protein D  22.09 
 
 		 686 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4345  type II and III secretion system protein  23.7 
 
 		 451 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.222675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3427  general secretion pathway protein D  22.09 
 
 		 686 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02788  hypothetical protein  22.09 
 
 		 686 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000655056  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1057  type II and III secretion system protein  23.21 
 
 		 451 aa  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4661  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  24.43 
 
 		 443 aa  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000794738  hitchhiker  0.00340482 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3247  general secretion pathway protein GspD  22.09 
 
 		 686 aa  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0686  type II and III secretion system protein  31 
 
 		 897 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.433191  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0678  general secretion pathway protein D  24.52 
 
 		 720 aa  52  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00783707  decreased coverage  0.00018208 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0785  type II and III secretion system protein  21.3 
 
 		 717 aa  51.6  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1144  type IV pilus secretin PilQ  22.49 
 
 		 714 aa  52  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0720  general secretion pathway protein D  31 
 
 		 904 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.566529  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3968  type II and III secretion system protein  21.51 
 
 		 490 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.198511  normal  0.42418 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0605  type II and III secretion system protein  21.33 
 
 		 446 aa  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>