182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0049 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0049  cellulose-binding domain-containing protein  100 
 
 		 740 aa  1509    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1422  hypothetical protein  62.69 
 
 		 617 aa  742    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.943384  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0236  cellulose-binding domain-containing protein  36.68 
 
 		 555 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0610362 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0237  hypothetical protein  36.84 
 
 		 1006 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0211048 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2405  hypothetical protein  29.74 
 
 		 845 aa  248  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2375  hypothetical protein  29.74 
 
 		 517 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.213672  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  42.34 
 
 		 1055 aa  102  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  42.57 
 
 		 596 aa  97.4  9e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  39.39 
 
 		 669 aa  97.4  9e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  38.04 
 
 		 633 aa  96.3  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  40.2 
 
 		 681 aa  95.9  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  35.19 
 
 		 486 aa  94  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  28.05 
 
 		 773 aa  94  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  35.71 
 
 		 854 aa  92.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  40.34 
 
 		 842 aa  92  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  44.12 
 
 		 913 aa  91.3  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  41.59 
 
 		 491 aa  89.7  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  36.04 
 
 		 743 aa  89.4  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  39.67 
 
 		 590 aa  88.6  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  41.12 
 
 		 609 aa  88.2  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  38.62 
 
 		 455 aa  88.2  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  44.44 
 
 		 984 aa  87.4  9e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  42.98 
 
 		 588 aa  87  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  45.45 
 
 		 597 aa  86.3  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  41.35 
 
 		 812 aa  85.9  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  40.19 
 
 		 846 aa  84.7  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  41.35 
 
 		 469 aa  84.3  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  41.51 
 
 		 628 aa  84  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  35 
 
 		 488 aa  83.6  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  38.21 
 
 		 1128 aa  82.8  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  43.56 
 
 		 774 aa  82.8  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  38.33 
 
 		 767 aa  80.9  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  43.14 
 
 		 494 aa  80.9  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  39.25 
 
 		 499 aa  80.9  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  42.57 
 
 		 436 aa  80.5  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  34.58 
 
 		 744 aa  80.5  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  41.18 
 
 		 778 aa  79.7  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  35.58 
 
 		 746 aa  79.7  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  42.71 
 
 		 474 aa  79.7  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3301  glycoside hydrolase family 62  41.24 
 
 		 485 aa  79.7  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111017  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  40.87 
 
 		 479 aa  79.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  43.81 
 
 		 690 aa  79  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  35.11 
 
 		 605 aa  79.3  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  40.2 
 
 		 688 aa  79  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  43.81 
 
 		 854 aa  79  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  43.82 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  30 
 
 		 966 aa  78.6  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  43.33 
 
 		 979 aa  77.8  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  39.22 
 
 		 518 aa  77.8  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  49.43 
 
 		 460 aa  77.4  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  35.04 
 
 		 785 aa  76.3  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  39.78 
 
 		 448 aa  76.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  40 
 
 		 420 aa  76.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  39.22 
 
 		 489 aa  75.9  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  42.11 
 
 		 847 aa  75.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  43.33 
 
 		 423 aa  75.1  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  36.45 
 
 		 864 aa  75.1  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  36.63 
 
 		 906 aa  75.1  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  43.48 
 
 		 763 aa  74.7  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  45.45 
 
 		 775 aa  74.7  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  39.77 
 
 		 623 aa  74.3  0.000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  44.14 
 
 		 829 aa  74.3  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  39.6 
 
 		 894 aa  73.6  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  39.77 
 
 		 842 aa  73.6  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  32.47 
 
 		 963 aa  73.9  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  36.19 
 
 		 990 aa  73.6  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  40.95 
 
 		 646 aa  73.2  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  39.42 
 
 		 875 aa  72.8  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  43.16 
 
 		 366 aa  72  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  38.32 
 
 		 446 aa  72  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  41.76 
 
 		 1209 aa  72.4  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  44.83 
 
 		 1298 aa  72.4  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  46.43 
 
 		 456 aa  72.4  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  36.36 
 
 		 942 aa  72.4  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  40.22 
 
 		 437 aa  71.6  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  33.98 
 
 		 543 aa  71.6  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  35.48 
 
 		 1007 aa  71.6  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  45.35 
 
 		 422 aa  71.2  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  35.59 
 
 		 633 aa  71.2  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918543  normal  0.93944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  41.49 
 
 		 938 aa  70.9  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  38.64 
 
 		 880 aa  70.5  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  38.83 
 
 		 495 aa  70.5  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  34.95 
 
 		 525 aa  69.7  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  42.39 
 
 		 403 aa  70.1  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2245  esterase, PHB depolymerase family  39.18 
 
 		 432 aa  69.7  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.386893 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  36.54 
 
 		 794 aa  69.7  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  37.86 
 
 		 429 aa  69.3  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  33.94 
 
 		 974 aa  70.1  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  36.89 
 
 		 442 aa  68.6  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  37.5 
 
 		 611 aa  68.6  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  42.71 
 
 		 978 aa  68.6  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  33.6 
 
 		 533 aa  68.2  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  42.22 
 
 		 934 aa  67.8  0.0000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  37.04 
 
 		 620 aa  67.8  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  36.96 
 
 		 608 aa  67.4  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  36.63 
 
 		 580 aa  67.4  0.0000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  34.95 
 
 		 681 aa  67.4  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  35.24 
 
 		 376 aa  67.4  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  40.91 
 
 		 998 aa  66.2  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  34.26 
 
 		 589 aa  65.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>