136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1946 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4779  putative DNA-binding protein  84.12 
 
 		 510 aa  788    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821414 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1946  putative DNA-binding protein  100 
 
 		 514 aa  1003    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5234  putative DNA-binding protein  64.62 
 
 		 515 aa  570  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5322  putative DNA-binding protein  64.62 
 
 		 515 aa  570  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5614  putative DNA-binding protein  64.62 
 
 		 515 aa  568  1e-160  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3289 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  61.86 
 
 		 529 aa  548  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2432  transcriptional regulator, CdaR  57.14 
 
 		 514 aa  511  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23280  hypothetical protein  53.09 
 
 		 512 aa  476  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122242  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2598  transcriptional regulator CdaR  53.44 
 
 		 511 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2798  putative DNA-binding protein  52.86 
 
 		 530 aa  429  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4880  putative transcriptional regulator, PucR family  49.12 
 
 		 522 aa  429  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1496  putative transcriptional regulator, PucR family  46.86 
 
 		 502 aa  353  4e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  35.58 
 
 		 537 aa  194  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4258  putative transcriptional regulator, PucR family  33.79 
 
 		 547 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484226  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0076  transcriptional regulator, CdaR  30.53 
 
 		 611 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.105438  normal  0.388356 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4508  putative transcriptional regulator, PucR family  31.78 
 
 		 498 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1083  putative transcriptional regulator, PucR family  31.64 
 
 		 512 aa  117  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  27.44 
 
 		 538 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  28.16 
 
 		 554 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  28.16 
 
 		 554 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  28.16 
 
 		 554 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  30.18 
 
 		 540 aa  92  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  23.06 
 
 		 410 aa  91.3  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  24.15 
 
 		 411 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  22.22 
 
 		 412 aa  76.6  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  25.42 
 
 		 525 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0087  CdaR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 383 aa  72  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3547  CdaR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 532 aa  70.5  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3098  transcriptional regulator, CdaR  28.12 
 
 		 361 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102834  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4484  putative transcriptional regulator, PucR family  29.27 
 
 		 365 aa  61.6  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.402234  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  26.54 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03650  hypothetical protein  30.39 
 
 		 435 aa  58.5  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  29.19 
 
 		 519 aa  57.8  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  50.98 
 
 		 445 aa  57.8  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5270  putative transcriptional regulator, PucR family  43.08 
 
 		 522 aa  57.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16716  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1512  transcriptional regulator CdaR  33.33 
 
 		 375 aa  57.4  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.428477  normal  0.947433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0645  transcriptional regulator, CdaR  28.75 
 
 		 383 aa  56.6  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.867737 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1023  putative transcriptional regulator, PucR family  23.62 
 
 		 518 aa  55.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0774134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2428  putative transcriptional regulator, PucR family  30.38 
 
 		 563 aa  55.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  42.17 
 
 		 514 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  30.96 
 
 		 619 aa  55.1  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  29.51 
 
 		 399 aa  53.9  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  43.48 
 
 		 486 aa  53.9  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  30.56 
 
 		 558 aa  52.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1307  transcriptional regulator, PucR family  31.25 
 
 		 491 aa  53.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2516  transcriptional regulator CdaR  41.75 
 
 		 650 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.664559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2290  transcriptional regulator, CdaR  30.95 
 
 		 403 aa  52.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0424892 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  30.06 
 
 		 645 aa  52.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5503  putative transcriptional regulator, PucR family  35 
 
 		 600 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160149 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2522  hypothetical protein  37.31 
 
 		 616 aa  52  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  34.68 
 
 		 459 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  33.33 
 
 		 454 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3916  transcriptional regulator, CdaR  28.52 
 
 		 614 aa  51.2  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.3459  normal  0.0290883 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 517 aa  51.2  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  31.1 
 
 		 535 aa  50.1  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 564 aa  49.7  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 659 aa  50.1  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5328  putative transcriptional regulator, PucR family  50 
 
 		 479 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  38.67 
 
 		 616 aa  50.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  28.87 
 
 		 665 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  31.58 
 
 		 518 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 429 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 429 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 429 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2288  PucR family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 597 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0468789 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  43.06 
 
 		 419 aa  47.8  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  34.78 
 
 		 404 aa  47.4  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09280  Fis family regulatory protein  42.37 
 
 		 411 aa  47  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.739433  normal  0.888606 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  38.96 
 
 		 562 aa  47  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  37.14 
 
 		 478 aa  47  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 552 aa  47  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  34.29 
 
 		 425 aa  47  0.0009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  29.37 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  45.45 
 
 		 502 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  32.14 
 
 		 399 aa  46.6  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0740  hypothetical protein  32.14 
 
 		 399 aa  46.6  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000706323  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  35.71 
 
 		 480 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4011  transcriptional regulator  27.18 
 
 		 406 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  45.45 
 
 		 492 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  45.45 
 
 		 492 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  35.21 
 
 		 558 aa  47  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  29.46 
 
 		 405 aa  46.6  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  35.11 
 
 		 429 aa  46.2  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  29.41 
 
 		 555 aa  46.6  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2063  transcriptional regulator, PucR family  42.42 
 
 		 561 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20553  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23270  hypothetical protein  49.15 
 
 		 430 aa  46.2  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  42.03 
 
 		 543 aa  46.2  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  35.11 
 
 		 393 aa  46.6  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  36.51 
 
 		 389 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  30.99 
 
 		 410 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  40.3 
 
 		 485 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  30.99 
 
 		 410 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4325  hypothetical protein  26.67 
 
 		 602 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0842061 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14120  transcriptional regulator, CdaR family  40.62 
 
 		 397 aa  45.8  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  30.99 
 
 		 410 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  30.99 
 
 		 410 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  30.99 
 
 		 410 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3370  putative transcriptional regulator, PucR family  38.89 
 
 		 460 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00329007  normal  0.365111 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 405 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4109  PucR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 477 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>