More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I3225 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6429  type VI secretion system Vgr family protein  48.29 
 
 		 955 aa  744    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.727988 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6418  Rhs element Vgr protein  46.37 
 
 		 956 aa  752    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.149183 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0207  Rhs element Vgr protein  93.84 
 
 		 921 aa  1750    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0113608  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4520  type VI secretion system Vgr family protein  64.19 
 
 		 927 aa  1172    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1582  Rhs element Vgr protein  94.01 
 
 		 858 aa  1516    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.371781  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0100  Rhs element Vgr protein  94.17 
 
 		 926 aa  1760    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0127  putative Rhs element Vgr protein  94.4 
 
 		 928 aa  1769    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5512  Rhs element Vgr protein  53.86 
 
 		 902 aa  937    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0089  Rhs element Vgr protein, putative  100 
 
 		 926 aa  1889    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3371  type VI secretion system Vgr family protein  63.93 
 
 		 922 aa  1154    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3225  Rhs element Vgr protein, putative  100 
 
 		 926 aa  1889    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1411  Rhs element Vgr protein  46.37 
 
 		 956 aa  752    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1615  putative Rhs element Vgr protein  94.07 
 
 		 928 aa  1760    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.491638  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5209  Rhs element Vgr protein  63.82 
 
 		 922 aa  1136    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00397  putative VGR-related protein  40.33 
 
 		 908 aa  597  1e-169  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02464  Rhs element Vgr protein  41.92 
 
 		 906 aa  595  1e-169  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03644  Rhs element Vgr protein  42.3 
 
 		 906 aa  594  1e-168  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  36.6 
 
 		 853 aa  505  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  36.29 
 
 		 851 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3220  putative VGR-related protein  45.49 
 
 		 509 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376065 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  30.56 
 
 		 1019 aa  327  8.000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  30.21 
 
 		 1019 aa  317  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3222  putative VGR-related protein  43.95 
 
 		 547 aa  301  3e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000721759 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  30.07 
 
 		 842 aa  301  4e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  30.57 
 
 		 871 aa  296  1e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  30.29 
 
 		 869 aa  287  7e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  30.29 
 
 		 875 aa  283  8.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  27.46 
 
 		 958 aa  273  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  29.34 
 
 		 1063 aa  271  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  29.34 
 
 		 1063 aa  270  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  29.62 
 
 		 1059 aa  269  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  28.92 
 
 		 1057 aa  267  7e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  28.27 
 
 		 895 aa  266  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  28.62 
 
 		 895 aa  266  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  29.01 
 
 		 1063 aa  266  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  27.9 
 
 		 1048 aa  264  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  28.64 
 
 		 1074 aa  264  4.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  28.92 
 
 		 1057 aa  264  6e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  28.5 
 
 		 895 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  27.57 
 
 		 892 aa  260  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  28.6 
 
 		 910 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2254  type VI secretion system Vgr family protein  27.15 
 
 		 862 aa  254  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  29.04 
 
 		 895 aa  254  6e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  27.84 
 
 		 923 aa  252  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0207  Rhs element Vgr protein  28.87 
 
 		 855 aa  250  7e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  29 
 
 		 968 aa  249  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  28.33 
 
 		 852 aa  247  6e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2922  type VI secretion system Vgr family protein  29.08 
 
 		 853 aa  247  8e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1930  type VI secretion system Vgr family protein  26.09 
 
 		 862 aa  247  9e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.931752  normal  0.0420074 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3327  type VI secretion system Vgr family protein  28.17 
 
 		 850 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.702291 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  29.37 
 
 		 891 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  28.76 
 
 		 853 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  28.36 
 
 		 853 aa  245  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3746  Rhs element Vgr protein  29.89 
 
 		 850 aa  243  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4617  Rhs element Vgr protein  29.89 
 
 		 850 aa  243  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761294  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  29.35 
 
 		 850 aa  242  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  26.19 
 
 		 886 aa  237  6e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  27.18 
 
 		 911 aa  235  3e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  30.09 
 
 		 822 aa  233  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04700  Rhs element Vgr protein  28.04 
 
 		 979 aa  233  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  26.82 
 
 		 901 aa  231  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  28.37 
 
 		 868 aa  228  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01970  putative VGR-related protein  28.87 
 
 		 898 aa  223  9e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  25.75 
 
 		 975 aa  222  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2169  Rhs element Vgr protein  26.17 
 
 		 933 aa  219  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4099  Rhs element Vgr protein  28.13 
 
 		 890 aa  218  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02029  Rhs element Vgr protein  28 
 
 		 928 aa  215  2.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2209  type VI secretion system Vgr family protein  27.01 
 
 		 895 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0391  Rhs element Vgr protein  26.72 
 
 		 1094 aa  208  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5366  Rhs element Vgr protein  25.64 
 
 		 1284 aa  206  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317319  normal  0.534977 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0019  type VI secretion system Vgr family protein  27.6 
 
 		 730 aa  206  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1585  Rhs element Vgr protein  26.91 
 
 		 1111 aa  205  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163096  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5469  type VI secretion system Vgr family protein  27.39 
 
 		 1284 aa  205  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387829  normal  0.0913862 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  27.35 
 
 		 885 aa  204  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1769  hypothetical protein  27.13 
 
 		 1111 aa  204  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1610  Rhs element Vgr protein  27.13 
 
 		 1111 aa  204  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03738  putative VGR-related protein  27.21 
 
 		 957 aa  204  6e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.198638 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0449  type VI secretion system Vgr family protein  28.5 
 
 		 840 aa  204  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462145  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2697  Rhs element Vgr protein, putative  26.23 
 
 		 1111 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00270  Rhs element Vgr protein  28.42 
 
 		 920 aa  198  4.0000000000000005e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00502  Rhs element Vgr protein  29.2 
 
 		 920 aa  197  6e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01958  putative VGR-related protein  27.51 
 
 		 918 aa  197  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.917398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02040  Rhs element Vgr protein  28.01 
 
 		 847 aa  196  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  26.71 
 
 		 845 aa  196  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1932  type VI secretion system Vgr family protein  26.59 
 
 		 918 aa  195  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  27.31 
 
 		 845 aa  195  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2630  Rhs element Vgr protein  28.71 
 
 		 847 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.690564  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02054  Rhs element Vgr protein  29.2 
 
 		 849 aa  191  5.999999999999999e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  27.09 
 
 		 837 aa  190  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0918871 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  26.17 
 
 		 843 aa  189  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1281  type VI secretion system Vgr family protein  27.18 
 
 		 843 aa  189  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435024  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  26.3 
 
 		 920 aa  188  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0985  Rhs element Vgr protein  26.74 
 
 		 843 aa  189  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2225  Rhs element Vgr protein  27.58 
 
 		 835 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3640  type VI secretion system Vgr family protein  25.63 
 
 		 941 aa  183  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7612  Rhs element Vgr protein  26.14 
 
 		 1114 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7022  type VI secretion system Vgr family protein  26.76 
 
 		 846 aa  181  8e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0958  putative VGR-related protein  26.14 
 
 		 907 aa  176  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.677133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7609  Rhs element Vgr protein  27.19 
 
 		 947 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.823228 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5128  Rhs element Vgr protein  25.33 
 
 		 834 aa  174  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>