245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2781 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3335  Cellulase  60.45 
 
 		 578 aa  666    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59527  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  100 
 
 		 681 aa  1381    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0182  Cellulase  59.38 
 
 		 593 aa  613  9.999999999999999e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4876  Cellulase  55.87 
 
 		 572 aa  595  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168386  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4946  Cellulase  52.61 
 
 		 589 aa  546  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0257714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3202  cellulase  37.77 
 
 		 743 aa  349  8e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000270074  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1586  Cellulase  30.55 
 
 		 545 aa  263  8.999999999999999e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  34.59 
 
 		 814 aa  201  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08068  extracellular endoglucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01830)  31.06 
 
 		 572 aa  189  1e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  36.12 
 
 		 516 aa  182  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1099  glycoside hydrolase family 5  31.96 
 
 		 475 aa  176  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0774  glycoside hydrolase family protein  32.03 
 
 		 502 aa  165  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2058  cellulase  29.68 
 
 		 469 aa  164  7e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.33329  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  63.96 
 
 		 743 aa  156  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2636  DNA mismatch repair protein  33.02 
 
 		 621 aa  151  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119439  normal  0.352688 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0325  dihydroxy-acid dehydratase  32.18 
 
 		 451 aa  141  4.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.375618  normal  0.486344 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  55.74 
 
 		 488 aa  138  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  30.33 
 
 		 584 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  29.18 
 
 		 900 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  52 
 
 		 669 aa  134  5e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  57.94 
 
 		 491 aa  134  5e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  52.83 
 
 		 469 aa  128  4.0000000000000003e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  50.76 
 
 		 479 aa  127  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  58.25 
 
 		 596 aa  127  9e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  57.66 
 
 		 499 aa  126  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  61.11 
 
 		 744 aa  126  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  51.11 
 
 		 605 aa  124  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3301  glycoside hydrolase family 62  59.79 
 
 		 485 aa  122  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111017  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  58.25 
 
 		 774 aa  121  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2490  2-isopropylmalate synthase  29.47 
 
 		 566 aa  119  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  51.16 
 
 		 446 aa  118  3.9999999999999997e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  57.43 
 
 		 393 aa  117  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  52.38 
 
 		 590 aa  117  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  52.68 
 
 		 746 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  49.52 
 
 		 588 aa  115  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  42.86 
 
 		 455 aa  113  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  55.14 
 
 		 459 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  52.43 
 
 		 611 aa  110  8.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  52.88 
 
 		 436 aa  109  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  49.52 
 
 		 913 aa  108  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  47.62 
 
 		 767 aa  107  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  50 
 
 		 942 aa  106  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  47.66 
 
 		 438 aa  106  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  46.85 
 
 		 495 aa  106  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  29.7 
 
 		 343 aa  105  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  44.03 
 
 		 966 aa  105  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  40 
 
 		 633 aa  104  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  45.71 
 
 		 628 aa  105  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  44.64 
 
 		 974 aa  104  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  39.73 
 
 		 812 aa  104  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  41.09 
 
 		 854 aa  103  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  46.34 
 
 		 979 aa  104  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  45.86 
 
 		 589 aa  103  8e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  41.91 
 
 		 785 aa  103  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  50 
 
 		 489 aa  103  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  38.52 
 
 		 609 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  49.02 
 
 		 494 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  47.17 
 
 		 486 aa  102  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  50 
 
 		 925 aa  101  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  29.43 
 
 		 335 aa  101  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  49.5 
 
 		 543 aa  101  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  40.38 
 
 		 963 aa  100  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  47.17 
 
 		 773 aa  100  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  41.82 
 
 		 1055 aa  100  9e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  44.86 
 
 		 846 aa  100  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  43.44 
 
 		 688 aa  100  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  50.5 
 
 		 442 aa  100  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  49.51 
 
 		 934 aa  100  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  45.22 
 
 		 420 aa  100  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  48.39 
 
 		 460 aa  99.4  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0970  glycoside hydrolase family protein  51.4 
 
 		 894 aa  98.6  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.184783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  47.06 
 
 		 518 aa  99  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  42.86 
 
 		 1128 aa  98.6  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  31.08 
 
 		 525 aa  98.6  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  46.15 
 
 		 620 aa  97.4  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  44.53 
 
 		 794 aa  97.4  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  53.85 
 
 		 449 aa  97.1  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0049  cellulose-binding domain-containing protein  40.2 
 
 		 740 aa  96.7  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  49.02 
 
 		 623 aa  97.1  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  39.34 
 
 		 984 aa  96.3  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  49.02 
 
 		 842 aa  95.5  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  50.42 
 
 		 829 aa  95.1  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  46.79 
 
 		 847 aa  94.7  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  41.88 
 
 		 842 aa  94.7  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  47.31 
 
 		 448 aa  94.4  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  46.6 
 
 		 880 aa  94.4  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  44.12 
 
 		 778 aa  94  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  42.86 
 
 		 998 aa  93.6  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  43.8 
 
 		 681 aa  92.8  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  46.3 
 
 		 851 aa  92.8  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  47.52 
 
 		 580 aa  92.4  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  46.23 
 
 		 487 aa  92.8  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  46.23 
 
 		 727 aa  92  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  44.33 
 
 		 474 aa  92  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  46.22 
 
 		 1007 aa  92  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  40.65 
 
 		 366 aa  91.7  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  41.75 
 
 		 864 aa  91.7  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  46.08 
 
 		 423 aa  92  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  46.23 
 
 		 990 aa  91.3  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  46.53 
 
 		 376 aa  90.5  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.851755 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>