111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_24915 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_24915  predicted protein  100 
 
 		 791 aa  1652    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.615618  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40695  predicted protein  33.42 
 
 		 749 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000000149445  normal  0.993011 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32894  predicted protein  32.46 
 
 		 1067 aa  351  4e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0780237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37445  predicted protein  29.9 
 
 		 938 aa  309  1.0000000000000001e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258887  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54439  YPL008W (CHL1)-like protein  25.15 
 
 		 835 aa  202  3e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.106037 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10282  predicted protein  27.48 
 
 		 614 aa  197  4.0000000000000005e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09436  5' to 3' DNA helicase (Eurofung)  25.59 
 
 		 791 aa  192  2e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10414  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05590)  24.72 
 
 		 841 aa  183  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50344  DNA helicase component of transcription factor b  23.95 
 
 		 793 aa  183  1e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05570  general RNA polymerase II transcription factor, putative  24.02 
 
 		 799 aa  182  2e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.946623  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26944  predicted protein  22.84 
 
 		 788 aa  179  3e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.168097 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54072  xeroderma pigmentosum group D complementing protein  24.32 
 
 		 782 aa  174  5.999999999999999e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05090  CHL1 helicase, putative  25.22 
 
 		 849 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37740  predicted protein  26.97 
 
 		 849 aa  126  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.689797  normal  0.0804873 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  22.57 
 
 		 617 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  23.58 
 
 		 676 aa  115  3e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  21.26 
 
 		 669 aa  110  9.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  21.34 
 
 		 723 aa  105  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  22.72 
 
 		 670 aa  102  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1867  DEAD_2 domain-containing protein  23.82 
 
 		 541 aa  97.8  7e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.512598 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  22.78 
 
 		 739 aa  93.2  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1769  DEAD_2 domain protein  21.11 
 
 		 729 aa  92  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  21.58 
 
 		 739 aa  90.9  8e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  22.49 
 
 		 619 aa  90.9  8e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  21.54 
 
 		 723 aa  90.9  9e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  20.48 
 
 		 722 aa  85.5  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0620  DEAD_2 domain-containing protein  22.81 
 
 		 634 aa  82.8  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  20.99 
 
 		 712 aa  82.4  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  22.05 
 
 		 790 aa  80.9  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  21.36 
 
 		 654 aa  80.9  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  20.61 
 
 		 777 aa  79.7  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1357  DEAD_2 domain-containing protein  26.01 
 
 		 575 aa  77  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0243831 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  22.76 
 
 		 773 aa  76.6  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  22.2 
 
 		 758 aa  75.1  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  22.51 
 
 		 775 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  22.5 
 
 		 807 aa  72.4  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  20.92 
 
 		 785 aa  72.4  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1117  DEAD_2 domain-containing protein  25.78 
 
 		 582 aa  68.2  0.0000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  23.81 
 
 		 574 aa  68.2  0.0000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1288  DEAD_2 domain protein  25.85 
 
 		 550 aa  67.8  0.0000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  21.78 
 
 		 852 aa  67.8  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  22.38 
 
 		 753 aa  67.8  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  21.56 
 
 		 798 aa  66.2  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  20.39 
 
 		 774 aa  63.9  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  24.79 
 
 		 790 aa  62.8  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2975  helicase c2  20.28 
 
 		 807 aa  61.2  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0478  DEAD_2 domain-containing protein  25.87 
 
 		 588 aa  61.2  0.00000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.738253  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  24.48 
 
 		 779 aa  60.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  24.83 
 
 		 781 aa  60.1  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  24.49 
 
 		 781 aa  57.8  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  25.73 
 
 		 934 aa  57.4  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0390  DEAD_2 domain-containing protein  23.81 
 
 		 580 aa  57.4  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12513 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3670  helicase c2  19.64 
 
 		 664 aa  57  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.978483  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  23.96 
 
 		 758 aa  57  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  24.81 
 
 		 761 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  24.84 
 
 		 934 aa  56.2  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  24.84 
 
 		 934 aa  56.6  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  24.84 
 
 		 934 aa  56.2  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  24.84 
 
 		 934 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  25.99 
 
 		 929 aa  54.7  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0979  helicase domain-containing protein  23.71 
 
 		 706 aa  54.3  0.000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0544879  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0371  DNA repair helicase RAD3  23.53 
 
 		 669 aa  53.9  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0466  helicase c2  23 
 
 		 669 aa  53.9  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0534  helicase c2  22.79 
 
 		 669 aa  53.1  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1453  helicase c2  22.86 
 
 		 669 aa  53.5  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1467  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  25.36 
 
 		 934 aa  53.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533097  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  30 
 
 		 753 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  21.66 
 
 		 798 aa  53.1  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  24.8 
 
 		 785 aa  53.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2465  helicase c2  23.08 
 
 		 806 aa  52.8  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  25 
 
 		 934 aa  52.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  23.17 
 
 		 772 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  25 
 
 		 934 aa  52.8  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  23.4 
 
 		 726 aa  52.4  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  23.34 
 
 		 790 aa  52  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  29.69 
 
 		 801 aa  51.6  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  27.37 
 
 		 773 aa  51.6  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  26.72 
 
 		 750 aa  51.6  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1598  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  24.86 
 
 		 934 aa  51.6  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00523268  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  24.86 
 
 		 934 aa  51.6  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1180  hypothetical protein  25.23 
 
 		 754 aa  51.2  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.749053  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0134  DEAD_2 domain-containing protein  24.35 
 
 		 537 aa  50.8  0.00009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00117441 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1536  DEAD_2 domain protein  21.92 
 
 		 537 aa  50.4  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.849616  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3766  helicase c2  24.66 
 
 		 806 aa  50.8  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4486  helicase c2  33.05 
 
 		 714 aa  49.7  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  20.65 
 
 		 797 aa  48.9  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  28.57 
 
 		 757 aa  49.3  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  23.02 
 
 		 756 aa  48.9  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2428  helicase c2  25.85 
 
 		 855 aa  48.5  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376304  normal  0.732574 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  24.18 
 
 		 773 aa  48.5  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  29.29 
 
 		 766 aa  48.5  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1416  helicase c2  25.85 
 
 		 855 aa  48.5  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  38.1 
 
 		 762 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  29.29 
 
 		 766 aa  48.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  29.29 
 
 		 766 aa  48.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  38.1 
 
 		 753 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2515  helicase c2  29.03 
 
 		 917 aa  48.1  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  25.35 
 
 		 745 aa  47.8  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  34.57 
 
 		 766 aa  47.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  25.94 
 
 		 773 aa  47.4  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>