132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3627 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
394 aa  815    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  35.8 
 
 
423 aa  182  8.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  39.63 
 
 
289 aa  177  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  41.73 
 
 
291 aa  177  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  37.66 
 
 
279 aa  170  5e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.3 
 
 
627 aa  166  5e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  37.59 
 
 
384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.43 
 
 
288 aa  163  6e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  39.71 
 
 
426 aa  159  6e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.33 
 
 
282 aa  155  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.53 
 
 
252 aa  154  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  34.91 
 
 
283 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  34.26 
 
 
642 aa  147  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  34.51 
 
 
641 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  33.24 
 
 
389 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  36.16 
 
 
588 aa  144  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.33 
 
 
1290 aa  144  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  35.09 
 
 
569 aa  143  5e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  35.53 
 
 
274 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  34.55 
 
 
556 aa  137  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  33.33 
 
 
281 aa  138  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  32.29 
 
 
752 aa  136  6.0000000000000005e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.44 
 
 
633 aa  135  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  35 
 
 
383 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.23 
 
 
261 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3929  glycoside hydrolase family 16  32.01 
 
 
271 aa  130  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  33.12 
 
 
330 aa  127  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  34.18 
 
 
409 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4150  glycoside hydrolase family 16  36.45 
 
 
269 aa  125  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  33.81 
 
 
503 aa  123  6e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2679  glycoside hydrolase family protein  34.44 
 
 
260 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  32.97 
 
 
883 aa  121  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  33.45 
 
 
1321 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  33.09 
 
 
286 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  34.17 
 
 
276 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  32.8 
 
 
1332 aa  117  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  32.32 
 
 
328 aa  113  7.000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  32.46 
 
 
291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6737  glycoside hydrolase family 16  32.84 
 
 
286 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  31.96 
 
 
469 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  38.92 
 
 
427 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0554  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.02 
 
 
532 aa  107  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  29.93 
 
 
1059 aa  106  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0724  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.23 
 
 
290 aa  106  9e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.337879 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54973  endo-1,3-beta-glucosidase  31.28 
 
 
467 aa  105  9e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3843  glycoside hydrolase family protein  28.62 
 
 
346 aa  105  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.51 
 
 
547 aa  104  3e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  31.99 
 
 
301 aa  104  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1319  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.38 
 
 
358 aa  101  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.42 
 
 
1694 aa  100  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  29.32 
 
 
694 aa  99  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3121  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.3 
 
 
742 aa  98.6  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  34.16 
 
 
1441 aa  97.8  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0875  glycoside hydrolase family 16  29.26 
 
 
313 aa  97.4  4e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0919  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.12 
 
 
315 aa  96.3  9e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.94 
 
 
884 aa  95.9  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6434  glycoside hydrolase family 16  29.63 
 
 
286 aa  95.5  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0247  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.27 
 
 
328 aa  94.4  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.01 
 
 
912 aa  94.7  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4667  glycoside hydrolase family 16  28.52 
 
 
275 aa  92.8  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0863  glycoside hydrolase family 16  34.91 
 
 
842 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1608  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.48 
 
 
306 aa  90.9  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.54 
 
 
819 aa  89.7  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  30.27 
 
 
469 aa  87.8  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3127  glycoside hydrolase family 16  31.35 
 
 
275 aa  87.8  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3542  glycoside hydrolase family 16  35.48 
 
 
288 aa  87  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  27.94 
 
 
1028 aa  86.7  7e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3399  glycoside hydrolase family 16  30.56 
 
 
275 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.117609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.52 
 
 
639 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4793  glycoside hydrolase family protein  33.89 
 
 
320 aa  84.7  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  28.97 
 
 
470 aa  84.3  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2739  glycoside hydrolase family protein  30.89 
 
 
308 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.77425  normal  0.433839 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4347  glycoside hydrolase family 16  31.55 
 
 
405 aa  83.2  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0666302  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4533  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 
306 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445894  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4931  glycoside hydrolase family protein  32.22 
 
 
465 aa  82.8  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.59 
 
 
815 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3954  glycoside hydrolase family 16  29.17 
 
 
318 aa  81.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.913325  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2578  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 
277 aa  82  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164191  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  27.65 
 
 
1918 aa  80.1  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1873  glycoside hydrolase family 16  34.74 
 
 
287 aa  79.3  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  30.31 
 
 
446 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6754  glycoside hydrolase family protein  31.53 
 
 
284 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0544  glycoside hydrolase family 16  27.04 
 
 
238 aa  76.3  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.673841 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  26.18 
 
 
722 aa  75.5  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  28.52 
 
 
479 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  28.97 
 
 
479 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  28.37 
 
 
464 aa  74.7  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0558  glycoside hydrolase family protein  29.69 
 
 
449 aa  73.9  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0874314  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0560  glycoside hydrolase family 16  32.09 
 
 
263 aa  72.4  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  27.94 
 
 
1707 aa  72  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4792  glycoside hydrolase family protein  33.15 
 
 
608 aa  72  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2285  glycoside hydrolase family 16  27.61 
 
 
539 aa  70.1  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0517847  hitchhiker  0.00991437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  29.3 
 
 
999 aa  69.7  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0724  beta-glucanase/beta-glucan synthetase-like protein  32.95 
 
 
295 aa  68.9  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.882839  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  29.83 
 
 
907 aa  69.3  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3548  glycoside hydrolase family 16  33.71 
 
 
486 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.18 
 
 
1007 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0298  glycoside hydrolase family protein  25.64 
 
 
286 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0557225 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10320  beta-1,3-glucanase precursor  29.2 
 
 
294 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0132676  normal  0.819711 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6224  endo-1,3-1,4-beta-glycanase, C-terminal secretion signal protein  28.11 
 
 
475 aa  67.4  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>