174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0337 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_0315  SARP family transcriptional regulator  92.89 
 
 		 648 aa  1029    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.658605  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0326  transcriptional regulator, SARP family  98.45 
 
 		 647 aa  1202    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0337  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 647 aa  1221    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1046  transcriptional activator domain protein  42.53 
 
 		 1143 aa  429  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.203225 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0243  transcriptional activator domain protein  42.93 
 
 		 1083 aa  381  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0215  transcriptional activator domain protein  35.46 
 
 		 1163 aa  243  9e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  30.47 
 
 		 1029 aa  154  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  28.73 
 
 		 1139 aa  146  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  28.53 
 
 		 1055 aa  145  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  29.61 
 
 		 1013 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  26.73 
 
 		 1034 aa  137  8e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  31.48 
 
 		 1075 aa  134  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1630  SARP family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 1089 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  28.83 
 
 		 1067 aa  117  8.999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  29.81 
 
 		 494 aa  114  8.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  26.48 
 
 		 713 aa  110  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  32.18 
 
 		 1056 aa  106  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  28.39 
 
 		 1126 aa  97.4  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  28.41 
 
 		 1193 aa  97.4  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  28.97 
 
 		 1141 aa  96.7  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  28.35 
 
 		 1190 aa  95.5  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  35.49 
 
 		 1064 aa  93.2  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  30.45 
 
 		 1109 aa  91.3  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2409  transcriptional regulator, SARP family  37.77 
 
 		 244 aa  90.9  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.374187  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1015  SARP family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 1216 aa  90.9  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2486  transcriptional regulator, SARP family  35.43 
 
 		 270 aa  88.6  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  34.51 
 
 		 992 aa  85.5  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  27.97 
 
 		 1148 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 636 aa  83.2  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  33.44 
 
 		 999 aa  82.8  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  34.3 
 
 		 1044 aa  81.6  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 1141 aa  80.9  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 1141 aa  80.9  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2832  transcriptional regulator, SARP family  31.35 
 
 		 1145 aa  80.5  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 1141 aa  80.5  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3364  transcriptional activator domain  29.4 
 
 		 1118 aa  79.7  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 1116 aa  79.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  29.4 
 
 		 1118 aa  79.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1647  transcriptional regulator, SARP family  31.88 
 
 		 549 aa  77.8  0.0000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1963  transcriptional regulator, SARP family  34.08 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0662749  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2581  transcriptional activator domain-containing protein  25.25 
 
 		 1183 aa  75.5  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1158  transcriptional regulator, SARP family  35.96 
 
 		 277 aa  74.3  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000016652 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0072  transcriptional activator domain protein  28.49 
 
 		 1101 aa  73.9  0.000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.713941  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 1151 aa  73.9  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2507  transcriptional activator domain-containing protein  34.73 
 
 		 275 aa  73.2  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0440426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2691  SARP family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144834 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  35.02 
 
 		 1146 aa  70.1  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3681  SARP family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 1217 aa  68.6  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134161  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4971  transcriptional regulator, SARP family  33.91 
 
 		 261 aa  68.9  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.602293  normal  0.15867 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2957  AAA ATPase  26.35 
 
 		 1264 aa  66.6  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302868 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  28.12 
 
 		 1682 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 1050 aa  65.1  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  32.58 
 
 		 1097 aa  64.7  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6036  transcriptional regulator, SARP family  31.17 
 
 		 650 aa  64.7  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0951775  normal  0.443759 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0590  transcriptional activator domain protein  42.72 
 
 		 1163 aa  63.9  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.422877 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2258  SARP family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 647 aa  63.5  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0203775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3122  SARP family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 773 aa  62.8  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  29.1 
 
 		 993 aa  60.8  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.65 
 
 		 1666 aa  60.8  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05450  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  31.78 
 
 		 907 aa  60.1  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1512  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  28.71 
 
 		 561 aa  60.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7193  transcriptional regulator, SARP family  31.9 
 
 		 641 aa  60.1  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0854307  normal  0.06484 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  27.59 
 
 		 1663 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3477  hypothetical protein  30.49 
 
 		 996 aa  58.9  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.98 
 
 		 1175 aa  58.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0816  transcriptional activator domain protein  29.6 
 
 		 1133 aa  58.2  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  25.54 
 
 		 927 aa  57.8  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  29.83 
 
 		 967 aa  57.4  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  28.52 
 
 		 1108 aa  57  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  26.95 
 
 		 1090 aa  57  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.03 
 
 		 1055 aa  57  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  27.44 
 
 		 1682 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  26.9 
 
 		 1114 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  31.45 
 
 		 952 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2003  transcriptional regulator, SARP family  29.8 
 
 		 867 aa  56.2  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.228987  hitchhiker  0.0000000440234 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  26.79 
 
 		 1121 aa  56.6  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2653  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  28.14 
 
 		 572 aa  55.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 621 aa  55.5  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1953  transcriptional activator domain protein  37.86 
 
 		 1083 aa  55.5  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247822 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3762  serine/threonine protein kinase  32.63 
 
 		 1192 aa  55.1  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.00167797  normal  0.557916 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1110  transcriptional activator domain-containing protein  25.83 
 
 		 1082 aa  55.1  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  29.79 
 
 		 943 aa  54.7  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4017  transcriptional regulator, SARP family  29.69 
 
 		 535 aa  54.7  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00126088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.69 
 
 		 1422 aa  54.3  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  26.81 
 
 		 1398 aa  54.3  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2088  transcriptional regulator, SARP family  33.19 
 
 		 244 aa  54.3  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  37.11 
 
 		 910 aa  54.3  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  28.03 
 
 		 1685 aa  53.9  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.57 
 
 		 1149 aa  53.9  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  26.98 
 
 		 1050 aa  53.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  22.52 
 
 		 1111 aa  52.4  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4892  transcriptional activator domain-containing protein  32.48 
 
 		 597 aa  53.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.98 
 
 		 1050 aa  53.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  29.23 
 
 		 1100 aa  53.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  26.68 
 
 		 1358 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  27.59 
 
 		 1204 aa  52.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  26.34 
 
 		 1198 aa  52  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3177  transcriptional regulator, SARP family  35.46 
 
 		 526 aa  52.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0715298  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  28.54 
 
 		 954 aa  51.6  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  30 
 
 		 1064 aa  51.2  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>