96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0676 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  47.83 
 
 		 4285 aa  2399    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  40.56 
 
 		 3229 aa  1442    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  31.29 
 
 		 5020 aa  794    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  36.47 
 
 		 4854 aa  1030    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  42.79 
 
 		 16311 aa  1069    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  33.13 
 
 		 2567 aa  645    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  34.04 
 
 		 3259 aa  728    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0676  VCBS  100 
 
 		 4661 aa  8879    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000119465 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.44 
 
 		 2067 aa  802    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  31.06 
 
 		 8321 aa  608  9.999999999999999e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  28.01 
 
 		 2784 aa  608  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  35.63 
 
 		 6678 aa  582  1e-164  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  31.78 
 
 		 5094 aa  552  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3331  outer membrane adhesin like proteiin  26.86 
 
 		 3439 aa  505  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0510  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.99 
 
 		 2812 aa  473  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  29.06 
 
 		 3182 aa  464  9.999999999999999e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  29.45 
 
 		 8871 aa  434  1e-119  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.94 
 
 		 1553 aa  425  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  35.26 
 
 		 2743 aa  387  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  35.61 
 
 		 1883 aa  371  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3182  putative outer membrane adhesin-like protein  28.37 
 
 		 3132 aa  343  4e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  28.19 
 
 		 3714 aa  262  9e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  27.78 
 
 		 3508 aa  254  4e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  26.01 
 
 		 2887 aa  231  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0150  outer membrane adhesin like proteiin  29.24 
 
 		 1206 aa  212  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.8 
 
 		 1599 aa  211  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1637  VCBS  29.34 
 
 		 2127 aa  209  8e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1239  VCBS  32.58 
 
 		 2461 aa  207  3e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  24.35 
 
 		 2524 aa  181  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0276  outer membrane adhesin like proteiin  25 
 
 		 3091 aa  182  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.14 
 
 		 2239 aa  181  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  22.89 
 
 		 3699 aa  177  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.48 
 
 		 1963 aa  174  5e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  24.38 
 
 		 4978 aa  166  9e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  23.25 
 
 		 3699 aa  166  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.9 
 
 		 14916 aa  165  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2430  VBCS repeat-containing protein  24.33 
 
 		 3758 aa  163  7e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  26.96 
 
 		 2555 aa  155  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  22.71 
 
 		 3544 aa  127  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.84 
 
 		 1884 aa  122  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  30.91 
 
 		 4379 aa  104  4e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1022  hypothetical protein  29.97 
 
 		 1933 aa  104  5e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  27.06 
 
 		 1838 aa  103  6e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1722  hypothetical protein  29.9 
 
 		 1013 aa  97.1  7e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.919333  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  26.68 
 
 		 7284 aa  96.3  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.74 
 
 		 2678 aa  91.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3540  putative adhesin or RTX toxin  29.74 
 
 		 2060 aa  91.3  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1895  hypothetical protein  26.33 
 
 		 1025 aa  90.9  5e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  25.81 
 
 		 1141 aa  87.4  0.000000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1235  hypothetical protein  25.08 
 
 		 2024 aa  87.4  0.000000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  25.09 
 
 		 2853 aa  87  0.000000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  23.19 
 
 		 4220 aa  86.7  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0304  hypothetical protein  25.39 
 
 		 1806 aa  84.7  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  28.42 
 
 		 1557 aa  84.3  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  22.25 
 
 		 3927 aa  81.3  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  26.09 
 
 		 2074 aa  79  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  28.79 
 
 		 9867 aa  79  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.8 
 
 		 2507 aa  77.4  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.19 
 
 		 5098 aa  74.3  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4420  hypothetical protein  39.49 
 
 		 912 aa  73.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0816667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  29.28 
 
 		 3026 aa  72.8  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7154  hypothetical protein  33.88 
 
 		 2039 aa  72  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  23.31 
 
 		 3191 aa  72.4  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0306  hypothetical protein  26.2 
 
 		 1350 aa  68.6  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  28.87 
 
 		 1428 aa  68.2  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0632  outer membrane adhesin like proteiin  24.5 
 
 		 7233 aa  67.4  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  21.75 
 
 		 5745 aa  66.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2524  VCBS  37.09 
 
 		 1143 aa  65.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.543748  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  29.62 
 
 		 5218 aa  65.5  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  25.73 
 
 		 1706 aa  65.1  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  25.9 
 
 		 1867 aa  63.9  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0020  hemolysin-type calcium-binding protein  26.01 
 
 		 2890 aa  63.2  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0747  outer membrane adhesin like proteiin  34.04 
 
 		 1598 aa  57.4  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.525894 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  24.7 
 
 		 3598 aa  57  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  25.92 
 
 		 2816 aa  56.6  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.64 
 
 		 11716 aa  55.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  24.31 
 
 		 2820 aa  55.8  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1048  hypothetical protein  36.59 
 
 		 1126 aa  55.5  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00227105  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  27.55 
 
 		 2153 aa  53.9  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2611  hypothetical protein  36.09 
 
 		 2924 aa  52.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  28.24 
 
 		 2337 aa  51.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4328  cadherin domain-containing protein  23.92 
 
 		 2193 aa  50.8  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.859375  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.78 
 
 		 3396 aa  50.8  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  29.47 
 
 		 3391 aa  50.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1560  heme peroxidase  34.67 
 
 		 3094 aa  49.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.508144 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  32.05 
 
 		 3066 aa  48.5  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  22.9 
 
 		 1597 aa  48.9  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.51 
 
 		 5962 aa  48.1  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1979  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.46 
 
 		 3038 aa  48.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.109352 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  29.47 
 
 		 3477 aa  47.8  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  27.74 
 
 		 1728 aa  47.4  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1920  hypothetical protein  32.46 
 
 		 3834 aa  47.8  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  27.31 
 
 		 4687 aa  47  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  23.68 
 
 		 2522 aa  47  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1337  Integrins alpha chain  33.77 
 
 		 1434 aa  47  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153084  normal  0.903463 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14361  hypothetical protein  24.89 
 
 		 4723 aa  47  0.01  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>