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for query gene Mhun_2440 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2440  PKD  100 
 
 
1042 aa  2097    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120372  normal  0.562563 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  34.92 
 
 
996 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  43.28 
 
 
1231 aa  221  6e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  41.54 
 
 
941 aa  204  7e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1578  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  38.46 
 
 
448 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.486208  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2751  cell surface protein  34.08 
 
 
728 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.270179  hitchhiker  0.0050065 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  36.47 
 
 
1092 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  32.24 
 
 
713 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0834  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like  32.79 
 
 
1202 aa  155  4e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00874286  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  33.99 
 
 
960 aa  154  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  33.06 
 
 
769 aa  153  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0597  hypothetical protein  32.2 
 
 
815 aa  152  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  34.23 
 
 
865 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  29.24 
 
 
560 aa  147  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  35.65 
 
 
1001 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1019  hypothetical protein  39.88 
 
 
218 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.298297 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  30.89 
 
 
1361 aa  140  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  34.98 
 
 
938 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  35.74 
 
 
669 aa  138  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  38.03 
 
 
675 aa  132  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0430  hypothetical protein  34.94 
 
 
403 aa  125  5e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122087  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  42.22 
 
 
581 aa  124  8e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1203  beta-Ig-H3/fasciclin  34.55 
 
 
778 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0966614  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  32.48 
 
 
1292 aa  119  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1944  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.93 
 
 
638 aa  114  8.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1948  hypothetical protein  38.12 
 
 
616 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  28.43 
 
 
1279 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  27.67 
 
 
971 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  38.86 
 
 
658 aa  112  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0494  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  39.47 
 
 
171 aa  105  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  39.2 
 
 
963 aa  100  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1059  hypothetical protein  33.94 
 
 
867 aa  99.8  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.724873  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1484  hypothetical protein  28.96 
 
 
374 aa  98.6  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.481166  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0125  hypothetical protein  30.29 
 
 
379 aa  95.1  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00889143  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2479  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 
769 aa  94.7  8e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0492  hypothetical protein  33.73 
 
 
195 aa  91.7  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.652654  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  28.19 
 
 
685 aa  90.1  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2053  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.12 
 
 
777 aa  88.6  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.120624 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3047  hypothetical protein  34.73 
 
 
325 aa  87.8  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  53.01 
 
 
644 aa  87.8  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  39.17 
 
 
2000 aa  86.7  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  54.32 
 
 
840 aa  86.7  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  48.39 
 
 
1120 aa  85.1  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  48.96 
 
 
2122 aa  85.1  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  45.16 
 
 
838 aa  84.7  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  39.83 
 
 
1667 aa  84.7  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  37.78 
 
 
791 aa  84  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  40 
 
 
978 aa  84.3  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  57.81 
 
 
1094 aa  83.2  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  53.33 
 
 
930 aa  83.6  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  39.13 
 
 
1682 aa  83.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  44.9 
 
 
679 aa  83.2  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  49.4 
 
 
845 aa  82.8  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  50.53 
 
 
2554 aa  82.4  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  40.78 
 
 
1862 aa  82.4  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  57.38 
 
 
859 aa  82.4  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  40 
 
 
1969 aa  81.6  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0945  PKD  55.38 
 
 
400 aa  82  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0321652  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  49.4 
 
 
2272 aa  81.6  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  45.37 
 
 
735 aa  81.6  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  48.19 
 
 
1882 aa  81.3  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  38.84 
 
 
1361 aa  81.3  0.00000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  40.83 
 
 
3295 aa  81.3  0.00000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  45.83 
 
 
551 aa  80.9  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  47.31 
 
 
752 aa  80.9  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  43.93 
 
 
1732 aa  80.9  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  45.26 
 
 
1528 aa  80.9  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  58.62 
 
 
869 aa  80.5  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0909  PKD domain-containing protein  52.17 
 
 
517 aa  80.1  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0741281  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  44.09 
 
 
2036 aa  80.1  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  40 
 
 
1241 aa  79.7  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1456  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.96 
 
 
594 aa  80.1  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.661246  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  55.22 
 
 
1387 aa  80.1  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  32.42 
 
 
547 aa  79.7  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  46.24 
 
 
575 aa  79.7  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  31.16 
 
 
1356 aa  79.3  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  44.57 
 
 
719 aa  79.7  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  53.52 
 
 
615 aa  79.3  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  40.71 
 
 
1842 aa  79  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  45.56 
 
 
1282 aa  78.6  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  28.15 
 
 
816 aa  78.2  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  45.98 
 
 
958 aa  77.8  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  44.94 
 
 
184 aa  77.8  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  42.71 
 
 
1236 aa  77.8  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  43.81 
 
 
870 aa  76.6  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  55.74 
 
 
500 aa  77  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  41.84 
 
 
930 aa  77  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  57.14 
 
 
1931 aa  77  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  38.26 
 
 
1300 aa  76.6  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  42.31 
 
 
561 aa  76.6  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2499  PKD  60.34 
 
 
374 aa  76.3  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00083014  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1683  PKD  58.73 
 
 
211 aa  76.3  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.657327  normal 
 
 
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NC_007796  Mhun_0018  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50 
 
 
625 aa  76.6  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.470845  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  49.35 
 
 
848 aa  75.5  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  55.74 
 
 
910 aa  75.5  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
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NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  45.33 
 
 
519 aa  75.5  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  42.61 
 
 
528 aa  75.1  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal 
 
 
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NC_009712  Mboo_2419  PKD domain-containing protein  44.44 
 
 
684 aa  73.9  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
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NC_007349  Mbar_B3754  hypothetical protein  50 
 
 
1830 aa  73.9  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.301903 
 
 
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NC_007796  Mhun_0422  PKD  52.54 
 
 
929 aa  73.9  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.450296 
 
 
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