More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1750 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  51.58 
 
 		 1089 aa  1068    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1087 aa  2234    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 935 aa  303  2e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2398  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 966 aa  269  2e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  50.24 
 
 		 888 aa  192  2.9999999999999997e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  41.85 
 
 		 897 aa  185  5.0000000000000004e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  47.06 
 
 		 952 aa  179  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  40 
 
 		 1066 aa  131  6e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  32.4 
 
 		 1147 aa  116  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  34.23 
 
 		 1126 aa  115  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  34.23 
 
 		 1120 aa  115  6e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  34.23 
 
 		 1122 aa  115  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2560  TonB-dependent receptor  52.29 
 
 		 957 aa  106  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.184362  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  31.58 
 
 		 753 aa  103  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  30 
 
 		 1109 aa  103  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  30.09 
 
 		 988 aa  94.7  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2598  TonB-dependent receptor plug  31.82 
 
 		 777 aa  93.6  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  32.41 
 
 		 1004 aa  93.2  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  32.13 
 
 		 848 aa  92.4  4e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  32.6 
 
 		 747 aa  91.3  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  32.22 
 
 		 989 aa  90.9  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0176  TonB-dependent receptor  37.04 
 
 		 924 aa  89  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0915  TonB-dependent receptor plug  39.58 
 
 		 1075 aa  88.2  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  30.51 
 
 		 789 aa  88.2  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  26.47 
 
 		 1074 aa  86.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  27.83 
 
 		 1027 aa  86.7  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  31.85 
 
 		 806 aa  86.3  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  29.48 
 
 		 972 aa  85.5  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  34.94 
 
 		 1001 aa  85.9  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  29.02 
 
 		 1074 aa  85.1  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  33.94 
 
 		 1114 aa  84.3  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0330  TonB-dependent outer membrane receptor precursor  32.1 
 
 		 1041 aa  84.3  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000673436  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1482  TonB-dependent receptor plug  32.4 
 
 		 1051 aa  84  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0024542  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  30.93 
 
 		 991 aa  84.3  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  29.91 
 
 		 1000 aa  83.2  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 845 aa  83.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5072  OmpA-related protein  29.75 
 
 		 1125 aa  83.2  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.813038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1213  TonB-dependent receptor  32.54 
 
 		 1090 aa  82.8  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  30.2 
 
 		 933 aa  82.8  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  38.03 
 
 		 1173 aa  82.8  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  32.16 
 
 		 1006 aa  82.8  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  28.92 
 
 		 1021 aa  82.8  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 		 836 aa  82.4  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  27.76 
 
 		 833 aa  82  0.00000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 1038 aa  82  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  37.89 
 
 		 1023 aa  81.6  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 790 aa  81.3  0.00000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 893 aa  80.9  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6451  TonB-dependent receptor plug  30.04 
 
 		 1062 aa  81.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.402176  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01815  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 927 aa  80.9  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5439  TonB-dependent receptor plug  40.4 
 
 		 962 aa  80.1  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.648524  normal  0.961509 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  37.91 
 
 		 1128 aa  80.5  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  32.43 
 
 		 1102 aa  80.5  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  38.93 
 
 		 1137 aa  79.7  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  33.06 
 
 		 1060 aa  79.7  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  32.72 
 
 		 1144 aa  79.7  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  25.62 
 
 		 760 aa  79.3  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1024 aa  79.7  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5935  TonB-dependent receptor plug  28.12 
 
 		 1097 aa  79.7  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2153  TonB-dependent receptor plug  34.97 
 
 		 1042 aa  79  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000607651  normal  0.711508 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01883  TonB-dependent Receptor/Oar-like protein  27.27 
 
 		 1037 aa  79.3  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144968  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 		 828 aa  79  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  31.67 
 
 		 1082 aa  79.3  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  34.55 
 
 		 1117 aa  79  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 993 aa  79  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2876  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 1007 aa  79  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  32.03 
 
 		 1124 aa  79  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  34.08 
 
 		 1047 aa  79  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  32.73 
 
 		 1155 aa  78.6  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  26.67 
 
 		 812 aa  78.6  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  28.4 
 
 		 1052 aa  78.6  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  30.67 
 
 		 763 aa  78.6  0.0000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  30.43 
 
 		 776 aa  78.2  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  34.84 
 
 		 1075 aa  78.2  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  36.17 
 
 		 1144 aa  78.2  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 1041 aa  77.8  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0021  TonB-dependent receptor  32.88 
 
 		 976 aa  77.8  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1274  TonB-dependent receptor plug  29.83 
 
 		 861 aa  77.4  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  36.54 
 
 		 1058 aa  77.8  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1390  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1037 aa  77.8  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 798 aa  77.4  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  31.65 
 
 		 1106 aa  77  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 1188 aa  77  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  30.41 
 
 		 1014 aa  77  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2245  TonB-dependent receptor  30.69 
 
 		 1040 aa  76.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184688 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 759 aa  77  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  27.78 
 
 		 1070 aa  76.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  35.19 
 
 		 1177 aa  76.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 982 aa  77  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 1163 aa  76.6  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0445  TonB-dependent receptor plug  26.87 
 
 		 1043 aa  77  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2829  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 803 aa  76.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  32.6 
 
 		 1102 aa  76.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0830  TonB-dependent receptor  32.64 
 
 		 933 aa  76.3  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.926876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  31.15 
 
 		 1076 aa  76.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  29.24 
 
 		 1059 aa  76.3  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 		 793 aa  76.3  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  32.68 
 
 		 1045 aa  76.3  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  34.29 
 
 		 1181 aa  76.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  30.56 
 
 		 1003 aa  76.3  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>